Encadrements de thèses de médecine

@phdthesis{calafiore_participation_2023,
	type = {These de doctorat},
	title = {Participation des {Médecins} généralistes aux programmes de soins intégrés destinés aux personnes âgées : exemple du projet {PAERPA}},
	copyright = {Licence Etalab},
	shorttitle = {Participation des {Médecins} généralistes aux programmes de soins intégrés destinés aux personnes âgées},
	url = {https://theses.fr/2023ULILS037},
	abstract = {Contexte : Les parcours de soins intégrés (PSI) peuvent contribuer à éviter les hospitalisations inutiles et à améliorer la qualité globale des soins pour les patients âgés et fragiles. Bien que ces PSI doivent être coordonnés par les médecins généralistes (MG), le niveau d'engagement de ces derniers peut varier. Objectif : Établir le profil des médecins généralistes ayant participé ou ayant refusé de participer au projet de PSI Personnes Agées En Risque de Perte d'Autonomie (PAERPA) dans la région Valenciennois-Quercitain en France entre 2014 et 2019. Design de l'étude : Une double analyse qualitative et quantitative des médecins généralistes ayant participé au projet PAERPA. Méthode : Nous avons interrogé les médecins généralistes intéressés ou non puis comparé les profils de consultation et de prescription.Résultats : Certains médecins généralistes étaient intéressés par le PSI PAERPA, alors que d'autres y étaient opposés. Les 48 entretiens qualitatifs ont révélé quatre éléments qui ont influencé la participation au projet PAERPA : (i) la prise de conscience des enjeux de la médecine gériatrique et l'intérêt du travail collaboratif, (ii) le gain de temps, (iii) la délégation de tâches, et (iv) les avantages de la coordination. Le niveau d'intérêt pour le PSI pour les adultes âgés et fragiles a été indirectement reflété par les données sur la consultation et la prescription. Les généralistes qui ont participé à PAERPA avaient une plus grande proportion de patients âgés (plus de 70 ans) (p{\textless}0,05), un plus grand nombre de consultations par an (p{\textless}0,05) et un plus grand nombre de visites à domicile (p{\textless}0,01), par rapport aux généralistes qui ont refusé de participer. Conclusion : Le niveau d'engagement envers un PSI pourrait être accru en personnalisant la stratégie de recrutement en fonction du profil du médecin généraliste. Un accès aux données de soins premiers est nécessaire pour optimiser cette stratégie},
	urldate = {2024-03-23},
	school = {Université de Lille (2022-....)},
	author = {Calafiore, Matthieu},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	month = nov,
	year = {2023},
	keywords = {Adultes âgés fragiles, Data reuse, Frail elderly adults, General practice, Integrated care pathways, Médecine générale, Médecine générale -- Dissertation universitaire, Médecins généralistes, Médecins généralistes -- Dissertation universitaire, Médecins généralistes -- Le Quesnoy (Nord, Médecins généralistes -- Le Quesnoy (Nord ; région), Médecins généralistes -- Valenciennes (Nord, Médecins généralistes -- Valenciennes (Nord ; région), PAERPA, Paerpa, Parcours de soins coordonnés, Parcours de soins intégrés, Personne âgée fragile, Personne âgée fragile -- Dissertation universitaire, Personnes âgées -- Santé et hygiène, Personnes âgées -- Soins, Personnes âgées dépendantes, Primary care, Programmes de gestion intégrée des soins de santé, Programmes de gestion intégrée des soins de santé -- Dissertation universitaire, Régulation de l'accès aux soins spécialisés, Régulation de l'accès aux soins spécialisés -- Dissertation universitaire, Réutilisation des données, Soins de santé primaires, Soins de santé primaires -- Dissertation universitaire, Soins de santé primaires -- Le Quesnoy (Nord, Soins de santé primaires -- Le Quesnoy (Nord ; région), Soins de santé primaires -- Valenciennes (Nord, Soins de santé primaires -- Valenciennes (Nord ; région), Soins premiers, Sujet âgé, Sujet âgé -- Dissertation universitaire, Sujet âgé de 80 ans ou plus, Sujet âgé de 80 ans ou plus -- Dissertation universitaire, région)},
}

Contexte : Les parcours de soins intégrés (PSI) peuvent contribuer à éviter les hospitalisations inutiles et à améliorer la qualité globale des soins pour les patients âgés et fragiles. Bien que ces PSI doivent être coordonnés par les médecins généralistes (MG), le niveau d'engagement de ces derniers peut varier. Objectif : Établir le profil des médecins généralistes ayant participé ou ayant refusé de participer au projet de PSI Personnes Agées En Risque de Perte d'Autonomie (PAERPA) dans la région Valenciennois-Quercitain en France entre 2014 et 2019. Design de l'étude : Une double analyse qualitative et quantitative des médecins généralistes ayant participé au projet PAERPA. Méthode : Nous avons interrogé les médecins généralistes intéressés ou non puis comparé les profils de consultation et de prescription.Résultats : Certains médecins généralistes étaient intéressés par le PSI PAERPA, alors que d'autres y étaient opposés. Les 48 entretiens qualitatifs ont révélé quatre éléments qui ont influencé la participation au projet PAERPA : (i) la prise de conscience des enjeux de la médecine gériatrique et l'intérêt du travail collaboratif, (ii) le gain de temps, (iii) la délégation de tâches, et (iv) les avantages de la coordination. Le niveau d'intérêt pour le PSI pour les adultes âgés et fragiles a été indirectement reflété par les données sur la consultation et la prescription. Les généralistes qui ont participé à PAERPA avaient une plus grande proportion de patients âgés (plus de 70 ans) (p\textless0,05), un plus grand nombre de consultations par an (p\textless0,05) et un plus grand nombre de visites à domicile (p\textless0,01), par rapport aux généralistes qui ont refusé de participer. Conclusion : Le niveau d'engagement envers un PSI pourrait être accru en personnalisant la stratégie de recrutement en fonction du profil du médecin généraliste. Un accès aux données de soins premiers est nécessaire pour optimiser cette stratégie

@phdthesis{idriss_tavaze_il_2023,
	title = {Il faut sauver le temps médical : collaboration entre certificatsabsurdes.fr et des {Conseils} {Départementaux} de l’{Ordre} des {Médecins} pour limiter les demandes abusives de certificats médicaux.},
	school = {Université de Lille},
	author = {Idriss Tavaze, Modson},
	month = nov,
	year = {2023},
}

@phdthesis{lemaitre_patientes_2023,
	address = {2022-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Patientes atteintes d’un cancer du sein métastatique avec surexpression de {HER2}, en première et deuxième ligne de traitement: survie et facteurs pronostiques},
	shorttitle = {Patientes atteintes d’un cancer du sein métastatique avec surexpression de {HER2}, en première et deuxième ligne de traitement},
	url = {https://pepite-depot.univ-lille.fr/RESTREINT/Th_Medecine/2023/2023ULILM087.pdf},
	abstract = {Contexte : Le cancer du sein représente un enjeu de santé public majeur dans lequel les avancées thérapeutiques sont nombreuses, notamment dans le cadre du cancer du sein métastatique avec surexpression de HER2, qui présente des particularités notamment pronostiques. Le standard de prise en charge jusqu’au milieu de l’année 2022 a reposé sur l’association Trastuzumab – Pertuzumab – Docetaxel en première ligne, suivie du Trastuzumab Emtansine (T-DM1) en deuxième ligne, mais il existe peu de données de vie réelle concernant ces traitements, c’est pourquoi nous avons réalisé cette étude à la fois descriptive et pronostique. Matériel et Méthodes : 10,408 patientes traitées par Pertuzumab entre 2014 et 2021, ayant un code C50* (codant pour le cancer du sein) et ayant un séjour index dans une structure publique ou privée non lucrative ont été incluses dans notre étude, à partir de la base nationale du PMSI. A partir de cette base ont été extraites des données administratives, des données relatives aux comorbidités et des données de mortalité intra-hospitalière, concernant les patientes sous Pertuzumab en première ligne de traitement puis les patientes sous T-DM1 en deuxième ligne de traitement. Résultats : La survie médiane sous Pertuzumab n’était pas atteinte au moment de l’analyse, mais elle était de 61.9\% (IC95 [60.6, 63.1]) à 5 ans, et était associée négativement à un séjour en soins intensifs, des troubles hydro-électrolytiques, un statut métastatique codé dans le PMSI, une infection, le diabète, la dénutrition, les cytopénies et l’âge. La radiothérapie était au contraire un facteur protecteur. La survie médiane sous T-DM1, parmi les patientes vivantes après la première ligne, était de 2.8 ans, soit une survie à 5 ans de 36.9\% (IC95 [34.6, 39.4]). Les facteurs de risque étaient : un code pour des métastases hépatiques ou cérébro-méningées, la dénutrition et l’âge. Conclusion : Il s’agit à notre connaissance, de la plus grande cohorte de vie réelle concernant les patientes atteintes d’un cancer du sein métastatique avec surexpression de HER2 en première et deuxième ligne de traitement, et ces résultats sont cohérents avec l’ensemble des données disponibles, tant les études princeps CLEOPATRA et EMILIA que d’autres études rétrospectives.},
	language = {français},
	urldate = {2023-11-20},
	school = {Université de Lille},
	author = {Lemaître, Joséphine},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel and Cheymol, Claire},
	month = apr,
	year = {2023},
	keywords = {Cancer du sein, Cancer du sein métastatique, Gène HER-2, HER2, Pertuzumab, Programme de médicalisation des systèmes d'information, Pronostic -- Dissertation universitaire, T-DM1, Tumeurs du sein -- Dissertation universitaire, big data, facteurs pronostiques, réutilisation de données, Études de cohortes -- Dissertation universitaire},
}

Contexte : Le cancer du sein représente un enjeu de santé public majeur dans lequel les avancées thérapeutiques sont nombreuses, notamment dans le cadre du cancer du sein métastatique avec surexpression de HER2, qui présente des particularités notamment pronostiques. Le standard de prise en charge jusqu’au milieu de l’année 2022 a reposé sur l’association Trastuzumab – Pertuzumab – Docetaxel en première ligne, suivie du Trastuzumab Emtansine (T-DM1) en deuxième ligne, mais il existe peu de données de vie réelle concernant ces traitements, c’est pourquoi nous avons réalisé cette étude à la fois descriptive et pronostique. Matériel et Méthodes : 10,408 patientes traitées par Pertuzumab entre 2014 et 2021, ayant un code C50* (codant pour le cancer du sein) et ayant un séjour index dans une structure publique ou privée non lucrative ont été incluses dans notre étude, à partir de la base nationale du PMSI. A partir de cette base ont été extraites des données administratives, des données relatives aux comorbidités et des données de mortalité intra-hospitalière, concernant les patientes sous Pertuzumab en première ligne de traitement puis les patientes sous T-DM1 en deuxième ligne de traitement. Résultats : La survie médiane sous Pertuzumab n’était pas atteinte au moment de l’analyse, mais elle était de 61.9% (IC95 [60.6, 63.1]) à 5 ans, et était associée négativement à un séjour en soins intensifs, des troubles hydro-électrolytiques, un statut métastatique codé dans le PMSI, une infection, le diabète, la dénutrition, les cytopénies et l’âge. La radiothérapie était au contraire un facteur protecteur. La survie médiane sous T-DM1, parmi les patientes vivantes après la première ligne, était de 2.8 ans, soit une survie à 5 ans de 36.9% (IC95 [34.6, 39.4]). Les facteurs de risque étaient : un code pour des métastases hépatiques ou cérébro-méningées, la dénutrition et l’âge. Conclusion : Il s’agit à notre connaissance, de la plus grande cohorte de vie réelle concernant les patientes atteintes d’un cancer du sein métastatique avec surexpression de HER2 en première et deuxième ligne de traitement, et ces résultats sont cohérents avec l’ensemble des données disponibles, tant les études princeps CLEOPATRA et EMILIA que d’autres études rétrospectives.

@phdthesis{chaillou_allegations_2023,
	address = {2022-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Allégations médicales sur les annuaires en ligne: peut-on les identifier et les diminuer ?},
	shorttitle = {Allégations médicales sur les annuaires en ligne},
	url = {https://pepite-depot.univ-lille.fr/RESTREINT/Th_Medecine/2023/2023ULILM068.pdf},
	abstract = {Introduction : il existe 400 pratiques de thérapies complémentaires (TC). Selon la DGCCRF, 40\% des Français y ont recours. Bien qu’elles soient encore scientifiquement infondées, ces TC ont déjà une place dans notre système de soin. Notre objectif est d’évaluer et de diminuer la prévalence d’informations trompeuses liées aux TC sur un annuaire médical en ligne. Matériel et Méthodes : Phase 1 : étude observationnelle. Nous avons aspiré (web scraping) et analysé des fiches de professions non-réglementées du Nord diffusées sur Doctolib. Nous avons repéré et catégorisé des termes ambigus utilisés. Phase 2 : étude interventionnelle : nous avons envoyé un courrier recommandé aux professionnels ainsi identifiés, leur demandant de modifier leur fiche. Résultats : La recherche exhaustive sur le département du Nord a identifié 208 fiches. Parmi celles-ci, 34 (16,3\%) contiennent au moins une anomalie, dont 16 de naturopathes et 16 d’hypnothérapeutes. Les anomalies sont : 17 évocations de l'hypnose médicale, 15 utilisations du concept de guérison, 5 utilisations du mot médecine, 2 utilisations de termes liées à la psychothérapie. Après intervention (courrier recommandé), on observe en intention de traiter 29 succès complets (85,3\%), 1 succès partiel (2,9\%) et 4 échecs (11,8\%). Le coût unitaire d'un succès est évalué à moins de 12 €. Conclusion : La méthode mise en place a permis d’atteindre l’objectif qui était de repérer et diminuer les allégations médicales dans les sites de présentation au public.},
	language = {français},
	urldate = {2023-11-20},
	school = {Université de Lille},
	author = {Chaillou, Anouk},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	month = apr,
	year = {2023},
	keywords = {Annuaires électroniques, Médecines alternatives, Soins de santé primaires -- Dissertation universitaire, Thérapies complémentaires -- Dissertation universitaire, Thérapies complémentaires et alternatives, soins primaires, étude interventionnelle basée sur Internet},
}

Introduction : il existe 400 pratiques de thérapies complémentaires (TC). Selon la DGCCRF, 40% des Français y ont recours. Bien qu’elles soient encore scientifiquement infondées, ces TC ont déjà une place dans notre système de soin. Notre objectif est d’évaluer et de diminuer la prévalence d’informations trompeuses liées aux TC sur un annuaire médical en ligne. Matériel et Méthodes : Phase 1 : étude observationnelle. Nous avons aspiré (web scraping) et analysé des fiches de professions non-réglementées du Nord diffusées sur Doctolib. Nous avons repéré et catégorisé des termes ambigus utilisés. Phase 2 : étude interventionnelle : nous avons envoyé un courrier recommandé aux professionnels ainsi identifiés, leur demandant de modifier leur fiche. Résultats : La recherche exhaustive sur le département du Nord a identifié 208 fiches. Parmi celles-ci, 34 (16,3%) contiennent au moins une anomalie, dont 16 de naturopathes et 16 d’hypnothérapeutes. Les anomalies sont : 17 évocations de l'hypnose médicale, 15 utilisations du concept de guérison, 5 utilisations du mot médecine, 2 utilisations de termes liées à la psychothérapie. Après intervention (courrier recommandé), on observe en intention de traiter 29 succès complets (85,3%), 1 succès partiel (2,9%) et 4 échecs (11,8%). Le coût unitaire d'un succès est évalué à moins de 12 €. Conclusion : La méthode mise en place a permis d’atteindre l’objectif qui était de repérer et diminuer les allégations médicales dans les sites de présentation au public.

@phdthesis{choteau_comment_2023,
	address = {2022-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Comment les variables statistiques devraient-elles être préparées pour bâtir des cohortes historiques en réutilisation de données},
	url = {https://pepite-depot.univ-lille.fr/RESTREINT/Th_Medecine/2023/2023ULILM045.pdf},
	abstract = {Contexte : Traditionnellement, les travaux de recherche en Santé s’appuient sur un recueil de données spécifique à l’étude. Plus récemment, ces travaux peuvent s’appuyer sur de la réutilisation de données existantes (data reuse). Ce processus suppose une transformation de données (feature extraction). Notre objectif stratégique est de standardiser ce processus. Matériel et Méthodes : Nous avons effectué une revue de la littérature incluant les cohortes historiques de sujets humains, à l’exclusion des travaux de la réutilisation des données. Après récupération des textes complets, nous avons examiné les variables analysées et leurs transformations durant l’analyse statistique. Résultats : Sur 22 articles, nous avons identifié 660 variables. Ces variables relatent différentes informations : l’âge (81.8\% des articles), le sexe (86.4\%), des maladies aiguës (50.1\%), des maladies chroniques (86.4\%), des caractéristiques de l’hôpital (18.2\%), des résultats de biologie médicale (36.4\%), des traitements médicamenteux (50\%) ou autres (72.7\%), et la mortalité (63.6\%). Elles occupent une place de variable explicative (86.4\% des variables) ou à expliquer (13.6\% des variables). En termes de nature de variable, 9.8\% des variables subissent une transformation de type : 66.2\% de ces variables passent de quantitatives à qualitatives ordonnée, 12.3\% passent de quantitatives à binaires, 3.1\% passent de qualitative ordonnée à binaire, 10.8\% passent de qualitative nominale à binaire, et 7.7\% passent de temporelle à qualitative ordonnée. En termes de dépendance au temps, 452 (68.5\%) variables temps-dépendantes deviennent temps-indépendantes durant l’analyse. Toutes les variables temps-indépendantes initialement le restent. Ce résultat est très différent entre variables explicatives et variables à expliquer. Pour les 465 variables explicatives temps-dépendantes, seulement 27 (5.9\%) le restent, tandis que 438 (94.1\%) deviennent temps-indépendantes. Parmi les variables à expliquer, 11 (17.7\%) deviennent temps-indépendantes, et 65 (82.3\%) restent temps-dépendantes. Conclusion : Dans le cadre de l'extraction de caractéristiques pour des cohortes rétrospectives par data reuse, il n'est pas obligatoire de pouvoir traiter des variables quantitatives, mais il semble nécessaire de permettre une meilleure préservation du caractère temps-dépendant des variables.},
	language = {français},
	urldate = {2023-11-20},
	school = {Université de Lille},
	author = {Choteau, Thimoté},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	month = mar,
	year = {2023},
	keywords = {Analyse par cohorte, Historic cohorts, Interprétation statistique de données -- Dissertation universitaire, Programme de médicalisation des systèmes d'information, data reuse, extractions de caractéristiques, feature extraction cohortes historique, réutilisation de données, Études de cohortes -- Dissertation universitaire},
}

Contexte : Traditionnellement, les travaux de recherche en Santé s’appuient sur un recueil de données spécifique à l’étude. Plus récemment, ces travaux peuvent s’appuyer sur de la réutilisation de données existantes (data reuse). Ce processus suppose une transformation de données (feature extraction). Notre objectif stratégique est de standardiser ce processus. Matériel et Méthodes : Nous avons effectué une revue de la littérature incluant les cohortes historiques de sujets humains, à l’exclusion des travaux de la réutilisation des données. Après récupération des textes complets, nous avons examiné les variables analysées et leurs transformations durant l’analyse statistique. Résultats : Sur 22 articles, nous avons identifié 660 variables. Ces variables relatent différentes informations : l’âge (81.8% des articles), le sexe (86.4%), des maladies aiguës (50.1%), des maladies chroniques (86.4%), des caractéristiques de l’hôpital (18.2%), des résultats de biologie médicale (36.4%), des traitements médicamenteux (50%) ou autres (72.7%), et la mortalité (63.6%). Elles occupent une place de variable explicative (86.4% des variables) ou à expliquer (13.6% des variables). En termes de nature de variable, 9.8% des variables subissent une transformation de type : 66.2% de ces variables passent de quantitatives à qualitatives ordonnée, 12.3% passent de quantitatives à binaires, 3.1% passent de qualitative ordonnée à binaire, 10.8% passent de qualitative nominale à binaire, et 7.7% passent de temporelle à qualitative ordonnée. En termes de dépendance au temps, 452 (68.5%) variables temps-dépendantes deviennent temps-indépendantes durant l’analyse. Toutes les variables temps-indépendantes initialement le restent. Ce résultat est très différent entre variables explicatives et variables à expliquer. Pour les 465 variables explicatives temps-dépendantes, seulement 27 (5.9%) le restent, tandis que 438 (94.1%) deviennent temps-indépendantes. Parmi les variables à expliquer, 11 (17.7%) deviennent temps-indépendantes, et 65 (82.3%) restent temps-dépendantes. Conclusion : Dans le cadre de l'extraction de caractéristiques pour des cohortes rétrospectives par data reuse, il n'est pas obligatoire de pouvoir traiter des variables quantitatives, mais il semble nécessaire de permettre une meilleure préservation du caractère temps-dépendant des variables.

@phdthesis{nyangwile_reutilisation_2023,
	address = {2022-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Réutilisation de données en médecine générale},
	url = {https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Th_Medecine/2023/2023ULILM351.pdf},
	abstract = {Contexte : Avec l'avènement du numérique, de volumineuses données s'accumulent permettant de constituer des entrepôts de données de plus en plus importants. La réutilisation des données, et notamment celles de santé produites à l'occasion d'un épisode de soin, est décrite dans de nombreuses études. Cependant très peu décrivent les modalités de réalisation de ce travail sur des données issues de cabinets de médecine générale et aucune n'inclut des données françaises. Notre objectif est de réaliser ce procédé de transformation vers le modèle de données OMOP avec des données semblables à celles issues de cabinet de médecine générale, puis d'en réaliser une rapide analyse descriptive. Matériel et Méthode : Nous utilisons un jeu de données simulées dans le cadre du CPER Tec’Santé. Ce jeu de données décrit 15000 patients, et respecte la structure et les distributions observées dans une base de données réelle. Nous avons réalisé un processus d'ETL vers le modèle de données commun OMOP. Nous avons dans un premier temps réalisé et détaillé la cartographie syntaxique puis la cartographie sémantique avant de présenter une rapide analyse descriptive des résultats. Résultats : Grâce au modèle de données commun OMOP, les 7 jeux de données fictives ont pu être transformés dans format standardisé. Concernant le vocabulaire dans chaque base, 51\% à 100\% des terminologies disponibles ont pu être mises en correspondance avec un concept normalisé lors de la cartographie sémantique. Discussion : Ce travail montre la faisabilité du processus avec des données issues des cabinets de médecine générale français. Les résultats descriptifs illustrent le potentiel scientifique de telles données. Un tel processus doit être réalisé en équipe.},
	language = {français},
	urldate = {2024-04-27},
	school = {Université de Lille},
	author = {Nyangwile, Eole},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2023},
	keywords = {Données personnelles -- Dissertation universitaire, ETL, Exploration de données, Identité numérique, Informatique médicale -- Dissertation universitaire, Jeux de données comme sujet -- Dissertation universitaire, Médecine -- Informatique, Médecins généralistes, Médecins généralistes -- Dissertation universitaire, OMOP, Réutilisation de données, médecine générale},
}

Contexte : Avec l'avènement du numérique, de volumineuses données s'accumulent permettant de constituer des entrepôts de données de plus en plus importants. La réutilisation des données, et notamment celles de santé produites à l'occasion d'un épisode de soin, est décrite dans de nombreuses études. Cependant très peu décrivent les modalités de réalisation de ce travail sur des données issues de cabinets de médecine générale et aucune n'inclut des données françaises. Notre objectif est de réaliser ce procédé de transformation vers le modèle de données OMOP avec des données semblables à celles issues de cabinet de médecine générale, puis d'en réaliser une rapide analyse descriptive. Matériel et Méthode : Nous utilisons un jeu de données simulées dans le cadre du CPER Tec’Santé. Ce jeu de données décrit 15000 patients, et respecte la structure et les distributions observées dans une base de données réelle. Nous avons réalisé un processus d'ETL vers le modèle de données commun OMOP. Nous avons dans un premier temps réalisé et détaillé la cartographie syntaxique puis la cartographie sémantique avant de présenter une rapide analyse descriptive des résultats. Résultats : Grâce au modèle de données commun OMOP, les 7 jeux de données fictives ont pu être transformés dans format standardisé. Concernant le vocabulaire dans chaque base, 51% à 100% des terminologies disponibles ont pu être mises en correspondance avec un concept normalisé lors de la cartographie sémantique. Discussion : Ce travail montre la faisabilité du processus avec des données issues des cabinets de médecine générale français. Les résultats descriptifs illustrent le potentiel scientifique de telles données. Un tel processus doit être réalisé en équipe.

@phdthesis{leblanc_utilisation_2023,
	address = {2022-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Utilisation du thésaurus {MeSH} couplé aux mots du texte par rapport à l'utilisation des mots du texte seuls: une analyse comparative à partir de requêtes {Pubmed} issues de revues systématiques},
	shorttitle = {Utilisation du thésaurus {MeSH} couplé aux mots du texte par rapport à l'utilisation des mots du texte seuls},
	url = {https://pepite-depot.univ-lille.fr/RESTREINT/Th_Medecine/2023/2023ULILM295.pdf},
	abstract = {Contexte : Face à l'augmentation exponentielle du nombre d'articles originaux et face au besoin grandissant de réaliser efficacement des synthèses de connaissances scientifiques, il apparaît primordial d'améliorer les techniques de recherche bibliographique. L'objectif de notre étude était de mesurer l'apport du thésaurus MeSH dans les requêtes Pubmed à des fins de revues systématiques de la littérature. Matériel et Méthodes : Nous avons extrait les requêtes Pubmed de 70 revues systématiques publiées dans les journaux en recherche médicale générale les plus prestigieux. Nous avons mesuré l'apport du thésaurus MeSH en termes de sensibilité, valeur prédictive positive et F-score. Résultats : L'ajout de MeSH à une requête Pubmed apportait en moyenne 4 (6\%) articles d'intérêts supplémentaires. Dans un même temps il augmentait en moyenne le nombre d'articles à trier de 769 (24\%). Le coût moyen en termes d'items supplémentaires à trier par article récolté pour les 4 articles supplémentaires était de 192 contre 85 en moyenne pour une requête sans terme MeSH. Conclusion : Il apparaît que l'apport de sensibilité du thésaurus MeSH est relativement faible et cette augmentation entraîne une perte de valeur prédictive positive significative. Le thésaurus MeSH pourrait ne pas être adapté aux enjeux futurs des revues systématiques.},
	language = {français},
	urldate = {2024-03-23},
	school = {Université de Lille},
	author = {Leblanc, Victor},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2023},
	keywords = {MeSH, Medical Subject Headings -- Dissertation universitaire, Medline, Méthode comparative, PubMed, PubMed -- Dissertation universitaire, Recherche documentaire, Revue systématique -- Dissertation universitaire, Revues systématiques, Thésaurus, requête},
}

Contexte : Face à l'augmentation exponentielle du nombre d'articles originaux et face au besoin grandissant de réaliser efficacement des synthèses de connaissances scientifiques, il apparaît primordial d'améliorer les techniques de recherche bibliographique. L'objectif de notre étude était de mesurer l'apport du thésaurus MeSH dans les requêtes Pubmed à des fins de revues systématiques de la littérature. Matériel et Méthodes : Nous avons extrait les requêtes Pubmed de 70 revues systématiques publiées dans les journaux en recherche médicale générale les plus prestigieux. Nous avons mesuré l'apport du thésaurus MeSH en termes de sensibilité, valeur prédictive positive et F-score. Résultats : L'ajout de MeSH à une requête Pubmed apportait en moyenne 4 (6%) articles d'intérêts supplémentaires. Dans un même temps il augmentait en moyenne le nombre d'articles à trier de 769 (24%). Le coût moyen en termes d'items supplémentaires à trier par article récolté pour les 4 articles supplémentaires était de 192 contre 85 en moyenne pour une requête sans terme MeSH. Conclusion : Il apparaît que l'apport de sensibilité du thésaurus MeSH est relativement faible et cette augmentation entraîne une perte de valeur prédictive positive significative. Le thésaurus MeSH pourrait ne pas être adapté aux enjeux futurs des revues systématiques.

@phdthesis{devloies_formation_2023,
	address = {2022-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Formation médicale des ingénieurs concevant des dispositifs médicaux: conception d’un référentiel de formation avec le logiciel {Protégé}},
	shorttitle = {Formation médicale des ingénieurs concevant des dispositifs médicaux},
	url = {https://pepite-depot.univ-lille.fr/RESTREINT/Th_Medecine/2023/2023ULILM251.pdf},
	abstract = {Contexte : Les dispositifs médicaux (DM) sont omniprésents dans la pratique médicale et sont utilisés à des fins multiples : diagnostique, pronostique, thérapeutique et dans la prévention. La plupart des DM sont conçus par des ingénieurs biomédicaux dont le cursus contient peu de formation en sciences médicales. Notre objectif est de créer un référentiel de formation médicale pour les ingénieurs concevant les DM. Matériel et Méthodes : Nous avons tout d’abord réalisé une enquête qualitative. Puis, afin d’établir une liste de dispositifs médicaux pertinents à traiter, nous avons analysé les montants de remboursement de la liste des produits et prestations (LPP) et de la liste des actes techniques d’imagerie de la classification commune des actes médicaux (CCAM) établies par la sécurité sociale. Nous avons obtenu une liste de 45 catégories de DM incluant 69 DM. Pour chaque DM, nous avons imaginé une démarche inductive basée sur le programme du 2e cycle des études médicales et notre avis d’expert. Le raisonnement est le suivant : on part d’un dispositif médical. On identifie un groupe de pathologies pour lesquelles il est utilisé. Ensuite on définit les éléments de physiologie se rapportant aux pathologies citées. Pour finir, on développe les éléments anatomiques utiles aux notions de physiologie. Afin de rendre le référentiel accessible, nous avons choisi de le concevoir sous forme d’ontologie que nous avons implémentée à l’aide du logiciel Protégé. Résultats : Nous avons construit une ontologie en langage OWL comprenant un total de 69 DM, 61 pathologies, 42 notions de physiologie et 61 éléments anatomiques. Tous ces éléments sont reliés entre eux par 930 « axioms ». Elle se compose à 80\% de termes MeSH. Extraite en langage XML, l’ontologie représente 4111 lignes de codes pour une taille de 199ko. Conclusion : Nous avons élaboré un référentiel de formation médicale pour les ingénieurs sous forme d’ontologie avec le logiciel Protégé. Ne se voulant pas exhaustif, il cherche à couvrir les éléments les plus importants à traiter au regard des montants de remboursement des DM en France et permet à son utilisateur de prioriser les éléments à enseigner afin d’élaborer un plan de formation.},
	language = {français},
	urldate = {2024-03-23},
	school = {Université de Lille},
	author = {Devloies, Pierre},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2023},
	keywords = {Dispositifs médicaux, Enseignement médical, Enseignement médical -- Dissertation universitaire, Ingénieurs biomédicaux -- Formation, Médecine -- Appareils et matériel, Ontologies (informatique), Protégé, formation médicale, ingénieurs biomédicaux, Équipement et fournitures -- Dissertation universitaire},
}

Contexte : Les dispositifs médicaux (DM) sont omniprésents dans la pratique médicale et sont utilisés à des fins multiples : diagnostique, pronostique, thérapeutique et dans la prévention. La plupart des DM sont conçus par des ingénieurs biomédicaux dont le cursus contient peu de formation en sciences médicales. Notre objectif est de créer un référentiel de formation médicale pour les ingénieurs concevant les DM. Matériel et Méthodes : Nous avons tout d’abord réalisé une enquête qualitative. Puis, afin d’établir une liste de dispositifs médicaux pertinents à traiter, nous avons analysé les montants de remboursement de la liste des produits et prestations (LPP) et de la liste des actes techniques d’imagerie de la classification commune des actes médicaux (CCAM) établies par la sécurité sociale. Nous avons obtenu une liste de 45 catégories de DM incluant 69 DM. Pour chaque DM, nous avons imaginé une démarche inductive basée sur le programme du 2e cycle des études médicales et notre avis d’expert. Le raisonnement est le suivant : on part d’un dispositif médical. On identifie un groupe de pathologies pour lesquelles il est utilisé. Ensuite on définit les éléments de physiologie se rapportant aux pathologies citées. Pour finir, on développe les éléments anatomiques utiles aux notions de physiologie. Afin de rendre le référentiel accessible, nous avons choisi de le concevoir sous forme d’ontologie que nous avons implémentée à l’aide du logiciel Protégé. Résultats : Nous avons construit une ontologie en langage OWL comprenant un total de 69 DM, 61 pathologies, 42 notions de physiologie et 61 éléments anatomiques. Tous ces éléments sont reliés entre eux par 930 « axioms ». Elle se compose à 80% de termes MeSH. Extraite en langage XML, l’ontologie représente 4111 lignes de codes pour une taille de 199ko. Conclusion : Nous avons élaboré un référentiel de formation médicale pour les ingénieurs sous forme d’ontologie avec le logiciel Protégé. Ne se voulant pas exhaustif, il cherche à couvrir les éléments les plus importants à traiter au regard des montants de remboursement des DM en France et permet à son utilisateur de prioriser les éléments à enseigner afin d’élaborer un plan de formation.

@phdthesis{djebara_medecins_2022,
	address = {2022-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Les médecins généralistes peuvent-ils se fier aux interpréteurs automatisés d’{ECG} ?: revue critique de la littérature},
	shorttitle = {Les médecins généralistes peuvent-ils se fier aux interpréteurs automatisés d’{ECG} ?},
	url = {https://pepite-depot.univ-lille.fr/RESTREINT/Th_Medecine/2022/2022ULILM501.pdf},
	abstract = {Contexte : L'électrocardiographie (ECG) est largement utilisée en soins primaires, à des fins de prévention, de diagnostic positif, de diagnostic différentiel, ou de suivi d'une pathologie chronique ou d'un traitement. En France, plus du tiers des médecins généralistes (MG) utilisent un interpréteur automatisé d’ECG (ECG-CI pour ECG computerized interpreter), et font donc confiance à des modules d'IA qui ne sont pas suffisamment fiables. Pourtant, plusieurs articles scientifiques clament le contraire, mais semblent entachés de biais. Matériel et Méthodes : Nous avons sélectionné dans Medline des articles évaluant des ECG-CI, et relevé (double lecture en aveugle, puis consensus) les biais présents dans ces articles. Résultats : La requête a ramené 104 articles, dont 29 ont été inclus. 15 anomalies ou biais récurrents ont été observés, dont les plus fréquents sont : l'absence de tableau de contingence (12 articles, 41.4\%), l'absence d'intervalle de confiance (10 articles, 34.5\%), l'utilisation du pourcentage de concordance observée (9 articles, 31.0\%), l'absence de mesure de validité extrinsèque (6 articles, 20.7\%), l'exclusion a posteriori des erreurs d’interprétation (5 articles, 17.2\%), un gold standard de piètre qualité (5 papers, 17.2\%), un workflow incohérent (4 articles, 13.8\%), une exclusion de sujets a posteriori (4 articles, 13.8\%), ou des critères d'inclusion et d'exclusion non documentés (3 articles, 10.3\%). Des liens d'intérêt ont été retrouvés dans 26 articles (89,7\%). Nous avons observé une corrélation positive et significative entre le score de satisfaction et le score de liens d'intérêts (r=0.38, p=0.041). Conclusion : Des bonnes pratiques d'évaluation des modules d'intelligence artificielle devraient être partagées par la communauté scientifique.},
	language = {français},
	urldate = {2023-04-29},
	school = {Université de Lille},
	author = {Djebara, Mona},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	month = dec,
	year = {2022},
	keywords = {Electrocardiographie, Intelligence artificielle -- Dissertation universitaire, Intelligence artificielle en médecine, Revue de la littérature -- Dissertation universitaire, Soins de santé primaires, Soins de santé primaires -- Dissertation universitaire, intelligence artificielle, méthode d’évaluation, Électrocardiographie, Électrocardiographie -- Dissertation universitaire},
}

Contexte : L'électrocardiographie (ECG) est largement utilisée en soins primaires, à des fins de prévention, de diagnostic positif, de diagnostic différentiel, ou de suivi d'une pathologie chronique ou d'un traitement. En France, plus du tiers des médecins généralistes (MG) utilisent un interpréteur automatisé d’ECG (ECG-CI pour ECG computerized interpreter), et font donc confiance à des modules d'IA qui ne sont pas suffisamment fiables. Pourtant, plusieurs articles scientifiques clament le contraire, mais semblent entachés de biais. Matériel et Méthodes : Nous avons sélectionné dans Medline des articles évaluant des ECG-CI, et relevé (double lecture en aveugle, puis consensus) les biais présents dans ces articles. Résultats : La requête a ramené 104 articles, dont 29 ont été inclus. 15 anomalies ou biais récurrents ont été observés, dont les plus fréquents sont : l'absence de tableau de contingence (12 articles, 41.4%), l'absence d'intervalle de confiance (10 articles, 34.5%), l'utilisation du pourcentage de concordance observée (9 articles, 31.0%), l'absence de mesure de validité extrinsèque (6 articles, 20.7%), l'exclusion a posteriori des erreurs d’interprétation (5 articles, 17.2%), un gold standard de piètre qualité (5 papers, 17.2%), un workflow incohérent (4 articles, 13.8%), une exclusion de sujets a posteriori (4 articles, 13.8%), ou des critères d'inclusion et d'exclusion non documentés (3 articles, 10.3%). Des liens d'intérêt ont été retrouvés dans 26 articles (89,7%). Nous avons observé une corrélation positive et significative entre le score de satisfaction et le score de liens d'intérêts (r=0.38, p=0.041). Conclusion : Des bonnes pratiques d'évaluation des modules d'intelligence artificielle devraient être partagées par la communauté scientifique.

@phdthesis{lacroix_toute_2022,
	address = {2022-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {De toute évidence les femmes ne meurent pas plus de maladies cardiovasculaires que les hommes},
	url = {https://pepite-depot.univ-lille.fr/RESTREINT/Th_Medecine/2022/2022ULILM241.pdf},
	abstract = {Contexte : De nombreux articles scientifiques écrivent dans leur abstract : « les femmes meurent plus de maladies cardiovasculaires (CV) que les hommes » ce qui nous parait être une formulation trompeuse. Matériel et Méthodes : Partie 1 : nous avons réalisé une revue non systématique de la littérature sur Pubmed pour détecter et classer les formulations trompeuses. Partie 2 : nous avons utilisé des données de mortalité réelles du CepiDc (France, 2016) pour illustrer la relation entre mortalité CV et le sexe en produisant différents indicateurs. Résultats : Nous avons trouvé 25 articles scientifiques comparant dans leur abstract la mortalité CV entre hommes et femmes : 21 formulations étaient trompeuses et seulement 4 valides. En particulier, 16 articles comparaient le nombre brut de morts, sans tenir compte ni de l’âge de décès, ni des risques concurrents (ex : mortalité par cancer). L’étude d’indicateurs robustes montre que, à tout âge, les hommes meurent plus de cardiopathie ischémique que les femmes (jusqu’à 5,7 fois plus chez les jeunes adultes) : ce risque ne s’inverse jamais. Pour les pathologies cardiovasculaires toutes confondues, on retrouve le même résultat hormis chez les individus de moins de 15 ans (classe représentant seulement 0,52\% des décès) et les individus de plus de 95 ans (avec une surmortalité féminine très modérée de 4\%). Conclusion : Écrire des phrases telles que « les femmes meurent plus de maladies cardiovasculaires que les hommes » est trompeur. La répétition est une façon dont les idées fausses et insidieuses pénètrent nos connaissances, le langage comparant la mortalité devrait être plus précis dans les articles scientifiques pour diminuer le risque de confusion pour les lecteurs.},
	language = {français},
	urldate = {2023-06-01},
	school = {Université de Lille},
	author = {Lacroix, Denis-Félix},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	month = sep,
	year = {2022},
	keywords = {Cardiopathies -- Mortalité, Facteurs sexuels -- Dissertation universitaire, Ischémie myocardique -- mortalité -- Dissertation universitaire, Maladies cardiovasculaires, Maladies cardiovasculaires -- Mortalité, Maladies cardiovasculaires -- mortalité -- Dissertation universitaire, Mortalité -- Dissertation universitaire, Mortalité différentielle, Mortalité féminine, Mortalité masculine, cardiopathies ischémiques, femmes, hommes},
}

Contexte : De nombreux articles scientifiques écrivent dans leur abstract : « les femmes meurent plus de maladies cardiovasculaires (CV) que les hommes » ce qui nous parait être une formulation trompeuse. Matériel et Méthodes : Partie 1 : nous avons réalisé une revue non systématique de la littérature sur Pubmed pour détecter et classer les formulations trompeuses. Partie 2 : nous avons utilisé des données de mortalité réelles du CepiDc (France, 2016) pour illustrer la relation entre mortalité CV et le sexe en produisant différents indicateurs. Résultats : Nous avons trouvé 25 articles scientifiques comparant dans leur abstract la mortalité CV entre hommes et femmes : 21 formulations étaient trompeuses et seulement 4 valides. En particulier, 16 articles comparaient le nombre brut de morts, sans tenir compte ni de l’âge de décès, ni des risques concurrents (ex : mortalité par cancer). L’étude d’indicateurs robustes montre que, à tout âge, les hommes meurent plus de cardiopathie ischémique que les femmes (jusqu’à 5,7 fois plus chez les jeunes adultes) : ce risque ne s’inverse jamais. Pour les pathologies cardiovasculaires toutes confondues, on retrouve le même résultat hormis chez les individus de moins de 15 ans (classe représentant seulement 0,52% des décès) et les individus de plus de 95 ans (avec une surmortalité féminine très modérée de 4%). Conclusion : Écrire des phrases telles que « les femmes meurent plus de maladies cardiovasculaires que les hommes » est trompeur. La répétition est une façon dont les idées fausses et insidieuses pénètrent nos connaissances, le langage comparant la mortalité devrait être plus précis dans les articles scientifiques pour diminuer le risque de confusion pour les lecteurs.

@phdthesis{gerard_hyperkaliemies_2022,
	address = {2022-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Hyperkaliémies au cours d’un séjour à l’hôpital: travaux exploratoires préalables à leur prévention par intelligence artificielle},
	shorttitle = {Hyperkaliémies au cours d’un séjour à l’hôpital},
	url = {https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Th_Pharma/2022/2022ULILE098.pdf},
	abstract = {L'hyperkaliémie est associée à une augmentation importante du taux de mortalité. Les données collectées au cours des séjours hospitaliers constituent une base de données de santé et peuvent être utilisées pour analyser les évènements indésirables médicamenteux de façon rétrospective par des méthodes de data-mining dans le but de définir des règles d’alerte pour prévenir ces évènements. Les données de 15042 séjours hospitaliers ont été simulées. Des caractéristiques potentiellement associées avec une hyperkaliémie ont été recherchées et identifiées dans les séjours à partir des résultats de biologie, des codes ATC des médicaments, de la classification CIM-10 des diagnostics et des codes actes de la CCAM. Les caractéristiques ont été regroupées dans une seule table de données où chaque séjour correspond à une ligne, et chaque colonne correspond à une variable. Ces travaux exploratoires ont permis de mettre en évidence des caractéristiques potentiellement associées à l’hyperkaliémie. L’utilisation d’un arbre de décision a également permis de calculer la probabilité d’apparition des évènements. Ces règles issues de réutilisation des données de santé et des pratiques médicales permettraient d’augmenter la pertinence des alertes générées par les CDSS. Cependant, ces travaux doivent être confirmés sur des données réelles.},
	language = {français},
	urldate = {2023-04-29},
	school = {Université de Lille},
	author = {Gérard, Erwin},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	month = jul,
	year = {2022},
	keywords = {Gestion du risque, Hospitalisés, Hyperkaliémie, Hyperkaliémie -- prévention et contrôle -- Dissertation universitaire, Intelligence artificielle en médecine, Prise de décision, Troubles du métabolisme du potassium, intelligence artificielle, évènements indésirables médicamenteux},
}

L'hyperkaliémie est associée à une augmentation importante du taux de mortalité. Les données collectées au cours des séjours hospitaliers constituent une base de données de santé et peuvent être utilisées pour analyser les évènements indésirables médicamenteux de façon rétrospective par des méthodes de data-mining dans le but de définir des règles d’alerte pour prévenir ces évènements. Les données de 15042 séjours hospitaliers ont été simulées. Des caractéristiques potentiellement associées avec une hyperkaliémie ont été recherchées et identifiées dans les séjours à partir des résultats de biologie, des codes ATC des médicaments, de la classification CIM-10 des diagnostics et des codes actes de la CCAM. Les caractéristiques ont été regroupées dans une seule table de données où chaque séjour correspond à une ligne, et chaque colonne correspond à une variable. Ces travaux exploratoires ont permis de mettre en évidence des caractéristiques potentiellement associées à l’hyperkaliémie. L’utilisation d’un arbre de décision a également permis de calculer la probabilité d’apparition des évènements. Ces règles issues de réutilisation des données de santé et des pratiques médicales permettraient d’augmenter la pertinence des alertes générées par les CDSS. Cependant, ces travaux doivent être confirmés sur des données réelles.

@phdthesis{sadki_echoendoscopie_2022,
	address = {2018-2021, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Échoendoscopie oesophagienne pour cancer: comment améliorer la communication des résultats au patient et au médecin traitant ?},
	shorttitle = {Échoendoscopie oesophagienne pour cancer},
	url = {https://pepite-depot.univ-lille.fr/RESTREINT/Th_Medecine/2022/2022ULILM113.pdf},
	abstract = {Contexte : La transmission de l'information médicale entre les professionnels de santé est primordiale pour la coordination des soins et dans l'instauration d'une relation de confiance malade-médecin. La qualité de l'information médicale transmise au patient contribue à l'adhésion aux soins. L'échoendosocpie oesophagienne est indiquée dans le bilan initial du cancer oesophagien, notre objectif est d'améliorer la compréhension des résultats par le patient et d'améliorer la transmission des résultats entre les médecins. Par cette étude , nous proposons de standardiser les résultats au sein du compte rendu, en y associant une iconographie schématisant les résultats pour l'information du patient et un QR code favorisant la transmission d'information. Matériel et Méthodes : Notre étude comporte cinq étapes : la définition des critères échoendoscopiques ayant un intérêt dans la classification du cancer oesophagien, par une revue de la littérature et des avis d’experts ; la création d’un modèle de données, le schéma JSON ; la production d’un formulaire de compte rendu structuré et standardisé ; la production d’une iconographie représentant les résultats ; la génération de deux QR codes, l'un pour la transmission des données et l'autre pour l'étude des données. Résultats : Nous avons défini au sein de la littérature et après l'avis d’experts, les critères du compte-rendu d’échoendoscopie du cancer oesophagien. Nous avons développé un modèle de données en format YAML et un schéma JSON détaillant les items du jeu de données. À la suite, nous avons créé un formulaire pour les praticiens, afin qu'ils produisent un compte-rendu automatisé et standardisé associé à une représentation schématique des résultats de l'échoendoscopie destinée au patient. Les données de ce compte rendu sont ensuite mises en page au format YAML et transmises par le biais de QR codes.},
	language = {français},
	urldate = {2022-10-07},
	school = {Université de Lille},
	author = {Sadki, Rajaa},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel and Lauriot dit Prevost, Arthur},
	month = may,
	year = {2022},
	keywords = {Cancer de l'oesophage, Codes QR, Endosonographie -- Dissertation universitaire, Oesophage -- Cancer -- Diagnostic, QR code, Relations interprofessionnelles -- Dissertation universitaire, Relations interprofessionnelles dans le domaine de la santé, Relations médecin-patient, Relations médecin-patient -- Dissertation universitaire, Tumeurs de l'oesophage -- imagerie diagnostique -- Dissertation universitaire, compte-rendu, schématisation, transmission de données, Échoendographie, échoendoscopie},
}

Contexte : La transmission de l'information médicale entre les professionnels de santé est primordiale pour la coordination des soins et dans l'instauration d'une relation de confiance malade-médecin. La qualité de l'information médicale transmise au patient contribue à l'adhésion aux soins. L'échoendosocpie oesophagienne est indiquée dans le bilan initial du cancer oesophagien, notre objectif est d'améliorer la compréhension des résultats par le patient et d'améliorer la transmission des résultats entre les médecins. Par cette étude , nous proposons de standardiser les résultats au sein du compte rendu, en y associant une iconographie schématisant les résultats pour l'information du patient et un QR code favorisant la transmission d'information. Matériel et Méthodes : Notre étude comporte cinq étapes : la définition des critères échoendoscopiques ayant un intérêt dans la classification du cancer oesophagien, par une revue de la littérature et des avis d’experts ; la création d’un modèle de données, le schéma JSON ; la production d’un formulaire de compte rendu structuré et standardisé ; la production d’une iconographie représentant les résultats ; la génération de deux QR codes, l'un pour la transmission des données et l'autre pour l'étude des données. Résultats : Nous avons défini au sein de la littérature et après l'avis d’experts, les critères du compte-rendu d’échoendoscopie du cancer oesophagien. Nous avons développé un modèle de données en format YAML et un schéma JSON détaillant les items du jeu de données. À la suite, nous avons créé un formulaire pour les praticiens, afin qu'ils produisent un compte-rendu automatisé et standardisé associé à une représentation schématique des résultats de l'échoendoscopie destinée au patient. Les données de ce compte rendu sont ensuite mises en page au format YAML et transmises par le biais de QR codes.

@phdthesis{tabla_modules_2021,
	address = {2018-2021, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Modules d’intelligence artificielle au cabinet de ville: qu’en attendent les médecins généralistes français ?},
	shorttitle = {Modules d’intelligence artificielle au cabinet de ville},
	url = {https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Th_Medecine/2021/2021LILUM332.pdf},
	abstract = {Contexte : Le développement de modules d'intelligence artificielle (IA) doit s'appuyer sur les progrès techniques, mais aussi sur les besoins des utilisateurs. Notre objectif est d'identifier les critères qui rendent un hypothétique module d'IA désirable pour les médecins généralistes (MG). Matériel et Méthodes : Nous avons tiré au sort 200 médecins généralistes français, et leur avons envoyé un questionnaire papier avec enveloppe réponse prétimbrée. Résultats : La population des répondants était représentative de la population des médecins généralistes français. Les médecins généralistes attendent des modules d'IA qu'ils diagnostiquent ou éliminent une pathologie urgente pour laquelle ils ne sont pas compétents et pour laquelle des spécialistes ne sont pas disponibles. Ils demandent également une interopérabilité, une intégration automatisée des résultats dans les dossiers médicaux électroniques et un partage facilité des informations avec leurs confrères. Les médecins généralistes souhaitent que les modules d'IA leur fassent gagner du temps, simplifient certaines procédures et leur permettent de déléguer des tâches au secrétariat. Ils attendent des modules d'IA qu'ils leur permettent d'associer le patient aux soins, de le rassurer et de personnaliser les soins. Il est intéressant de noter que les médecins généralistes compteraient également sur de tels modules pour couper court aux demandes abusives, comme certains arrêts de travail ou les certificats de complaisance. En revanche, les MG rejetteraient des modules qui agiraient automatiquement à leur place, ou confirmeraient un diagnostic qu’ils savent déjà porter. Conclusion : les fabricants de dispositifs médicaux équipés d’un module d’IA devraient tenir compte des attentes des praticiens de terrain.},
	language = {français},
	urldate = {2023-11-20},
	school = {Université de Lille},
	author = {Tabla, Smaïn},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2021},
	keywords = {Intelligence artificielle, Intelligence artificielle -- Dissertation universitaire, Intelligence artificielle en médecine, Médecins généralistes -- France, Médecins généralistes -- France -- Dissertation universitaire, interpréteurs automatisés, utilisabilité},
}

Contexte : Le développement de modules d'intelligence artificielle (IA) doit s'appuyer sur les progrès techniques, mais aussi sur les besoins des utilisateurs. Notre objectif est d'identifier les critères qui rendent un hypothétique module d'IA désirable pour les médecins généralistes (MG). Matériel et Méthodes : Nous avons tiré au sort 200 médecins généralistes français, et leur avons envoyé un questionnaire papier avec enveloppe réponse prétimbrée. Résultats : La population des répondants était représentative de la population des médecins généralistes français. Les médecins généralistes attendent des modules d'IA qu'ils diagnostiquent ou éliminent une pathologie urgente pour laquelle ils ne sont pas compétents et pour laquelle des spécialistes ne sont pas disponibles. Ils demandent également une interopérabilité, une intégration automatisée des résultats dans les dossiers médicaux électroniques et un partage facilité des informations avec leurs confrères. Les médecins généralistes souhaitent que les modules d'IA leur fassent gagner du temps, simplifient certaines procédures et leur permettent de déléguer des tâches au secrétariat. Ils attendent des modules d'IA qu'ils leur permettent d'associer le patient aux soins, de le rassurer et de personnaliser les soins. Il est intéressant de noter que les médecins généralistes compteraient également sur de tels modules pour couper court aux demandes abusives, comme certains arrêts de travail ou les certificats de complaisance. En revanche, les MG rejetteraient des modules qui agiraient automatiquement à leur place, ou confirmeraient un diagnostic qu’ils savent déjà porter. Conclusion : les fabricants de dispositifs médicaux équipés d’un module d’IA devraient tenir compte des attentes des praticiens de terrain.

@phdthesis{bentegeac_docimologie_2021,
	address = {2018-2021, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Docimologie dans les formations pour les professions de santé},
	url = {https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Th_Medecine/2021/2021LILUM182.pdf},
	abstract = {Contexte : La correction optique d’épreuves de QCM sur papier nécessite l’utilisation de solutions commerciales « packagées ». Ces solutions lient entièrement : des copies imprimées par l’éditeur, immuables et non paramétrables, une machine réalisant à la fois la lecture et la correction, des algorithmes de notation imposés, un logiciel propriétaire, et une machine dont le système d’exploitation est imposé. Cette rigidité fait obstacle à l’évolution docimologique, et à la résilience en cas de panne. En outre, les solutions du marché ne proposent pas d’analyse évoluée des résultats. Notre objectif est de spécifier et produire une solution logicielle paramétrable et indépendante du matériel, et de proposer des méthodes d’analyse statistique des résultats. Matériel et Méthodes : Nous concevons, développons et évaluons une méthode de correction ne reposant pas sur une machine spécialisée et nous comparons la concordance entre cette nouvelle méthode et la machine d’origine sur un examen de PACES. Nous évaluons la capacité de la nouvelle méthode de correction à corriger des examens par modalités QCM innovantes. Nous évaluons la qualité docimologique d’un examen à l’aide de plusieurs critères quantifiables issus de la littérature. Résultats : La nouvelle méthode de correction ne reposant pas sur une machine spécialisée a une concordance parfaite avec la machine spécialisée pour l’épreuve testée (n=3255, k=1). La nouvelle méthode de correction est capable de corriger les modalités innovantes testées (QCM avec niveau de certitude, QCM à réponses très nombreuses, schéma d’anatomie) avec une concordance parfaite sauf pour la modalité par complétion de schéma anatomique. L’examen de PACES possède des critères de qualité docimologique satisfaisant selon le d-index de Findley, l’indice de discrimination, le test de Wilcoxon et l’analyse par composante principale. Conclusion : La nouvelle méthode de correction permet à la fois un coût faible de correction, une résilience complète en dissociant les étapes matérielles et logicielles, et la mise en place de nouvelles modalités d’examen.},
	language = {français},
	urldate = {2022-03-10},
	school = {Université de Lille},
	author = {Bentegeac, Raphaël},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2021},
	keywords = {Docimologie, Enseignement médical premier cycle -- Dissertation universitaire, Médecine -- Examens, QCM, Questions à choix multiple -- Dissertation universitaire, indices de discrimination, Éducation -- Évaluation},
}

Contexte : La correction optique d’épreuves de QCM sur papier nécessite l’utilisation de solutions commerciales « packagées ». Ces solutions lient entièrement : des copies imprimées par l’éditeur, immuables et non paramétrables, une machine réalisant à la fois la lecture et la correction, des algorithmes de notation imposés, un logiciel propriétaire, et une machine dont le système d’exploitation est imposé. Cette rigidité fait obstacle à l’évolution docimologique, et à la résilience en cas de panne. En outre, les solutions du marché ne proposent pas d’analyse évoluée des résultats. Notre objectif est de spécifier et produire une solution logicielle paramétrable et indépendante du matériel, et de proposer des méthodes d’analyse statistique des résultats. Matériel et Méthodes : Nous concevons, développons et évaluons une méthode de correction ne reposant pas sur une machine spécialisée et nous comparons la concordance entre cette nouvelle méthode et la machine d’origine sur un examen de PACES. Nous évaluons la capacité de la nouvelle méthode de correction à corriger des examens par modalités QCM innovantes. Nous évaluons la qualité docimologique d’un examen à l’aide de plusieurs critères quantifiables issus de la littérature. Résultats : La nouvelle méthode de correction ne reposant pas sur une machine spécialisée a une concordance parfaite avec la machine spécialisée pour l’épreuve testée (n=3255, k=1). La nouvelle méthode de correction est capable de corriger les modalités innovantes testées (QCM avec niveau de certitude, QCM à réponses très nombreuses, schéma d’anatomie) avec une concordance parfaite sauf pour la modalité par complétion de schéma anatomique. L’examen de PACES possède des critères de qualité docimologique satisfaisant selon le d-index de Findley, l’indice de discrimination, le test de Wilcoxon et l’analyse par composante principale. Conclusion : La nouvelle méthode de correction permet à la fois un coût faible de correction, une résilience complète en dissociant les étapes matérielles et logicielles, et la mise en place de nouvelles modalités d’examen.

@phdthesis{messiant_patients_2021,
	address = {2018-2021, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Patients traités pour décollement de rétine rhegmatogène en {France}: prise en charge initiale et suites – cohorte historique de 116 099 patients},
	shorttitle = {Patients traités pour décollement de rétine rhegmatogène en {France}},
	abstract = {Contexte : Le décollement de rétine (DR) rhegmatogène est la plus fréquente des urgences chirurgicales ophtalmologiques. Son traitement curatif est uniquement chirurgical. Quatre techniques chirurgicales sont utilisées : vitrectomie, indentation, vitrectomie \& indentation combinées, rétinopexie pneumatique. Cependant, il n'existe pas de données épidémiologiques récentes sur le décollement de rétine en France, ni de consensus sur la technique chirurgicale à utiliser. Matériel et méthodes : La base de données du PMSI de 2011 à 2020 a été utilisée pour réaliser une mise à jour des données épidémiologiques françaises du DR rhegmatogène, décrire la répartition des techniques chirurgicales utilisées et évaluer l'évolution à moyen terme des patients opérés à travers leurs réadmissions hospitalières. Résultats : La principale technique chirurgicale utilisée était la vitrectomie (77,6\%), suivie de l’indentation (19,5\%) puis de l’indentation combinée à la vitrectomie (1,78\%) et de la rétinopexie pneumatique (1,08\%). Le taux de récidive était estimé à 15,4\% à 3 mois, 19,5\% à 6 mois, 22,1\% à 1 an. Il était significativement augmenté après vitrectomie combinée à l’indentation, en cas d’antécédents de chirurgie de la cataracte, de procédure chirurgicale associée portant sur un implant cristallinien préexistant, de sexe masculin, d’antécédents de contusion oculaire, de myopie, d’aphakie, de réalisation de la chirurgie dans un établissement de santé réalisant moins de 350 chirurgies vitréo-rétiniennes par an ou dans un établissement de santé à but non lucratif. Il était significativement diminué lorsque les soins étaient réalisés en ambulatoire. La chirurgie de la cataracte combinée n'était pas associée à une augmentation significative du risque. Le taux de complications au décours était de 4,50\% à 3 mois, 10,8\% à 6 mois, 20,8\% à 1 an, 27,8\% à 2 ans, 34,8\% à 5 ans et 38,6\% à 10 ans. La complication la plus fréquente était l’apparition d’une cataracte après vitrectomie (35.4\%). Le taux d'endophtalmie était de 0,23\%. Conclusion : Cette étude est une mise à jour concernant la chirurgie du DR rhegmatogène en France en termes de description de la population, techniques chirurgicales et pourcentage de récidive. Elle permet aux chirurgiens d'évaluer leurs pratiques et d'informer plus précisément le patient sur les risques de complications.},
	language = {français},
	school = {Université de Lille},
	author = {Messiant, Violaine},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2021},
	keywords = {Chirurgie vitréorétinienne -- Dissertation universitaire, Décollement de la rétine -- Épidémiologie, Décollement de la rétine -- épidémiologie -- Dissertation universitaire, Décollement de rétine rhegmatogène, France, Oeil -- Chirurgie, Récidive -- Dissertation universitaire, big data, récidive, épidémiologie},
}

Contexte : Le décollement de rétine (DR) rhegmatogène est la plus fréquente des urgences chirurgicales ophtalmologiques. Son traitement curatif est uniquement chirurgical. Quatre techniques chirurgicales sont utilisées : vitrectomie, indentation, vitrectomie & indentation combinées, rétinopexie pneumatique. Cependant, il n'existe pas de données épidémiologiques récentes sur le décollement de rétine en France, ni de consensus sur la technique chirurgicale à utiliser. Matériel et méthodes : La base de données du PMSI de 2011 à 2020 a été utilisée pour réaliser une mise à jour des données épidémiologiques françaises du DR rhegmatogène, décrire la répartition des techniques chirurgicales utilisées et évaluer l'évolution à moyen terme des patients opérés à travers leurs réadmissions hospitalières. Résultats : La principale technique chirurgicale utilisée était la vitrectomie (77,6%), suivie de l’indentation (19,5%) puis de l’indentation combinée à la vitrectomie (1,78%) et de la rétinopexie pneumatique (1,08%). Le taux de récidive était estimé à 15,4% à 3 mois, 19,5% à 6 mois, 22,1% à 1 an. Il était significativement augmenté après vitrectomie combinée à l’indentation, en cas d’antécédents de chirurgie de la cataracte, de procédure chirurgicale associée portant sur un implant cristallinien préexistant, de sexe masculin, d’antécédents de contusion oculaire, de myopie, d’aphakie, de réalisation de la chirurgie dans un établissement de santé réalisant moins de 350 chirurgies vitréo-rétiniennes par an ou dans un établissement de santé à but non lucratif. Il était significativement diminué lorsque les soins étaient réalisés en ambulatoire. La chirurgie de la cataracte combinée n'était pas associée à une augmentation significative du risque. Le taux de complications au décours était de 4,50% à 3 mois, 10,8% à 6 mois, 20,8% à 1 an, 27,8% à 2 ans, 34,8% à 5 ans et 38,6% à 10 ans. La complication la plus fréquente était l’apparition d’une cataracte après vitrectomie (35.4%). Le taux d'endophtalmie était de 0,23%. Conclusion : Cette étude est une mise à jour concernant la chirurgie du DR rhegmatogène en France en termes de description de la population, techniques chirurgicales et pourcentage de récidive. Elle permet aux chirurgiens d'évaluer leurs pratiques et d'informer plus précisément le patient sur les risques de complications.

@phdthesis{fitoussi_protheses_2021,
	address = {2018-2021, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Prothèses unicompartimentales de genou et ostéotomies tibiales de valgisation: comparaison des populations et de leur suivi ; analyse de 108 007 cas},
	shorttitle = {Prothèses unicompartimentales de genou et ostéotomies tibiales de valgisation},
	url = {https://pepite-depot.univ-lille.fr/RESTREINT/Th_Medecine/2021/2021LILUM112.pdf},
	abstract = {Contexte : Sur un genu varum, avec une atteinte arthrosique n’atteignant que le compartiment fémorotibial interne, le choix du traitement chirurgical peut se porter sur une PUC ou sur une OTV. Le taux de survie de l’OTV apparait plus faible que celui de la PUC dans la littérature. Les résultats fonctionnels et la survie après reprise et arthroplastie post-OTV sont similaires de ceux après pose primaire de PTG. La révision d’une PUC en PTG est plus simple que celle d’une PTG, mais des résultats fonctionnels décevants ; d’où l’importance de poser la bonne indication. L’objectif principal de notre étude est d’estimer la survie des PUC et des OTV sans reprise chirurgicale des patients de moins de 70 ans, en France de 2011 à 2020. Cette notion sera approchée par l’étude des réhospitalisations pour PTG sur la base de données du PMSI. Les objectifs secondaires sont de décrire la population d’étude, et d’analyser facteurs de risque prédictifs d’une reprise chirurgicale. Résultats : Sur 108 007 séjours : la population est âgée en moyenne de 56 ans, avec 1,2 hommes pour une femme. Moins de 4\% des hospitalisations étaient dans le secteur ambulatoire, avec une durée médiane du séjour de 5 ans. Plus de 80\% des patients sortaient à domicile. La survie à 8 ans était significativement différente entre les deux groupes : 80\% pour les OTV et 74\% pour les PUC. En analyse multivariée, le groupe PUC est associé à un Hazard Ratio ajusté de 1.37 par rapport au groupe OTV. En analyse bivariée, le Hazard Ratio non-ajusté du groupe PUC versus OTV est de 1,3. En analyse multivariée utilisant les mêmes covariables que précédemment, le Hazard Ratio ajusté devient 1,2. Les principaux facteurs de risque de reprise pour les PUC sont : une obésité, un faible volume de pose annuel de l’établissement d’accueil, ainsi que la classe d’âge des 50-59 ans. Les principaux facteurs de risques de reprise pour les PUC sont : une obésité, une PR, une CCA, et la classe d’âge des 60-69 ans. Le sexe masculin est un facteur protecteur commun aux deux groupes. Conclusion : La survie à 8 ans des OTV semble meilleure que celle des PUC.},
	language = {français},
	urldate = {2022-03-10},
	school = {Université de Lille},
	author = {Fitoussi, Alisson},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2021},
	keywords = {OTV, Ostéotomie, Ostéotomie -- Dissertation universitaire, PTG, PUC, Prothèse de genou -- Dissertation universitaire, Prothèses de genou, Suivi de cohortes de malades, données massives, reprise chirurgicale, réutilisation de données, Évaluation de résultat (soins) -- Dissertation universitaire},
}

Contexte : Sur un genu varum, avec une atteinte arthrosique n’atteignant que le compartiment fémorotibial interne, le choix du traitement chirurgical peut se porter sur une PUC ou sur une OTV. Le taux de survie de l’OTV apparait plus faible que celui de la PUC dans la littérature. Les résultats fonctionnels et la survie après reprise et arthroplastie post-OTV sont similaires de ceux après pose primaire de PTG. La révision d’une PUC en PTG est plus simple que celle d’une PTG, mais des résultats fonctionnels décevants ; d’où l’importance de poser la bonne indication. L’objectif principal de notre étude est d’estimer la survie des PUC et des OTV sans reprise chirurgicale des patients de moins de 70 ans, en France de 2011 à 2020. Cette notion sera approchée par l’étude des réhospitalisations pour PTG sur la base de données du PMSI. Les objectifs secondaires sont de décrire la population d’étude, et d’analyser facteurs de risque prédictifs d’une reprise chirurgicale. Résultats : Sur 108 007 séjours : la population est âgée en moyenne de 56 ans, avec 1,2 hommes pour une femme. Moins de 4% des hospitalisations étaient dans le secteur ambulatoire, avec une durée médiane du séjour de 5 ans. Plus de 80% des patients sortaient à domicile. La survie à 8 ans était significativement différente entre les deux groupes : 80% pour les OTV et 74% pour les PUC. En analyse multivariée, le groupe PUC est associé à un Hazard Ratio ajusté de 1.37 par rapport au groupe OTV. En analyse bivariée, le Hazard Ratio non-ajusté du groupe PUC versus OTV est de 1,3. En analyse multivariée utilisant les mêmes covariables que précédemment, le Hazard Ratio ajusté devient 1,2. Les principaux facteurs de risque de reprise pour les PUC sont : une obésité, un faible volume de pose annuel de l’établissement d’accueil, ainsi que la classe d’âge des 50-59 ans. Les principaux facteurs de risques de reprise pour les PUC sont : une obésité, une PR, une CCA, et la classe d’âge des 60-69 ans. Le sexe masculin est un facteur protecteur commun aux deux groupes. Conclusion : La survie à 8 ans des OTV semble meilleure que celle des PUC.

@phdthesis{baudelet_ameliorer_2021,
	address = {2018-2021, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Améliorer la communication des résultats de la scintigraphie rénale au {DTPA} au patient et au médecin traitant: informations nécessaires, représentation graphique et transmission dématérialisée},
	shorttitle = {Améliorer la communication des résultats de la scintigraphie rénale au {DTPA} au patient et au médecin traitant},
	url = {https://pepite-depot.univ-lille.fr/RESTREINT/Th_Medecine/2021/2021LILUM339.pdf},
	abstract = {Contexte : L’information médicale est au centre de la prise en charge des patients. Dans le cadre de la scintigraphie rénale au DTPA dans le syndrome de jonction pyélo-urétérale de l’enfant, nous avons cherché à améliorer la compréhension du patient à l’aide d’une représentation schématique, et la transmission de cette information par QR Code. Matériel et Méthodes : Nous avons suivi 5 étapes, que sont la définition des champs nécessaires au compte-rendu pour la prise en charge médicale par revue de la littérature et avis d’experts, l’établissement d’un modèle de données, d’un modèle de compte-rendu pré-rédigé, puis l’établissement de représentations schématiques et enfin la génération de QR Code reprenant ces données. Résultats : Une revue de la littérature, de recommandations et d’avis d’experts nous a permis de mettre en évidence les champs importants nécessaire à la réalisation du compte-rendu d’imagerie (scintigraphie rénale dans de syndrome de jonction). Nous avons défini un modèle de données sous la forme d’un schéma JSON, puis nous avons proposé un exemple fictif de résultats en utilisant le format YAML. Nous avons ensuite proposé une mécanique de transformation automatisée en langage naturel, et de génération automatisée d’une iconographie sous la forme de preuves de concept. Les données ainsi obtenues au format YAML peuvent être transmises et intégrées par QR Code.},
	language = {français},
	urldate = {2022-03-10},
	school = {Université de Lille},
	author = {Baudelet, Emmanuel},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel and Lauriot dit Prevost, Arthur},
	year = {2021},
	keywords = {Acide pentétique -- Dissertation universitaire, Communication en médecine, Communication par reformulation -- méthodes -- Dissertation universitaire, DTPA, Hydronéphrose -- imagerie diagnostique -- Dissertation universitaire, Relations entre professionnels de santé et patients -- Dissertation universitaire, Relations interprofessionnelles -- Dissertation universitaire, Relations interprofessionnelles dans le domaine de la santé, Relations personnel médical-patient, Scintigraphie rénale -- méthodes -- Dissertation universitaire, Standardisation, Syndrome de la jonction pyélourétérale -- Scintigraphie, compte-rendu, schématisation, scintigraphie rénale, syndrome de jonction pyélo-urétérale, transmission de données},
}

Contexte : L’information médicale est au centre de la prise en charge des patients. Dans le cadre de la scintigraphie rénale au DTPA dans le syndrome de jonction pyélo-urétérale de l’enfant, nous avons cherché à améliorer la compréhension du patient à l’aide d’une représentation schématique, et la transmission de cette information par QR Code. Matériel et Méthodes : Nous avons suivi 5 étapes, que sont la définition des champs nécessaires au compte-rendu pour la prise en charge médicale par revue de la littérature et avis d’experts, l’établissement d’un modèle de données, d’un modèle de compte-rendu pré-rédigé, puis l’établissement de représentations schématiques et enfin la génération de QR Code reprenant ces données. Résultats : Une revue de la littérature, de recommandations et d’avis d’experts nous a permis de mettre en évidence les champs importants nécessaire à la réalisation du compte-rendu d’imagerie (scintigraphie rénale dans de syndrome de jonction). Nous avons défini un modèle de données sous la forme d’un schéma JSON, puis nous avons proposé un exemple fictif de résultats en utilisant le format YAML. Nous avons ensuite proposé une mécanique de transformation automatisée en langage naturel, et de génération automatisée d’une iconographie sous la forme de preuves de concept. Les données ainsi obtenues au format YAML peuvent être transmises et intégrées par QR Code.

@phdthesis{billiau_comptes-rendus_2021,
	address = {2018-2021, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Comptes-rendus de cystosonographie chez l’enfant présentant un reflux vésico-urétéral: standardisation et amélioration de la communication au patient et au médecin traitant},
	shorttitle = {Comptes-rendus de cystosonographie chez l’enfant présentant un reflux vésico-urétéral},
	url = {https://pepite-depot.univ-lille.fr/RESTREINT/Th_Medecine/2021/2021LILUM343.pdf},
	abstract = {Contexte : L’information médicale conditionne la prise en charge du patient, aussi bien du côté du patient que du côté des professionnels de santé. Dans le cadre de la cystosonographie de l’enfant pour la recherche d’un reflux vésico-urétéral, nous avons cherché à faciliter la compréhension de l’examen par le patient grâce à un schéma, mais aussi améliorer la transmission de l’information entre les praticiens par l’utilisation d’un QR code Matériel et Méthodes : Cinq étapes ont été suivies, nous avons définis les paramètres nécessaires au compte-rendu pour la prise en charge médicale par revue de la littérature et des recommandations; ainsi que des avis d’experts. Nous avons ensuite généré un modèle de données, d’un modèle de compte-rendu prérédigé, puis la réalisation de représentations schématiques pour enfin permettre la génération de QR code reprenant ces données. Résultats : Les paramètres importants au compte rendu d’imagerie ont été extraits de la littérature mais aussi des recommandations de sociétés savantes et de l’avis d’experts. Nous avons présenté un modèle de données au format YAML, suivi d’une description de ce modèle par un schéma JSON. Ensuite à partir de ces données au format YAML, nous avons généré de façon automatique un texte en langage naturel ainsi qu’une iconographie. Toutes ces données au format YAML peuvent finalement être transmises et intégrés facilement par QR code.},
	language = {français},
	urldate = {2022-03-10},
	school = {Université de Lille},
	author = {Billiau, Adrien},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel and Lauriot dit Prevost, Arthur},
	year = {2021},
	keywords = {Appareil urinaire -- Radiographie, Communication en médecine, Communication par reformulation -- méthodes -- Dissertation universitaire, Reflux vésico-urétéral, Reflux vésico-urétéral -- Enfant -- Dissertation universitaire, Reflux vésicourétéral -- Chez l'enfant, Relations entre professionnels de santé et patients -- Dissertation universitaire, Relations interprofessionnelles -- Dissertation universitaire, Relations interprofessionnelles dans le domaine de la santé, Relations personnel médical-patient, Voies urinaires -- imagerie diagnostique -- Dissertation universitaire, compte-rendu d’examen, cystosonographie, pédiatrie, schématisation, standardisation, transmission de l’information},
}

Contexte : L’information médicale conditionne la prise en charge du patient, aussi bien du côté du patient que du côté des professionnels de santé. Dans le cadre de la cystosonographie de l’enfant pour la recherche d’un reflux vésico-urétéral, nous avons cherché à faciliter la compréhension de l’examen par le patient grâce à un schéma, mais aussi améliorer la transmission de l’information entre les praticiens par l’utilisation d’un QR code Matériel et Méthodes : Cinq étapes ont été suivies, nous avons définis les paramètres nécessaires au compte-rendu pour la prise en charge médicale par revue de la littérature et des recommandations; ainsi que des avis d’experts. Nous avons ensuite généré un modèle de données, d’un modèle de compte-rendu prérédigé, puis la réalisation de représentations schématiques pour enfin permettre la génération de QR code reprenant ces données. Résultats : Les paramètres importants au compte rendu d’imagerie ont été extraits de la littérature mais aussi des recommandations de sociétés savantes et de l’avis d’experts. Nous avons présenté un modèle de données au format YAML, suivi d’une description de ce modèle par un schéma JSON. Ensuite à partir de ces données au format YAML, nous avons généré de façon automatique un texte en langage naturel ainsi qu’une iconographie. Toutes ces données au format YAML peuvent finalement être transmises et intégrés facilement par QR code.

@phdthesis{legleye_ameliorer_2021,
	address = {2018-2021, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Améliorer la communication au patient et au médecin traitant des résultats de l’échographie chez l’enfant présentant un obstacle à l’écoulement des urines: informations nécessaires, représentation graphique et transmission dématérialisée},
	shorttitle = {Améliorer la communication au patient et au médecin traitant des résultats de l’échographie chez l’enfant présentant un obstacle à l’écoulement des urines},
	url = {https://pepite-depot.univ-lille.fr/RESTREINT/Th_Medecine/2021/2021LILUM348.pdf},
	abstract = {Contexte : L’information joue un rôle central dans la relation médecin-patient et contribue à la participation active du patient aux soins. Nous avons donc cherché, dans le cadre de l’échographie réalisée lors d’anomalies de l’écoulement des urines chez l’enfant, à améliorer la compréhension des résultats par le patient et ses proches. Pour cela, nous souhaitons créer un compte-rendu standardisé, associé à une représentation schématique des résultats, et transmissible par QR code. Matériel et Méthodes : Notre méthodologie contient cinq étapes : définition des paramètres échographiques ayant une influence dans la prise en charge médicale par une revue de la littérature et avis d’experts ; mise en place d’un modèle de données ; production d’un formulaire de compte-rendu standardisé ; production d’une représentation schématique des résultats ; génération de QR Code pour la transmission des données. Résultats : Nous avons extrait de la littérature et après avis d’experts, les paramètres nécessaires au compte-rendu d’échographie des voies urinaires chez l’enfant. Nous avons proposé un modèle de données au format YAML ainsi qu’une description de ce modèle par un schéma JSON. À la suite, nous avons conçu un formulaire à destination des radiologues, afin de produire de façon automatisée un compte-rendu standardisé associé à une iconographie représentant les résultats de l’examen. Les données issues de l’examen sont ensuite structurées au format YAML et transmisses par QR code.},
	language = {français},
	urldate = {2022-03-10},
	school = {Université de Lille},
	author = {Legleye, Rémi},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel and Lauriot dit Prevost, Arthur},
	year = {2021},
	keywords = {Appareil urinaire -- Échographie, Communication en médecine, Communication par reformulation -- méthodes -- Dissertation universitaire, Maladies urologiques -- Enfant -- Dissertation universitaire, Relations entre professionnels de santé et patients -- Dissertation universitaire, Relations interprofessionnelles -- Dissertation universitaire, Relations interprofessionnelles dans le domaine de la santé, Relations personnel médical-patient, Uropathie obstructive, Uropathie obstructive -- Chez l'enfant, Voies urinaires -- imagerie diagnostique -- Dissertation universitaire, compte-rendu, pédiatrie, schématisation, transmission de données, Échographie -- Dissertation universitaire, échographie},
}

Contexte : L’information joue un rôle central dans la relation médecin-patient et contribue à la participation active du patient aux soins. Nous avons donc cherché, dans le cadre de l’échographie réalisée lors d’anomalies de l’écoulement des urines chez l’enfant, à améliorer la compréhension des résultats par le patient et ses proches. Pour cela, nous souhaitons créer un compte-rendu standardisé, associé à une représentation schématique des résultats, et transmissible par QR code. Matériel et Méthodes : Notre méthodologie contient cinq étapes : définition des paramètres échographiques ayant une influence dans la prise en charge médicale par une revue de la littérature et avis d’experts ; mise en place d’un modèle de données ; production d’un formulaire de compte-rendu standardisé ; production d’une représentation schématique des résultats ; génération de QR Code pour la transmission des données. Résultats : Nous avons extrait de la littérature et après avis d’experts, les paramètres nécessaires au compte-rendu d’échographie des voies urinaires chez l’enfant. Nous avons proposé un modèle de données au format YAML ainsi qu’une description de ce modèle par un schéma JSON. À la suite, nous avons conçu un formulaire à destination des radiologues, afin de produire de façon automatisée un compte-rendu standardisé associé à une iconographie représentant les résultats de l’examen. Les données issues de l’examen sont ensuite structurées au format YAML et transmisses par QR code.

@phdthesis{beyens_methylprednisolone_2020,
	address = {2018-2021, France},
	title = {La méthylprednisolone augmente-t-elle le risque hémorragique sous antivitamine {K} ?},
	abstract = {Contexte : L’administration simultanée d’AVK et de méthylprednisolone survient aussi bien dans le cadre de pathologies chroniques ou aiguës. Ces molécules sont toutes métabolisées par le cytochrome P450. Les patients sous AVK présentent un risque de complications hémorragiques lorsque l’INR dépasse les limites de l’index thérapeutique. Certaines études de la littérature retrouvent une interaction entre les AVK et la méthylprednisolone. L’objectif de cette étude est de contribuer à améliorer la sécurité de l’utilisation des AVK chez les patients également traités par méthylprednisolone. Pour atteindre cet objectif, nous avons étudié en vie réelle la survenue d’incidents d’anticoagulation par AVK et leur lien avec l’utilisation de méthylprednisolone. Matériel et Méthodes : Il s’agit d’une cohorte rétrospective observationnelle par utilisation de données collectées pour le soin de patients hospitalisés à l’hôpital de Denain (Nord de la France) entre 2007 et 2014. Etaient inclus les séjours des patients ayant au moins une administration d'AVK et une hospitalisation supérieure à deux jours. Les séjours sans aucune mesure d'INR ni aucun AVK réellement pris par les patients ont été exclus. Au total, nous avons inclus 3548 séjours parmi les 109 865. Une régression logistique multivariée a été utilisée pour analyser le risque d’INR≥5 dans notre population. Résultats : Parmi les 3548 patients inclus, l’âge médian était de 78,0 ans, 185 patients ont reçu de la méthylprednisolone dont 35 avaient un INR≥5. La variable suivante était un facteur de protection (OR ajusté et 95CI): le sexe masculin (0,71 [0,59;0,86]). Les covariables suivantes étaient des facteurs de risque: les antibiotiques systémiques (OR=1,78 [1,46;2,16]), les infections respiratoires (OR=1,53 [1,23;1,89]), la dénutrition modérée et sévère (OR=1,96 [1,40;2,74] et 3,14 [1,96;5,03] respectivement), l’insuffisance rénale avec une créatininémie {\textgreater}25 mg/L (OR=1,77 [1,24;2,53]) et l’âge≥80 ans (OR=1,3 [1,02;1,66]). Conclusion : L'administration de méthylprednisolone n'est pas associée à un risque accru d'élévation de l'INR sous AVK. Cependant, cette étude démontre la grande importance des facteurs de confusion, notamment la dénutrition sévère.},
	language = {français},
	school = {Université de Lille},
	author = {Beyens, Anaïs},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2020},
	note = {Type: Reproduction de},
	keywords = {Anticoagulants -- Dissertation universitaire, Antivitamines K, Interactions médicamenteuses, Interactions médicamenteuses -- Dissertation universitaire, Méthylprednisolone, Méthylprednisolone -- Dissertation universitaire, effets indésirables du médicament, interaction médicamenteuse, methylprednisolone, méthylprednisolone},
}

Contexte : L’administration simultanée d’AVK et de méthylprednisolone survient aussi bien dans le cadre de pathologies chroniques ou aiguës. Ces molécules sont toutes métabolisées par le cytochrome P450. Les patients sous AVK présentent un risque de complications hémorragiques lorsque l’INR dépasse les limites de l’index thérapeutique. Certaines études de la littérature retrouvent une interaction entre les AVK et la méthylprednisolone. L’objectif de cette étude est de contribuer à améliorer la sécurité de l’utilisation des AVK chez les patients également traités par méthylprednisolone. Pour atteindre cet objectif, nous avons étudié en vie réelle la survenue d’incidents d’anticoagulation par AVK et leur lien avec l’utilisation de méthylprednisolone. Matériel et Méthodes : Il s’agit d’une cohorte rétrospective observationnelle par utilisation de données collectées pour le soin de patients hospitalisés à l’hôpital de Denain (Nord de la France) entre 2007 et 2014. Etaient inclus les séjours des patients ayant au moins une administration d'AVK et une hospitalisation supérieure à deux jours. Les séjours sans aucune mesure d'INR ni aucun AVK réellement pris par les patients ont été exclus. Au total, nous avons inclus 3548 séjours parmi les 109 865. Une régression logistique multivariée a été utilisée pour analyser le risque d’INR≥5 dans notre population. Résultats : Parmi les 3548 patients inclus, l’âge médian était de 78,0 ans, 185 patients ont reçu de la méthylprednisolone dont 35 avaient un INR≥5. La variable suivante était un facteur de protection (OR ajusté et 95CI): le sexe masculin (0,71 [0,59;0,86]). Les covariables suivantes étaient des facteurs de risque: les antibiotiques systémiques (OR=1,78 [1,46;2,16]), les infections respiratoires (OR=1,53 [1,23;1,89]), la dénutrition modérée et sévère (OR=1,96 [1,40;2,74] et 3,14 [1,96;5,03] respectivement), l’insuffisance rénale avec une créatininémie \textgreater25 mg/L (OR=1,77 [1,24;2,53]) et l’âge≥80 ans (OR=1,3 [1,02;1,66]). Conclusion : L'administration de méthylprednisolone n'est pas associée à un risque accru d'élévation de l'INR sous AVK. Cependant, cette étude démontre la grande importance des facteurs de confusion, notamment la dénutrition sévère.

@phdthesis{martignene_mise_2020,
	address = {2018-2021, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Mise au point d’une interface de visualisation unifiée de données cliniques temporelles, hétérogènes, hiérarchiques},
	url = {https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Th_Medecine/2020/2020LILUM104.pdf},
	abstract = {Contexte : Le dossier patient électronique contient des données temporelles structurées (PMSI, biologie médicale, médicaments, etc.) ou non (documents, images, etc.). Leur utilisation est double : transactionnelle (un seul patient, pour le soin) ou décisionnelle (plusieurs patients, réutilisation de données). Des outils de visualisation existent mais ne couvrent pas ces deux champs, rendent mal l'aspect hiérarchique des terminologies, et décloisonnent mal les données de sources différentes. L'objectif est de concevoir un tel outil. Méthodes : Conception : nous abstrayons les types de données, puis spécifions les composants graphiques et leur mode de compactage. Développement : le prototype est développé en C++, disponible en librairie R. Évaluation : deux médecins répondent à 5 questions portant sur 24 cas cliniques réels d'insuffisance rénale aiguë, en utilisant 3 interfaces dont Heimdall. Résultats : Prototype : le temps suit l'axe horizontal, les concepts suivent l'axe vertical. Les "événements" sont représentés sous forme de triangles, les "états" de rectangles, les "mesures" de courbes (avec interpolation LOCF, linéaire ou spline). Ces composants sont embarqués dans une arborescence qui exploite notamment celle des terminologies (CIM10, CCAM, etc.), qui permet un repliement vertical, et avec fusion des composants. Une condensation temporelle est possible. En mode décisionnel, les patients peuvent être alignés sur un événement (ex : appendicectomie). Les vues par problème (ex : fonction rénale, hématologie, etc.) déploient automatiquement des composants et en compactent d'autres. Évaluation : pour charger 3500 patients (360 000 valeurs), il faut 1 seconde et 50 Mo de mémoire. L'interface Heimdall est aussi rapide à utiliser par des médecins qu'une interface filtrée, et plus qu'une interface brute. Le taux d'erreur est identique. Conclusion : Heimdall est intuitif, entièrement automatisé et interfacé avec R. Les vues par problème font gagner du temps. Actuellement, les données non-temporelles n'y trouvent pas de place, et Heimdall n'embarque pas d'outil de requête. Heimdall est open source et peut être utilisé via un paquet R (hors CRAN).},
	language = {français},
	urldate = {2022-03-10},
	school = {Université de Lille},
	author = {Martignene, Niels},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2020},
	keywords = {Data visualisation, Dossier médical personnel -- Informatique, Dossier patient électronique, Dossiers médicaux -- Informatique, Dossiers médicaux électroniques -- Dissertation universitaire, Médecine -- Informatique, Systèmes informatisés de dossiers médicaux -- Dissertation universitaire, Visualisation de données -- Dissertation universitaire, extraction de caractéristiques, timeline, visualisation de données},
}

Contexte : Le dossier patient électronique contient des données temporelles structurées (PMSI, biologie médicale, médicaments, etc.) ou non (documents, images, etc.). Leur utilisation est double : transactionnelle (un seul patient, pour le soin) ou décisionnelle (plusieurs patients, réutilisation de données). Des outils de visualisation existent mais ne couvrent pas ces deux champs, rendent mal l'aspect hiérarchique des terminologies, et décloisonnent mal les données de sources différentes. L'objectif est de concevoir un tel outil. Méthodes : Conception : nous abstrayons les types de données, puis spécifions les composants graphiques et leur mode de compactage. Développement : le prototype est développé en C++, disponible en librairie R. Évaluation : deux médecins répondent à 5 questions portant sur 24 cas cliniques réels d'insuffisance rénale aiguë, en utilisant 3 interfaces dont Heimdall. Résultats : Prototype : le temps suit l'axe horizontal, les concepts suivent l'axe vertical. Les "événements" sont représentés sous forme de triangles, les "états" de rectangles, les "mesures" de courbes (avec interpolation LOCF, linéaire ou spline). Ces composants sont embarqués dans une arborescence qui exploite notamment celle des terminologies (CIM10, CCAM, etc.), qui permet un repliement vertical, et avec fusion des composants. Une condensation temporelle est possible. En mode décisionnel, les patients peuvent être alignés sur un événement (ex : appendicectomie). Les vues par problème (ex : fonction rénale, hématologie, etc.) déploient automatiquement des composants et en compactent d'autres. Évaluation : pour charger 3500 patients (360 000 valeurs), il faut 1 seconde et 50 Mo de mémoire. L'interface Heimdall est aussi rapide à utiliser par des médecins qu'une interface filtrée, et plus qu'une interface brute. Le taux d'erreur est identique. Conclusion : Heimdall est intuitif, entièrement automatisé et interfacé avec R. Les vues par problème font gagner du temps. Actuellement, les données non-temporelles n'y trouvent pas de place, et Heimdall n'embarque pas d'outil de requête. Heimdall est open source et peut être utilisé via un paquet R (hors CRAN).

@phdthesis{lestrade_impact_2020,
	address = {2018-2021, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Impact de l’anticoagulation préventive post-mastectomie: analyse de la base nationale du {PMSI}},
	shorttitle = {Impact de l’anticoagulation préventive post-mastectomie},
	abstract = {Objectives : Breast cancer surgery is an important risk factor for thromboembolic events. Many studies have been carried out finding very moderate incidences ranging from 0 to 0.8\% over a 30-day period. Many authors question the value of preventive anticoagulation in this case. The principal objective is to study the impact of preventive anticoagulant medication in terms of readmission for bleeding or thrombosis. Material and Methods: A survey of practices during the 2008-2014 period was carried out among cancer centers in France. We reused historical medical-administrative data about inpatient stays from the PMSI database. We included all female patients who were admitted for mastectomy in France from January 1, 2008 to December 31, 2014. In readmission inpatient stays, we searched for pulmonary embolism (ICD-10 code: I26), Deep Vein Thrombosis (I80), and hemorrhagic events (T810). Results: We surveyed 16 cancer centers and we created two groups: the “restrictive anticoagulation” group and the “liberal anticoagulation” group. The descriptive analysis included 62,823 patients. Outpatient care has been used for 10,096 (16.07\%) patients. The proportion of outpatient surgical care significantly increased over time (from 5,06\% in 2008 to 29,8\% in 2014, p=0). The median length of stay was 3 days (Q1-Q3: [3; 5]). The readmission-free survival rate was 88.6\% [88.3; 88.8] at 30 days, 63.4 [63.1; 63.8] at 90 days, and 48.3 [47.9; 48.7] at one year. The 90 day follow up was done for 60492 patients. In response to the principal objective, the proportion of readmission within 90 days for thrombosis or hemorrhage, was 1.86\% in the “restrictive anticoagulation” group, and 2.17\% in the “liberal anticoagulation” group (p=0.007). Conclusion: This study observes that a restrictive anticoagulation protocol in case of partial or total mastectomy is associated with slightly fewer readmissions for hemorrhagic or thrombotic event.},
	language = {français},
	school = {Université de Lille},
	author = {Lestrade, Victor},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2020},
	keywords = {Anticoagulants, Anticoagulants -- usage thérapeutique -- Dissertation universitaire, Complications postopératoires -- prévention et contrôle -- Dissertation universitaire, Embolie et thrombose -- prévention et contrôle -- Dissertation universitaire, Mastectomie -- Complications (médecine) -- Prévention, Mastectomie -- effets indésirables -- Dissertation universitaire, Preventive anticoagulation, Programme de médicalisation des systèmes d'information, Sein -- Cancer -- Complications chirurgicales -- Prévention, Thrombose -- Prévention, Traitement anticoagulant, Tumeurs du sein -- chirurgie -- Dissertation universitaire, breast cancer, hemorrhage, mastectomy, thromboembolic event},
}

Objectives : Breast cancer surgery is an important risk factor for thromboembolic events. Many studies have been carried out finding very moderate incidences ranging from 0 to 0.8% over a 30-day period. Many authors question the value of preventive anticoagulation in this case. The principal objective is to study the impact of preventive anticoagulant medication in terms of readmission for bleeding or thrombosis. Material and Methods: A survey of practices during the 2008-2014 period was carried out among cancer centers in France. We reused historical medical-administrative data about inpatient stays from the PMSI database. We included all female patients who were admitted for mastectomy in France from January 1, 2008 to December 31, 2014. In readmission inpatient stays, we searched for pulmonary embolism (ICD-10 code: I26), Deep Vein Thrombosis (I80), and hemorrhagic events (T810). Results: We surveyed 16 cancer centers and we created two groups: the “restrictive anticoagulation” group and the “liberal anticoagulation” group. The descriptive analysis included 62,823 patients. Outpatient care has been used for 10,096 (16.07%) patients. The proportion of outpatient surgical care significantly increased over time (from 5,06% in 2008 to 29,8% in 2014, p=0). The median length of stay was 3 days (Q1-Q3: [3; 5]). The readmission-free survival rate was 88.6% [88.3; 88.8] at 30 days, 63.4 [63.1; 63.8] at 90 days, and 48.3 [47.9; 48.7] at one year. The 90 day follow up was done for 60492 patients. In response to the principal objective, the proportion of readmission within 90 days for thrombosis or hemorrhage, was 1.86% in the “restrictive anticoagulation” group, and 2.17% in the “liberal anticoagulation” group (p=0.007). Conclusion: This study observes that a restrictive anticoagulation protocol in case of partial or total mastectomy is associated with slightly fewer readmissions for hemorrhagic or thrombotic event.

@phdthesis{trencart_comptes_2020,
	address = {2018-2021, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Comptes rendus de tomodensitométrie dans la lithiase urinaire: standardisation et visualisation},
	shorttitle = {Comptes rendus de tomodensitométrie dans la lithiase urinaire},
	abstract = {Contexte : L’information médicale est au coeur de la prise en charge d’un patient. Nous avons donc –dans le cadre du résultat de scanner réalisé lors de lithiase urinaire– cherché à améliorer (1) la compréhension du résultat par le patient à l’aide d’une représentation schématique, et (2) la transmission de cette information par l’utilisation de QR Code. Matériel et Méthodes : Nous avons suivi 5 étapes, que sont la définition des champs nécessaires au compte rendu pour la prise en charge médicale par revue de la littérature et avis d’experts, l’établissement d’un modèle de données, d’un modèle de compte rendu pré rédigé, puis l’établissement de représentations schématiques et enfin la génération de QR Code reprenant ces données. Résultats : Nous avons relevé les champs importants nécessaires au compte rendu d’imagerie (en général et pour la lithiase urinaire) à partir d’une revue de la littérature, de guidelines et d’avis d’expert. Nous avons proposé un modèle de données au format YAML ainsi qu’une description de ce modèle par un schéma JSON. Nous avons ensuite proposé une mécanique de transformation automatisée en langage naturel, et de génération automatisée d’une iconographie. Les données structurées au format YAML peuvent être facilement transmises et intégrées par QR Code.},
	language = {français},
	school = {Université de Lille},
	author = {Trencart, Marie},
	collaborator = {Lauriot dit Prevost, Arthur and Chazard, Emmanuel},
	year = {2020},
	keywords = {Communication par reformulation -- méthodes -- Dissertation universitaire, Communication sur la santé -- méthodes -- Dissertation universitaire, Droit des patients à l'information, Lithiase urinaire, Lithiase urinaire -- Tomographie, Relations entre professionnels de santé et patients -- Dissertation universitaire, Relations personnel médical-patient, Rédaction de rapports, notes et comptes rendus, Scanographie, Tomodensitométrie -- Dissertation universitaire, Urolithiase -- imagerie diagnostique -- Dissertation universitaire, compte rendu, scanner abdomino-pelvien non injecté, schématisation, standardisation, transmission de données},
}

Contexte : L’information médicale est au coeur de la prise en charge d’un patient. Nous avons donc –dans le cadre du résultat de scanner réalisé lors de lithiase urinaire– cherché à améliorer (1) la compréhension du résultat par le patient à l’aide d’une représentation schématique, et (2) la transmission de cette information par l’utilisation de QR Code. Matériel et Méthodes : Nous avons suivi 5 étapes, que sont la définition des champs nécessaires au compte rendu pour la prise en charge médicale par revue de la littérature et avis d’experts, l’établissement d’un modèle de données, d’un modèle de compte rendu pré rédigé, puis l’établissement de représentations schématiques et enfin la génération de QR Code reprenant ces données. Résultats : Nous avons relevé les champs importants nécessaires au compte rendu d’imagerie (en général et pour la lithiase urinaire) à partir d’une revue de la littérature, de guidelines et d’avis d’expert. Nous avons proposé un modèle de données au format YAML ainsi qu’une description de ce modèle par un schéma JSON. Nous avons ensuite proposé une mécanique de transformation automatisée en langage naturel, et de génération automatisée d’une iconographie. Les données structurées au format YAML peuvent être facilement transmises et intégrées par QR Code.

@phdthesis{cren_association_2020,
	address = {2018-2021, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Association entre les séjours hospitaliers avec infection et la survie globale des patients traités par ipilimumab: analyse de 1585 patients du {PMSI}},
	shorttitle = {Association entre les séjours hospitaliers avec infection et la survie globale des patients traités par ipilimumab},
	url = {https://pepite-depot.univ-lille.fr/LIBRE/Th_Medecine/2020/2020LILUM548.pdf},
	abstract = {Contexte : Le microbiote intestinal joue un rôle clé dans la régulation du système immunitaire. La perturbation de la composition du microbiote intestinal par les antibiotiques pourrait affecter de manière significative l'efficacité des inhibiteurs des points de contrôle immunitaire. Dans une étude portant sur des patients traités par ipilimumab, nous avons cherché à évaluer la relation entre l'administration d'antibiotiques en milieu hospitalier et la survie globale. Matériel et Méthodes : Les patients ayant été traités par ipilimumab entre janvier 2012 et novembre 2014 ont été sélectionnés dans la base de données du Programme de Médicalisation des Systèmes d’Information (PMSI). L'exposition aux antibiotiques a été définie comme la présence d'un séjour hospitalier avec une infection bactérienne systémique documentée et survenant dans les 2 mois précédant la première cure d'ipilimumab, ou le mois suivant celle-ci. Le critère de jugement principal était la survie globale. Résultats : Nous avons étudié 43124 séjours hospitaliers impliquant 1585 patients, provenant de 97 centres en France. Tous les patients avaient reçu de l'ipilimumab en monothérapie pour un mélanome avancé. Au total, 117 des 1585 patients (7,4\%) ont reçu une antibiothérapie systémique à l'hôpital pendant la période d'exposition définie. La survie globale médiane était plus courte chez les patients infectés (6,3 mois, contre 15,4 mois chez les patients non infectés ; hazard ratio (HR) = 1,88, intervalle de confiance à 95\% [1,46 ; 2,43], p=10-6). Dans une analyse multivariée avec ajustement sur les covariables d’intérêt, la présence d’une infection était toujours associée de manière significative à une diminution de la survie globale (HR=1,68, [1,30 ; 2,18], p=10-5). Conclusion : Chez les patients traités par ipilimumab pour un mélanome avancé, l'infection et l'administration d'antibiotiques à l'hôpital à proximité de la première cure d'ipilimumab semblent être associées à une diminution du bénéfice clinique de cet inhibiteur de point de contrôle immunitaire.},
	language = {français},
	urldate = {2022-03-10},
	school = {Université de Lille},
	author = {Cren, Pierre-Yves},
	collaborator = {Bertrand, Nicolas and Chazard, Emmanuel},
	year = {2020},
	keywords = {Antibactériens -- effets indésirables -- Dissertation universitaire, Antibiothérapie -- Complications (médecine), Flore intestinale, Immunothérapie -- Dissertation universitaire, Infections bactériennes -- traitement médicamenteux -- Dissertation universitaire, Ipilimumab, Ipilimumab -- usage thérapeutique -- Dissertation universitaire, Maladies bactériennes -- Chimiothérapie -- Complications (médecine), Microbiome gastro-intestinal -- Dissertation universitaire, Mélanome, Mélanome -- Immunothérapie, Mélanome -- thérapie -- Dissertation universitaire, antibiothérapie, antibiotique, immunothérapie, infection, inhibiteur des points de contrôle immunitaire, ipilimumab, microbiote intestinal, réutilisation de données},
}

Contexte : Le microbiote intestinal joue un rôle clé dans la régulation du système immunitaire. La perturbation de la composition du microbiote intestinal par les antibiotiques pourrait affecter de manière significative l'efficacité des inhibiteurs des points de contrôle immunitaire. Dans une étude portant sur des patients traités par ipilimumab, nous avons cherché à évaluer la relation entre l'administration d'antibiotiques en milieu hospitalier et la survie globale. Matériel et Méthodes : Les patients ayant été traités par ipilimumab entre janvier 2012 et novembre 2014 ont été sélectionnés dans la base de données du Programme de Médicalisation des Systèmes d’Information (PMSI). L'exposition aux antibiotiques a été définie comme la présence d'un séjour hospitalier avec une infection bactérienne systémique documentée et survenant dans les 2 mois précédant la première cure d'ipilimumab, ou le mois suivant celle-ci. Le critère de jugement principal était la survie globale. Résultats : Nous avons étudié 43124 séjours hospitaliers impliquant 1585 patients, provenant de 97 centres en France. Tous les patients avaient reçu de l'ipilimumab en monothérapie pour un mélanome avancé. Au total, 117 des 1585 patients (7,4%) ont reçu une antibiothérapie systémique à l'hôpital pendant la période d'exposition définie. La survie globale médiane était plus courte chez les patients infectés (6,3 mois, contre 15,4 mois chez les patients non infectés ; hazard ratio (HR) = 1,88, intervalle de confiance à 95% [1,46 ; 2,43], p=10-6). Dans une analyse multivariée avec ajustement sur les covariables d’intérêt, la présence d’une infection était toujours associée de manière significative à une diminution de la survie globale (HR=1,68, [1,30 ; 2,18], p=10-5). Conclusion : Chez les patients traités par ipilimumab pour un mélanome avancé, l'infection et l'administration d'antibiotiques à l'hôpital à proximité de la première cure d'ipilimumab semblent être associées à une diminution du bénéfice clinique de cet inhibiteur de point de contrôle immunitaire.

@phdthesis{disegni_etat_2020,
	address = {Lille, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Etat des lieux en {France} de l’arthroscopie de hanche : fréquence des complications, reprises et conversions de 2008 à 2014 à propos de 3771 patients issus de la base nationale},
	shorttitle = {Etat des lieux en {France} de l’arthroscopie de hanche},
	abstract = {Contexte : L’arthroscopie de hanche est une intervention chirurgicale de plus en plus réalisée en France. Les indications sont mieux établies, mais l’évolution des patients est encore mal connue. Aussi, nous avons mené une étude rétrospective dans le but d’étudier le taux de réintervention par arthroscopies et par arthroplasties, et évaluer les complications. Matériel et Méthodes : Nous avons mené une étude de cohorte de janvier 2008 à décembre 2014 dans la population française en réutilisant la base nationale du PMSI. Nous avons inclus les séjours comportant un code d’arthroscopie de hanche et analysé les réadmissions pour arthroplastie de hanche, nouvelle arthroscopie de hanche ou complications. Résultats : Sur une période de 7 ans, 3771 patients ont été inclus. L’âge moyen était de 41 ans, Les femmes étaient significativement plus âgées. Le nombre d’acte est passé de 294 en 2008 à 716 en 2014. A 5 ans, le taux de conversion était de 16,4\%, le taux de révision était de de 8,1\%, le taux de complication était de 5,3\%. Les principaux facteurs de risque de conversion étaient: l’hospitalisation dans un établissement à but non lucratif la présence d’une coxarthrose et la présence d’une chondropathie de hanche hors coxarthrose. Les facteurs protecteurs d’une conversion étaient : les patients avec un âge entre 16 et 40 ans au moment de la première arthroscopie et l’antécédent de chirurgie de hanche. Les principaux facteurs de risque de révision étaient : la présence d’une chondropathie de hanche et la présence d’une pathologie synoviale de hanche. Le facteur de risque de complication était l’âge supérieur à 60 ans. Conclusion : Les taux de révision et de conversion en arthroplastie sont relativement faibles et le taux de morbidité est faible. Cela suggère que l’arthroscopie de hanche peut être efficace en particulier chez les sujets jeunes.},
	school = {Université de Lille},
	author = {Disegni, Elio},
	year = {2020},
}

Contexte : L’arthroscopie de hanche est une intervention chirurgicale de plus en plus réalisée en France. Les indications sont mieux établies, mais l’évolution des patients est encore mal connue. Aussi, nous avons mené une étude rétrospective dans le but d’étudier le taux de réintervention par arthroscopies et par arthroplasties, et évaluer les complications. Matériel et Méthodes : Nous avons mené une étude de cohorte de janvier 2008 à décembre 2014 dans la population française en réutilisant la base nationale du PMSI. Nous avons inclus les séjours comportant un code d’arthroscopie de hanche et analysé les réadmissions pour arthroplastie de hanche, nouvelle arthroscopie de hanche ou complications. Résultats : Sur une période de 7 ans, 3771 patients ont été inclus. L’âge moyen était de 41 ans, Les femmes étaient significativement plus âgées. Le nombre d’acte est passé de 294 en 2008 à 716 en 2014. A 5 ans, le taux de conversion était de 16,4%, le taux de révision était de de 8,1%, le taux de complication était de 5,3%. Les principaux facteurs de risque de conversion étaient: l’hospitalisation dans un établissement à but non lucratif la présence d’une coxarthrose et la présence d’une chondropathie de hanche hors coxarthrose. Les facteurs protecteurs d’une conversion étaient : les patients avec un âge entre 16 et 40 ans au moment de la première arthroscopie et l’antécédent de chirurgie de hanche. Les principaux facteurs de risque de révision étaient : la présence d’une chondropathie de hanche et la présence d’une pathologie synoviale de hanche. Le facteur de risque de complication était l’âge supérieur à 60 ans. Conclusion : Les taux de révision et de conversion en arthroplastie sont relativement faibles et le taux de morbidité est faible. Cela suggère que l’arthroscopie de hanche peut être efficace en particulier chez les sujets jeunes.

@phdthesis{bailliez_risque_2019,
	address = {2018-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Risque de cancer chez les patients atteints de sclérodermie systémique: analyse de la base nationale du {PMSI} de 2008 à 2014},
	shorttitle = {Risque de cancer chez les patients atteints de sclérodermie systémique},
	abstract = {Contexte : La sclérodermie systémique (SSc) est une maladie rare du tissu conjonctif, pouvant affecter de multiples organes. L’analyse de la littérature internationale montre une fréquence augmentée des cancers au cours de la SSc. En France, les données épidémiologiques sont éparses. L’objectif de cette étude était d’analyser les données de patients atteints de SSc en France, en se focalisant sur la survenue de cancers. Matériel et Méthodes : Il s’agit d’une cohorte historique, observationnelle, basée sur l’analyse des données du Programme de Médicalisation et d’Informatisation du Système de Santé (PMSI), entre 2008 et 2014. Les patients atteints de SSc étaient identifiés par les codes M34 de la dixième version de la Classification Internationale des Maladies (CIM-10). Trois analyses statistiques ont été réalisées : A1 décrit les données des patients hospitalisés pour un premier séjour de SSc ; A2 décrit les antécédents médicaux de ces patients trois avant ; B décrit les données obtenues après un an de suivi. Résultats : 7752 patients ont été inclus dans A1 et A2 et 5914 patients dans B. La SSc survenait en moyenne à l’âge de 59,5 ans (DS=16), chez une majorité de femmes (6185 cas, 79,8\%) avec une incidence globale de 29,9 cas/millions d’habitants/an. La fréquence globale des cancers était respectivement de 5,6\% et de 7,0\% chez les patients atteints de SSc, trois ans avant et un an après le diagnostic. Les localisations les plus fréquentes étaient respectivement, trois ans avant et un an après le diagnostic de SSc, hématologiques avec 118 cas (1,5\%) et 107 cas (1,8\%), mammaires avec 82 cas (1,1\%) et 69 cas (1,2\%), digestives avec 55 cas (0,7\%) et 62 cas (1,1\%), cutanées avec 55 cas (0,7\%) et 42 cas (0,7\%), et pulmonaires avec 25 cas (0,3\%) et 47 cas (0,8\%). Conclusion : Les cancers hématologiques, mammaires, digestifs, cutanés et pulmonaires sont les localisations les plus fréquemment retrouvées au cours de la SSc en France. Des études complémentaires avec groupe contrôle sont nécessaires afin d’établir une association statistique significative entre ces maladies.},
	language = {français},
	school = {Université de Lille},
	author = {Bailliez, Jérémy},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2019},
	keywords = {Cancer -- Facteurs de risque, Cancer -- Facteurs de risque -- Thèses et écrits académiques, Cancer -- Épidémiologie, Cancer -- Épidémiologie -- Thèses et écrits académiques, Facteurs de risque -- Dissertation universitaire, Incidence -- Dissertation universitaire, PMSI, Programme de médicalisation des systèmes d'information, Programme de médicalisation des systèmes d'information -- Thèses et écrits académiques, Sclérodermie, Sclérodermie généralisée -- Complications (médecine), Sclérodermie généralisée -- Complications -- Thèses et écrits académiques, Sclérodermie systémique -- complications -- Dissertation universitaire, Tumeurs -- épidémiologie -- Dissertation universitaire, cancers, incidence, sclérodermie systémique},
}

Contexte : La sclérodermie systémique (SSc) est une maladie rare du tissu conjonctif, pouvant affecter de multiples organes. L’analyse de la littérature internationale montre une fréquence augmentée des cancers au cours de la SSc. En France, les données épidémiologiques sont éparses. L’objectif de cette étude était d’analyser les données de patients atteints de SSc en France, en se focalisant sur la survenue de cancers. Matériel et Méthodes : Il s’agit d’une cohorte historique, observationnelle, basée sur l’analyse des données du Programme de Médicalisation et d’Informatisation du Système de Santé (PMSI), entre 2008 et 2014. Les patients atteints de SSc étaient identifiés par les codes M34 de la dixième version de la Classification Internationale des Maladies (CIM-10). Trois analyses statistiques ont été réalisées : A1 décrit les données des patients hospitalisés pour un premier séjour de SSc ; A2 décrit les antécédents médicaux de ces patients trois avant ; B décrit les données obtenues après un an de suivi. Résultats : 7752 patients ont été inclus dans A1 et A2 et 5914 patients dans B. La SSc survenait en moyenne à l’âge de 59,5 ans (DS=16), chez une majorité de femmes (6185 cas, 79,8%) avec une incidence globale de 29,9 cas/millions d’habitants/an. La fréquence globale des cancers était respectivement de 5,6% et de 7,0% chez les patients atteints de SSc, trois ans avant et un an après le diagnostic. Les localisations les plus fréquentes étaient respectivement, trois ans avant et un an après le diagnostic de SSc, hématologiques avec 118 cas (1,5%) et 107 cas (1,8%), mammaires avec 82 cas (1,1%) et 69 cas (1,2%), digestives avec 55 cas (0,7%) et 62 cas (1,1%), cutanées avec 55 cas (0,7%) et 42 cas (0,7%), et pulmonaires avec 25 cas (0,3%) et 47 cas (0,8%). Conclusion : Les cancers hématologiques, mammaires, digestifs, cutanés et pulmonaires sont les localisations les plus fréquemment retrouvées au cours de la SSc en France. Des études complémentaires avec groupe contrôle sont nécessaires afin d’établir une association statistique significative entre ces maladies.

@phdthesis{douvry_quel_2019,
	address = {Lille, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Quel est le risque de complication mécanique de prothèse totale de hanche en cas d’arthrodèse lombo-sacrée préalable ou ultérieure ?: {Analyse} de la base nationale du {PMSI} de 2008 à 2014},
	shorttitle = {Quel est le risque de complication mécanique de prothèse totale de hanche en cas d’arthrodèse lombo-sacrée préalable ou ultérieure ?},
	abstract = {Contexte : La présence d’une prothèse totale de hanche (PTH) et d’une arthrodèse vertébrale lombo-sacrée (AVLS) chez un même patient n’est pas rare en raison du « hip-spine syndrome ». L’objectif était donc d’évaluer l’impact de l’AVLS en termes de complications mécaniques de PTH. Matériel et Méthodes : Nous avons utilisé la base nationale du PMSI de 2008 à 2014 pour identifier les patients qui avaient bénéficié d’une arthroplastie totale de hanche seule (groupe PTH seule), ceux qui avaient bénéficié d’une arthroplastie totale de hanche suivie d’une AVLS (groupe PTH-AVLS) et ceux qui avaient bénéficié d’une AVLS suivie d’une arthroplastie totale de hanche (groupe AVLSPTH). Nous avons ensuite analysé ces différents groupes pour évaluer leurs risques respectifs de complication mécanique de PTH et chercher d’autres facteurs de risque de complication mécanique de PTH. Résultats : Nous avons observé un taux de complication mécanique de PTH de 3,58\% (IC95\% [2,77 ; 4,38]) à 3 mois dans le groupe AVLS-PTH contre 1,75\% (IC95\% [1,72 ; 1,78]) dans le groupe PTH seule et 1,58\% (IC95\% [0,95 ; 2,21]) dans le groupe PTH-AVLS. Nous avons observé un taux de complication mécanique de PTH de 8,58\% (IC95\% [7,10 ; 10,03]) à 3 ans dans le groupe AVLSPTH contre 4,03\% (IC95\% [3,97 ; 4,08]) dans le groupe PTH seule et 3,47\% (IC95\% [2,51 ; 4,43]) dans le groupe PTH-AVLS. Nous avons aussi observé d’autres facteurs de risque de complication mécanique de PTH tels qu’un âge inférieur à 80 ans, l’obésité, le diabète, les maladies psychiatriques, respiratoires chroniques et neurologiques motrices, la polyarthrite rhumatoïde et les indications de l’arthroplastie totale de hanche autres que la coxarthrose. Conclusion : Chez les patients susceptibles de bénéficier d’une arthroplastie totale de hanche et d’une AVLS et dans le cas où il est possible de planifier les 2 chirurgies, il semble préférable de réaliser l’arthroplastie totale de hanche avant l’AVLS.},
	school = {Université de Lille},
	author = {Douvry, Edouard},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2019},
	keywords = {Arthrodèse -- Dissertation universitaire, Arthrodèse lombaire, Arthroplastie prothétique de hanche -- Dissertation universitaire, Arthroplastie totale de hanche, PMSI, Prothèses -- Complications (médecine), Prothèses de hanche, arthrodèse vertébrale lombo-sacrée, complication mécanique de prothèse totale de hanche, prothèse totale de hanche, révision de prothèse totale de hanche},
}

Contexte : La présence d’une prothèse totale de hanche (PTH) et d’une arthrodèse vertébrale lombo-sacrée (AVLS) chez un même patient n’est pas rare en raison du « hip-spine syndrome ». L’objectif était donc d’évaluer l’impact de l’AVLS en termes de complications mécaniques de PTH. Matériel et Méthodes : Nous avons utilisé la base nationale du PMSI de 2008 à 2014 pour identifier les patients qui avaient bénéficié d’une arthroplastie totale de hanche seule (groupe PTH seule), ceux qui avaient bénéficié d’une arthroplastie totale de hanche suivie d’une AVLS (groupe PTH-AVLS) et ceux qui avaient bénéficié d’une AVLS suivie d’une arthroplastie totale de hanche (groupe AVLSPTH). Nous avons ensuite analysé ces différents groupes pour évaluer leurs risques respectifs de complication mécanique de PTH et chercher d’autres facteurs de risque de complication mécanique de PTH. Résultats : Nous avons observé un taux de complication mécanique de PTH de 3,58% (IC95% [2,77 ; 4,38]) à 3 mois dans le groupe AVLS-PTH contre 1,75% (IC95% [1,72 ; 1,78]) dans le groupe PTH seule et 1,58% (IC95% [0,95 ; 2,21]) dans le groupe PTH-AVLS. Nous avons observé un taux de complication mécanique de PTH de 8,58% (IC95% [7,10 ; 10,03]) à 3 ans dans le groupe AVLSPTH contre 4,03% (IC95% [3,97 ; 4,08]) dans le groupe PTH seule et 3,47% (IC95% [2,51 ; 4,43]) dans le groupe PTH-AVLS. Nous avons aussi observé d’autres facteurs de risque de complication mécanique de PTH tels qu’un âge inférieur à 80 ans, l’obésité, le diabète, les maladies psychiatriques, respiratoires chroniques et neurologiques motrices, la polyarthrite rhumatoïde et les indications de l’arthroplastie totale de hanche autres que la coxarthrose. Conclusion : Chez les patients susceptibles de bénéficier d’une arthroplastie totale de hanche et d’une AVLS et dans le cas où il est possible de planifier les 2 chirurgies, il semble préférable de réaliser l’arthroplastie totale de hanche avant l’AVLS.

@phdthesis{boullenger_diabetiques_2019,
	address = {Lille, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Diabétiques de type 2 suivis en médecine générale : séquences de traitements et évolution du poids et de l’{HbA1c}},
	shorttitle = {Diabétiques de type 2 suivis en médecine générale},
	abstract = {Contexte : Le diabète de type 2 est un problème de santé publique en raison de sa prévalence croissante et du coût financier important dû au taux élevé de complications. Sa prise en charge est basée sur le respect des règles hygiénodiététiques, l’introduction d’un antidiabétique oral puis lorsque l’insulino-déficience devient trop importante la mise en place d’insuline. Son suivi repose sur le contrôle de l’HbA1C, du poids et la recherche des complications. Matériel et Méthodes : Nous avons réalisé une étude de cohorte historique dans un cabinet de trois médecins généralistes de Tourcoing. Les données ont été collectées de Janvier 2006 à Mai 2018. Tous les patients ont été divisés en séquences dépendantes du temps en fonction de leurs différents traitements. La durée de suivi médian est de 3.51 ans. Résultats : Le traitement par biguanides est le plus prescrit, suivi par les inhibiteurs de la DPP4. La proportion de patient sous insuline augmente avec le temps (25,7\% à 10 ans). Les patients diabétiques ont débuté un régime à l'âge de 54,7 ans, puis un traitement par ADO à 56,6 ans et enfin l'insuline à l'âge de 62,5 ans. Le poids augmente après deux ans de stabilité sous mesures hygiéno-diététiques, est stable sous ADO, diminue sous insuline avec cependant un effet rebond à 2,5 ans. Le taux d’HbA1c augmente lentement après deux ans de légère diminution sous mesures hygiéno-diététiques, est stable sous ADO, diminue sous insuline avec cependant un effet rebond à 2,5 ans. Conclusion : Nous avons étudié le suivi du patient diabétique de type 2 en médecine générale, certains résultats sont concordants avec la littérature alors que d’autres ne le sont pas.},
	school = {Université de Lille},
	author = {Boullenger, Léna},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2019},
	keywords = {Diabète de type 2 -- thérapie -- Dissertation universitaire, Diabète non-insulinodépendant -- Thérapeutique, Diabète type 2, Diabétiques -- Santé et hygiène, HbA1c, Médecine générale -- Dissertation universitaire, Médecine générale -- France -- Tourcoing (Nord), Résultat thérapeutique -- Dissertation universitaire, Soins médicaux -- Évaluation -- France -- Tourcoing (Nord), poids, suivi},
}

Contexte : Le diabète de type 2 est un problème de santé publique en raison de sa prévalence croissante et du coût financier important dû au taux élevé de complications. Sa prise en charge est basée sur le respect des règles hygiénodiététiques, l’introduction d’un antidiabétique oral puis lorsque l’insulino-déficience devient trop importante la mise en place d’insuline. Son suivi repose sur le contrôle de l’HbA1C, du poids et la recherche des complications. Matériel et Méthodes : Nous avons réalisé une étude de cohorte historique dans un cabinet de trois médecins généralistes de Tourcoing. Les données ont été collectées de Janvier 2006 à Mai 2018. Tous les patients ont été divisés en séquences dépendantes du temps en fonction de leurs différents traitements. La durée de suivi médian est de 3.51 ans. Résultats : Le traitement par biguanides est le plus prescrit, suivi par les inhibiteurs de la DPP4. La proportion de patient sous insuline augmente avec le temps (25,7% à 10 ans). Les patients diabétiques ont débuté un régime à l'âge de 54,7 ans, puis un traitement par ADO à 56,6 ans et enfin l'insuline à l'âge de 62,5 ans. Le poids augmente après deux ans de stabilité sous mesures hygiéno-diététiques, est stable sous ADO, diminue sous insuline avec cependant un effet rebond à 2,5 ans. Le taux d’HbA1c augmente lentement après deux ans de légère diminution sous mesures hygiéno-diététiques, est stable sous ADO, diminue sous insuline avec cependant un effet rebond à 2,5 ans. Conclusion : Nous avons étudié le suivi du patient diabétique de type 2 en médecine générale, certains résultats sont concordants avec la littérature alors que d’autres ne le sont pas.

@phdthesis{deligne_interaction_2019,
	address = {2018-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Interaction entre inhibiteurs de la pompe à protons et antivitamines {K}: revue de 67 cas},
	shorttitle = {Interaction entre inhibiteurs de la pompe à protons et antivitamines {K}},
	abstract = {Contexte : Les Antivitamines K (AVK) et les Inhibiteurs de la pompe à protons (IPP) sont des médicaments couramment utilisés en médecine. Les effets indésirables et les nombreuses interactions possibles des AVK sont largement étudiés. Les études déjà réalisées concernant les interactions possibles entre AVK et IPP apportent des résultats contradictoires. L’objectif de cette étude est d’étudier l’interaction possible AVK-IPP en vie réelle, par le suivi de l’INR chez des patients hospitalisés. Matériel et Méthodes : Nous avons mené une étude épidémiologique de cohorte historique avec étude de cas par réutilisation des données du dossier médical informatisé. La cohorte incluait des patients tirés au sort parmi les patients hospitalisés pendant plus de 2 jours dans l’hôpital de Denain et traités de manière concomitante par AVK et IPP et ayant un INR 5. Nous avons recueilli dans les dossiers différents éléments dont les cofacteurs susceptibles d’interférer avec les AVK. Nous avons évalué l’imputabilité entre l’association AVK-IPP et l’élévation de l’INR. Résultats : 67 cas ont été analysés. Sur 32 patients pour lesquels l’AVK a été introduit durant le séjour, le délai médian d’apparition de l’événement est de 4 jours [3; 6]. De même, sur 35 patients pour lesquels l’IPP a été introduit durant le séjour, le délai médian est de 7 jours [5 ; 9]. Au terme de l’étude d’imputabilité, 0 séjour (0\%) avaient une imputabilité certaine, 10 séjours (14,9\%) une imputabilité probable (en l’absence de rechallenge), 57 séjours (85,1\%) une imputabilité possible (en l’absence de dechallenge ou en présence d’autres cofacteurs importants), 0 séjour (0\%) une imputabilité improbable. Conclusion : Cette étude met en évidence le lien de cause à effet possible entre l’interaction IPP-AVK et le surdosage en AVK sans pour autant pouvoir l’affirmer. Cependant, en l’absence de sur-risque statistique, et du fait de l’importance des autres facteurs d’élévation de l’INR, le risque de surdosage en AVK lié aux IPP n’est pas forcément le plus à craindre en vie réelle.},
	language = {français},
	school = {Université de Lille},
	author = {Deligne, Laura},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2019},
	keywords = {AVK, Antivitamines K, Fluindione, INR, IPP, Inhibiteur de la pompe à proton, Inhibiteurs de la pompe à protons, Inhibiteurs de la pompe à protons -- Dissertation universitaire, Interactions médicamenteuses, Interactions médicamenteuses -- Dissertation universitaire, Vitamine K -- antagonistes et inhibiteurs -- Dissertation universitaire, antivitamine K, imputabilité, interaction médicamenteuse, pharmacovigilance, surdosage, vitamine K, warfarine, ésoméprazole},
}

Contexte : Les Antivitamines K (AVK) et les Inhibiteurs de la pompe à protons (IPP) sont des médicaments couramment utilisés en médecine. Les effets indésirables et les nombreuses interactions possibles des AVK sont largement étudiés. Les études déjà réalisées concernant les interactions possibles entre AVK et IPP apportent des résultats contradictoires. L’objectif de cette étude est d’étudier l’interaction possible AVK-IPP en vie réelle, par le suivi de l’INR chez des patients hospitalisés. Matériel et Méthodes : Nous avons mené une étude épidémiologique de cohorte historique avec étude de cas par réutilisation des données du dossier médical informatisé. La cohorte incluait des patients tirés au sort parmi les patients hospitalisés pendant plus de 2 jours dans l’hôpital de Denain et traités de manière concomitante par AVK et IPP et ayant un INR 5. Nous avons recueilli dans les dossiers différents éléments dont les cofacteurs susceptibles d’interférer avec les AVK. Nous avons évalué l’imputabilité entre l’association AVK-IPP et l’élévation de l’INR. Résultats : 67 cas ont été analysés. Sur 32 patients pour lesquels l’AVK a été introduit durant le séjour, le délai médian d’apparition de l’événement est de 4 jours [3; 6]. De même, sur 35 patients pour lesquels l’IPP a été introduit durant le séjour, le délai médian est de 7 jours [5 ; 9]. Au terme de l’étude d’imputabilité, 0 séjour (0%) avaient une imputabilité certaine, 10 séjours (14,9%) une imputabilité probable (en l’absence de rechallenge), 57 séjours (85,1%) une imputabilité possible (en l’absence de dechallenge ou en présence d’autres cofacteurs importants), 0 séjour (0%) une imputabilité improbable. Conclusion : Cette étude met en évidence le lien de cause à effet possible entre l’interaction IPP-AVK et le surdosage en AVK sans pour autant pouvoir l’affirmer. Cependant, en l’absence de sur-risque statistique, et du fait de l’importance des autres facteurs d’élévation de l’INR, le risque de surdosage en AVK lié aux IPP n’est pas forcément le plus à craindre en vie réelle.

@phdthesis{le_bot_parcours_2019,
	address = {2018-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Parcours hospitalier des femmes réalisant une {IVG} en {France} entre 2008 et 2014 (caractéristiques, lieu, distance parcourue, récurrence)},
	abstract = {Contexte : Une meilleure connaissance du parcours de soin des femmes réalisant une interruption volontaire de grossesse (IVG) en France est l’un des objectifs du programme national d’action pour améliorer l’accès à l’IVG de 2015. Méthode : Nous avons mené une étude de cohorte rétrospective de 2008 à 2014 à partir de la base de données nationale hospitalière du programme de médicalisation des systèmes d’information. Nous avons inclus tous les séjours d’IVG. Puis nous avons étudié le risque de récurrence d’IVG et d’accouchement après la première IVG. Le modèle de Cox a été utilisé pour identifier les facteurs de risque de ces 2 événements. Enfin, parmi les femmes ayant eu une IVG suivie d’un accouchement pendant la période de l’étude, nous avons comparé le lieu de domicile et les lieux d’hospitalisations. Résultats : 1 273 393 IVG ont été incluses dont 47,8 \% étaient médicamenteuses. L’âge médian était de 26,5 ans. La distance médiane parcourue entre le domicile et l’hôpital est de 9,54 km pour l’IVG. La distance parcourue est plus longue pendant les mois de juillet et août. 17\% des patientes font leur IVG dans un département différent de celui de leur résidence. Après une première IVG, 18,9 \% des patientes ont fait une récurrence d’IVG à 5 ans et 22,6 \% ont accouché à 5 ans. Une admission par les urgences au premier épisode d’IVG augmente le risque de récurrence. Avoir un acte contraceptif lors de la première IVG (pose d’implant ou de dispositif intra utérin), une prise en charge dans un hôpital à but non lucratif et une IVG chirurgicale diminuent le risque de récurrence. Les facteurs qui augmentent le risque d’accouchement après une IVG sont : les difficultés sociales, l’obésité et la grande multiparité. Le risque d’accouchement est diminué en cas d’acte contraceptif lors de la première IVG. Chez les femmes ayant eu une IVG puis un accouchement, seules 41,2 \% vont dans le même hôpital pour les deux actes. Il n’y a pas de différence notable concernant la distance parcourue entre le domicile et l’hôpital pour l’IVG et l’accouchement. Conclusion : Les femmes françaises font en majorité leur IVG et leur accouchement dans des hôpitaux différents. La distance parcourue entre l’hôpital et le domicile pour les deux actes est sensiblement la même.},
	language = {français},
	school = {Université de Lille},
	author = {Le Bot, Natacha},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2019},
	keywords = {Avortement, Avortement -- Thèses et écrits académiques, Hospitalisation -- Dissertation universitaire, IVG, Interruption légale de grossesse -- Dissertation universitaire, PMSI, Parcours de soins coordonnés, Parcours de soins coordonnés -- Thèses et écrits académiques, Programme de médicalisation des systèmes d'information, Programme de médicalisation des systèmes d'information -- Thèses et écrits académiques, accouchement, distance, domicile, facteur de risque, interruption volontaire de grossesse, lieu d’hospitalisation, parcours de soin, Études de cohortes -- Dissertation universitaire},
}

Contexte : Une meilleure connaissance du parcours de soin des femmes réalisant une interruption volontaire de grossesse (IVG) en France est l’un des objectifs du programme national d’action pour améliorer l’accès à l’IVG de 2015. Méthode : Nous avons mené une étude de cohorte rétrospective de 2008 à 2014 à partir de la base de données nationale hospitalière du programme de médicalisation des systèmes d’information. Nous avons inclus tous les séjours d’IVG. Puis nous avons étudié le risque de récurrence d’IVG et d’accouchement après la première IVG. Le modèle de Cox a été utilisé pour identifier les facteurs de risque de ces 2 événements. Enfin, parmi les femmes ayant eu une IVG suivie d’un accouchement pendant la période de l’étude, nous avons comparé le lieu de domicile et les lieux d’hospitalisations. Résultats : 1 273 393 IVG ont été incluses dont 47,8 % étaient médicamenteuses. L’âge médian était de 26,5 ans. La distance médiane parcourue entre le domicile et l’hôpital est de 9,54 km pour l’IVG. La distance parcourue est plus longue pendant les mois de juillet et août. 17% des patientes font leur IVG dans un département différent de celui de leur résidence. Après une première IVG, 18,9 % des patientes ont fait une récurrence d’IVG à 5 ans et 22,6 % ont accouché à 5 ans. Une admission par les urgences au premier épisode d’IVG augmente le risque de récurrence. Avoir un acte contraceptif lors de la première IVG (pose d’implant ou de dispositif intra utérin), une prise en charge dans un hôpital à but non lucratif et une IVG chirurgicale diminuent le risque de récurrence. Les facteurs qui augmentent le risque d’accouchement après une IVG sont : les difficultés sociales, l’obésité et la grande multiparité. Le risque d’accouchement est diminué en cas d’acte contraceptif lors de la première IVG. Chez les femmes ayant eu une IVG puis un accouchement, seules 41,2 % vont dans le même hôpital pour les deux actes. Il n’y a pas de différence notable concernant la distance parcourue entre le domicile et l’hôpital pour l’IVG et l’accouchement. Conclusion : Les femmes françaises font en majorité leur IVG et leur accouchement dans des hôpitaux différents. La distance parcourue entre l’hôpital et le domicile pour les deux actes est sensiblement la même.

@phdthesis{bouchet-badel_reparations_2019,
	address = {2018-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Réparations électives d’anévrismes de l’aorte abdominale sous-rénale en {France}: comparaison des approches endovasculaires et conventionnelles : analyse de 40 273 séjours issus de la base nationale du {PMSI}},
	shorttitle = {Réparations électives d’anévrismes de l’aorte abdominale sous-rénale en {France}},
	abstract = {The aim of this work is to provide additional quantitative arguments concerning AAA endografts with comprehensive EVAR data, in order to support political decisions regarding the AAA. Context: Infra-renal abdominal aortic aneurysm (AAA) induces a high mortality rate of more than 80\% when ruptured, affecting mainly men, aged over 50 years old, with a peak from 75 to 84 years old. Studies of EVAR have reported improved short-term or postoperative mortality as well as numerous benefits of reduced operative time, avoidance of general anesthesia, reduction of trauma and postoperative pain, reduced length of stay and intensive care, reduced blood loss, and reduced immediate post-operative mortality. And yet, EVAR presents to be associated with an increased late mortality, due to long-term complications. Methods: A population-based, retrospective cohort study using hospital discharges of all patients who underwent a surgical elective AAA repair in France (including all for-profit and nonprofit hospitals) from January 1, 2008 to December 31, 2014 extracted from the PMSI database was exploited. Multivariate logistic regressions were employed and variables tested were: patients’ characteristics and comorbidities, hospital characteristics, and admission characteristics. Results: The study population comprehended 40,273 inpatients. There were 18,096 cases with OPEN (44.9\%) and 22,177 cases with EVAR (55.1\%). The use of EVAR in non-emergency AAA repair has grown from about 1/3 of AAA surgeries in 2008 (38.8\% of the 5,588 AAA repair surgeries) to about 2/3 of AAA surgeries in 2014 (64.2\% of the 5,806 AAA repair surgeries). The population undergoing EVAR surgery is mainly made of male patients (92.0\%) over 69 years old (mean of 75 years (SD=0.13)) with high burden of multisystem atherosclerosis. EVAR patients stay less longer in-hospital. Risk of 30-day in-hospital death is higher for OPEN patients (OPEN 3.75\% versus EVAR 1.31\%, p=0). Age, predominantly over 80 years old (OR=5.67), majors risk of seeing a choice of an EVAR approach rather than OPEN. The choice of OPEN (OR=6.87), the high-workload status of the hospital (OR=2.17), being admitted through the ER (OR=2.35) appeared to be factors that major the risk of needing an in-hospital stay in the ICU. The hospital activity of 300 procedures per year or more significantly decreased the probability of occurrence of in-hospital death (OR=0.85). In order to compare EVAR and OPEN surgery, only RCTs can provide with interpretable results, due to the importance of the indication bias.},
	language = {français},
	school = {Université de Lille},
	author = {Bouchet-Badel, Marie},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2019},
	keywords = {AAA, Anévrisme de l'aorte abdominale -- Chirurgie, Anévrisme de l'aorte abdominale -- Chirurgie -- Thèses et écrits académiques, Anévrysme de l'aorte abdominale -- chirurgie -- Dissertation universitaire, EVAR, Infra-renal abdominal aortic aneurysm, OPEN, Programme de médicalisation des systèmes d'information, Programme de médicalisation des systèmes d'information -- Thèses et écrits académiques, aortic stent, elective repair, endovascular aneurysm repair, infra-renal abdominal aortic aneurysm, nationwide database, open repair surgery, population-based, retrospective cohort study, vascular endograft, Études de cohortes -- Dissertation universitaire},
}

The aim of this work is to provide additional quantitative arguments concerning AAA endografts with comprehensive EVAR data, in order to support political decisions regarding the AAA. Context: Infra-renal abdominal aortic aneurysm (AAA) induces a high mortality rate of more than 80% when ruptured, affecting mainly men, aged over 50 years old, with a peak from 75 to 84 years old. Studies of EVAR have reported improved short-term or postoperative mortality as well as numerous benefits of reduced operative time, avoidance of general anesthesia, reduction of trauma and postoperative pain, reduced length of stay and intensive care, reduced blood loss, and reduced immediate post-operative mortality. And yet, EVAR presents to be associated with an increased late mortality, due to long-term complications. Methods: A population-based, retrospective cohort study using hospital discharges of all patients who underwent a surgical elective AAA repair in France (including all for-profit and nonprofit hospitals) from January 1, 2008 to December 31, 2014 extracted from the PMSI database was exploited. Multivariate logistic regressions were employed and variables tested were: patients’ characteristics and comorbidities, hospital characteristics, and admission characteristics. Results: The study population comprehended 40,273 inpatients. There were 18,096 cases with OPEN (44.9%) and 22,177 cases with EVAR (55.1%). The use of EVAR in non-emergency AAA repair has grown from about 1/3 of AAA surgeries in 2008 (38.8% of the 5,588 AAA repair surgeries) to about 2/3 of AAA surgeries in 2014 (64.2% of the 5,806 AAA repair surgeries). The population undergoing EVAR surgery is mainly made of male patients (92.0%) over 69 years old (mean of 75 years (SD=0.13)) with high burden of multisystem atherosclerosis. EVAR patients stay less longer in-hospital. Risk of 30-day in-hospital death is higher for OPEN patients (OPEN 3.75% versus EVAR 1.31%, p=0). Age, predominantly over 80 years old (OR=5.67), majors risk of seeing a choice of an EVAR approach rather than OPEN. The choice of OPEN (OR=6.87), the high-workload status of the hospital (OR=2.17), being admitted through the ER (OR=2.35) appeared to be factors that major the risk of needing an in-hospital stay in the ICU. The hospital activity of 300 procedures per year or more significantly decreased the probability of occurrence of in-hospital death (OR=0.85). In order to compare EVAR and OPEN surgery, only RCTs can provide with interpretable results, due to the importance of the indication bias.

@phdthesis{petillon_reparations_2019,
	address = {2018-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Réparations méniscales en {France}: pratiques et risques de méniscectomie secondaire : étude de la base nationale du {PMSI} de 2008 à 2014},
	shorttitle = {Réparations méniscales en {France}},
	abstract = {Contexte : Devant le potentiel arthrogène des méniscectomies, une des chirurgies les plus exécutées en France, la tendance actuelle est à la préservation méniscale. La réparation méniscale, chirurgie conservatrice, présente donc un intérêt certain et tend à se développer de plus en plus. Objectif : L’objectif stratégique de ce travail est de réutiliser des données massives afin de mieux comprendre les suites d’une réparation méniscale et leurs déterminants. Matériel et Méthodes : Nous avons réalisé une cohorte rétrospective par analyse de la base de données hospitalière nationale du Programme de Médicalisation des Systèmes d'Information (PMSI) entre janvier 2008 et décembre 2014. Nous avons inclus par l’utilisation des codes CCAM, tous les séjours relatifs à une réparation méniscale (en excluant les patients ayant également une lésion ligamentaire du genou, une fracture ou une ligamentoplastie). Nous avons ensuite analysé l’épidémiologie et la survie des patients bénéficiant d’une réparation méniscale isolée jusqu’à la méniscectomie, la pose de prothèse de genou ou l’ostéotomie. Nous avons utilisé le modèle de Cox pour identifier les facteurs de risques associés à cette survie. Résultats : Au total 17 687 séjours ont été inclus dont 12 260 séjours ambulatoires (69.3\%). On a observé 2,48 fois plus d’hommes opérés, l’âge moyen est de 32 ans et les femmes étaient significativement plus âgées (de 3 ans environ). L’arthroscopie était la principale voie d’abord chirurgicale (16 161 séjours, 91.4\%). L’étude a montré 99.9\% de survie à 1 mois, 99.1\% à 3 mois, 96.2\% à 6 mois, 90.4\% à 1 an, 84.0\% à 2 ans et enfin 76.5\% à 5 ans. Dans 96.3\% des cas d’échec, le patient était hospitalisé pour méniscectomie. Les facteurs de risque identifiés : une chirurgie par arthroscopie (HR=1.7), le sexe (HR=1.29) et un séjour en ambulatoire (HR=1.09). Conclusion : Le nombre de réparations méniscales isolées a plus que doublé de 2008 à 2014. La réparation méniscale peut retarder ou éviter la méniscectomie. Au vu de leur effet d’ampleur modérée, aucun facteur de risque identifié ne semble atténuer l’intérêt de cette pratique.},
	language = {français},
	school = {Université de Lille},
	author = {Pétillon, Camille},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2019},
	keywords = {Bases de données factuelles -- France -- Dissertation universitaire, Méniscectomie -- France, Méniscectomie -- France -- Thèses et écrits académiques, Ménisque latéral -- Chirurgie -- France, Ménisque latéral -- Chirurgie -- France -- Thèses et écrits académiques, Ménisque médial -- Chirurgie -- France, Ménisque médial -- Chirurgie -- France -- Thèses et écrits académiques, Ménisques de l'articulation du genou -- France -- Dissertation universitaire, Ménisques de l'articulation du genou -- chirurgie -- Dissertation universitaire, PMSI, Programme de médicalisation des systèmes d'information, Programme de médicalisation des systèmes d'information -- Thèses et écrits académiques, Réparation méniscale, méniscectomie, Épidémiologie -- statistiques et données numériques -- France -- Dissertation universitaire},
}

Contexte : Devant le potentiel arthrogène des méniscectomies, une des chirurgies les plus exécutées en France, la tendance actuelle est à la préservation méniscale. La réparation méniscale, chirurgie conservatrice, présente donc un intérêt certain et tend à se développer de plus en plus. Objectif : L’objectif stratégique de ce travail est de réutiliser des données massives afin de mieux comprendre les suites d’une réparation méniscale et leurs déterminants. Matériel et Méthodes : Nous avons réalisé une cohorte rétrospective par analyse de la base de données hospitalière nationale du Programme de Médicalisation des Systèmes d'Information (PMSI) entre janvier 2008 et décembre 2014. Nous avons inclus par l’utilisation des codes CCAM, tous les séjours relatifs à une réparation méniscale (en excluant les patients ayant également une lésion ligamentaire du genou, une fracture ou une ligamentoplastie). Nous avons ensuite analysé l’épidémiologie et la survie des patients bénéficiant d’une réparation méniscale isolée jusqu’à la méniscectomie, la pose de prothèse de genou ou l’ostéotomie. Nous avons utilisé le modèle de Cox pour identifier les facteurs de risques associés à cette survie. Résultats : Au total 17 687 séjours ont été inclus dont 12 260 séjours ambulatoires (69.3%). On a observé 2,48 fois plus d’hommes opérés, l’âge moyen est de 32 ans et les femmes étaient significativement plus âgées (de 3 ans environ). L’arthroscopie était la principale voie d’abord chirurgicale (16 161 séjours, 91.4%). L’étude a montré 99.9% de survie à 1 mois, 99.1% à 3 mois, 96.2% à 6 mois, 90.4% à 1 an, 84.0% à 2 ans et enfin 76.5% à 5 ans. Dans 96.3% des cas d’échec, le patient était hospitalisé pour méniscectomie. Les facteurs de risque identifiés : une chirurgie par arthroscopie (HR=1.7), le sexe (HR=1.29) et un séjour en ambulatoire (HR=1.09). Conclusion : Le nombre de réparations méniscales isolées a plus que doublé de 2008 à 2014. La réparation méniscale peut retarder ou éviter la méniscectomie. Au vu de leur effet d’ampleur modérée, aucun facteur de risque identifié ne semble atténuer l’intérêt de cette pratique.

@phdthesis{duriez_facteurs_2019,
	address = {2018-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Facteurs de risque d’infection de prothèse de hanche en {France}: analyse de la base nationale du {PMSI} de 2008 à 2014},
	shorttitle = {Facteurs de risque d’infection de prothèse de hanche en {France}},
	abstract = {Contexte : L’arthroplastie de hanche est connue pour être une chirurgie efficace pour améliorer la qualité de vie des patients. Cependant, des infections périprothétiques sont possibles. Celles-ci constituent un problème de santé publique et des coûts supplémentaires. En France, toute infection survenant dans un délai d’un an après une chirurgie avec implantation de matériel est une infection nosocomiale. Le but de cette étude était de quantifier le risque de réadmission pour infection nosocomiale après une arthroplastie de hanche et d’identifier les facteurs de risque dans la population française. Matériel et Méthodes : Nous avons mené une étude de cohorte rétrospective de janvier 2008 à décembre 2014 dans la population française à partir de la base nationale du PMSI. Nous avons inclus les séjours avec des codes d’arthroplastie de hanche et analysé les réadmissions pour infection sur prothèse dans l’année suivante. La cohorte a été divisée en quatre groupes : 1. chirurgie primitive programmée pour une pathologie dégénérative (arthrose) ; 2. chirurgie primitive programmée pour une maladie non dégénérative (polyarthrite rhumatoïde) ; 3. chirurgie primitive non programmée pour raison traumatique (fracture) ; 4. chirurgie de remplacement. Dans chaque groupe, nous avons réalisé un modèle de Cox pour identifier les facteurs de risque d'infection. Résultats : Pendant l'étude, 847 317 patients ont été inclus, il y a eu 12 472 réadmissions pour infection périprothétique. Trois facteurs de risque significatifs communs aux quatre groupes ont été trouvés : sexe masculin (HR = 1,33 dans le groupe 1), obésité (HR = 1,86 dans le groupe 1) et maladies liées à l'alcool (HR = 1,46 dans le groupe 1). En fonction des sous-groupes, d’autres facteurs de risque ont émergé : date d’admission, hôpital avec volume d’activité élevé, diabète, anémie, coagulopathie, cirrhose, maladies psychiatriques, insuffisance rénale chronique, infection urinaire, fibrillation atriale, polyarthrite rhumatoïde, spondylarthropathie avec myélopathie, greffe d’organe, Staphylococcus aureus et psoriasis. Un âge compris entre 60 et 80 ans et la durée de séjour à l’hôpital sont des facteurs de protection significatifs dans les sous-groupes 1 et 3, respectivement. Conclusion : Cette étude a identifié dans la population française les facteurs de risque et les facteurs protecteur d’infection de prothèse de hanche. Cela permettra d'identifier les patients à risque afin d'améliorer les soins de prévention primaire pendant leur hospitalisation.},
	language = {français},
	school = {Université de Lille},
	author = {Duriez, Clémence},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2019},
	keywords = {Arthroplastie -- Complications (médecine), Arthroplastie -- Complications -- Thèses et écrits académiques, Arthroplastie de hanche, Arthroplastie prothétique de hanche -- complications -- Dissertation universitaire, Bases de données factuelles -- France -- Dissertation universitaire, Infections dues aux prothèses -- Dissertation universitaire, Infections nosocomiales, Infections nosocomiales -- Thèses et écrits académiques, PMSI, Programme de médicalisation des systèmes d'information, Programme de médicalisation des systèmes d'information -- Thèses et écrits académiques, Prothèses de hanche, Prothèses de hanche -- Thèses et écrits académiques, arthroplastie de hanche, infection du site chirurgical, infection périprothétique, prothèse de hanche, réutilisation de données},
}

Contexte : L’arthroplastie de hanche est connue pour être une chirurgie efficace pour améliorer la qualité de vie des patients. Cependant, des infections périprothétiques sont possibles. Celles-ci constituent un problème de santé publique et des coûts supplémentaires. En France, toute infection survenant dans un délai d’un an après une chirurgie avec implantation de matériel est une infection nosocomiale. Le but de cette étude était de quantifier le risque de réadmission pour infection nosocomiale après une arthroplastie de hanche et d’identifier les facteurs de risque dans la population française. Matériel et Méthodes : Nous avons mené une étude de cohorte rétrospective de janvier 2008 à décembre 2014 dans la population française à partir de la base nationale du PMSI. Nous avons inclus les séjours avec des codes d’arthroplastie de hanche et analysé les réadmissions pour infection sur prothèse dans l’année suivante. La cohorte a été divisée en quatre groupes : 1. chirurgie primitive programmée pour une pathologie dégénérative (arthrose) ; 2. chirurgie primitive programmée pour une maladie non dégénérative (polyarthrite rhumatoïde) ; 3. chirurgie primitive non programmée pour raison traumatique (fracture) ; 4. chirurgie de remplacement. Dans chaque groupe, nous avons réalisé un modèle de Cox pour identifier les facteurs de risque d'infection. Résultats : Pendant l'étude, 847 317 patients ont été inclus, il y a eu 12 472 réadmissions pour infection périprothétique. Trois facteurs de risque significatifs communs aux quatre groupes ont été trouvés : sexe masculin (HR = 1,33 dans le groupe 1), obésité (HR = 1,86 dans le groupe 1) et maladies liées à l'alcool (HR = 1,46 dans le groupe 1). En fonction des sous-groupes, d’autres facteurs de risque ont émergé : date d’admission, hôpital avec volume d’activité élevé, diabète, anémie, coagulopathie, cirrhose, maladies psychiatriques, insuffisance rénale chronique, infection urinaire, fibrillation atriale, polyarthrite rhumatoïde, spondylarthropathie avec myélopathie, greffe d’organe, Staphylococcus aureus et psoriasis. Un âge compris entre 60 et 80 ans et la durée de séjour à l’hôpital sont des facteurs de protection significatifs dans les sous-groupes 1 et 3, respectivement. Conclusion : Cette étude a identifié dans la population française les facteurs de risque et les facteurs protecteur d’infection de prothèse de hanche. Cela permettra d'identifier les patients à risque afin d'améliorer les soins de prévention primaire pendant leur hospitalisation.

@phdthesis{simon_potentialisation_2019,
	address = {2018-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Potentialisation de l’effet des antivitamines {K} par les statines},
	abstract = {Contexte : La co-administration d’antivitamines K (AVK) et de statines est fréquente chez les patients atteints de pathologies cardio-vasculaires. Les AVK et certaines statines sont fortement liés aux protéines plasmatiques et métabolisés par le système du cytochrome P450. Les patients sous AVK présentent un risque de complications hémorragiques lorsque l’INR dépasse les limites de l’index thérapeutique. Certaines études de la littérature retrouvent une interaction entre les AVK et les statines. L’objectif de cette étude est de contribuer à améliorer la sécurité de l’utilisation des AVK chez les patients également traités par statines. Pour atteindre cet objectif, nous avons étudié en vie réelle la survenue d’incidents d’anticoagulation par AVK et leur lien avec la prise de statines. Matériel et Méthodes : Il s’agit d’une cohorte rétrospective observationnelle par utilisation de données collectées pour les soins de routine des patients hospitalisés de l’hôpital de Denain (Nord de la France) entre 2007 et 2014. Etaient inclus les séjours des patients ayant au moins une administration d'AVK et une hospitalisation de deux jours ou plus. Les séjours sans aucune mesure d'INR ni aucun AVK réellement pris par les patients ont été exclus. Au total, nous avons inclus 3394 séjours parmi les 109865. Une régression logistique multivariée a été utilisée pour analyser le risque d’INR5 dans notre population. Résultats : Parmi les 3394 patients inclus, l’âge médian était de 78,0 ans, 945 patients ont reçu une statine et 107 patients ont été exposé à une statine avec un INR≥5. Les covariables suivantes étaient des facteurs de protection (OR ajusté et 95CI) : administration de statines (0,49 [0,38; 0,61]), administration d'héparine (0,61 [0,49; 0,75]) et de sexe masculin (0,72 [0,59; 0,88]). Les covariables suivantes étaient des facteurs de risque : malnutrition sévère (1,73 [1,34; 2,23]), cancer (1,35 [0,99; 1,84]), augmentation de l'âge (1,12 [1,03; 1,22] tous les 10 ans, avec un effet linéaire) et augmentation de la durée de séjour (1,07 [1,06; 1,08] par jour). Conclusion : L'administration de statines n'a pas été associée à un risque accru d'élévation de l'INR sous AVK. Cependant, cette étude démontre la grande importance des facteurs de confusion, notamment la dénutrition sévère.},
	language = {français},
	school = {Université de Lille},
	author = {Simon, Alice},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2019},
	keywords = {AVK, Antivitamines K, Inhibiteurs de l'hydroxyméthylglutaryl-CoA réductase -- Dissertation universitaire, Interactions médicamenteuses, Interactions médicamenteuses -- Dissertation universitaire, Statines, VKA, Vitamine K -- antagonistes et inhibiteurs -- Dissertation universitaire, drug-drug interaction, interaction médicamenteuse, statines, statins},
}

Contexte : La co-administration d’antivitamines K (AVK) et de statines est fréquente chez les patients atteints de pathologies cardio-vasculaires. Les AVK et certaines statines sont fortement liés aux protéines plasmatiques et métabolisés par le système du cytochrome P450. Les patients sous AVK présentent un risque de complications hémorragiques lorsque l’INR dépasse les limites de l’index thérapeutique. Certaines études de la littérature retrouvent une interaction entre les AVK et les statines. L’objectif de cette étude est de contribuer à améliorer la sécurité de l’utilisation des AVK chez les patients également traités par statines. Pour atteindre cet objectif, nous avons étudié en vie réelle la survenue d’incidents d’anticoagulation par AVK et leur lien avec la prise de statines. Matériel et Méthodes : Il s’agit d’une cohorte rétrospective observationnelle par utilisation de données collectées pour les soins de routine des patients hospitalisés de l’hôpital de Denain (Nord de la France) entre 2007 et 2014. Etaient inclus les séjours des patients ayant au moins une administration d'AVK et une hospitalisation de deux jours ou plus. Les séjours sans aucune mesure d'INR ni aucun AVK réellement pris par les patients ont été exclus. Au total, nous avons inclus 3394 séjours parmi les 109865. Une régression logistique multivariée a été utilisée pour analyser le risque d’INR5 dans notre population. Résultats : Parmi les 3394 patients inclus, l’âge médian était de 78,0 ans, 945 patients ont reçu une statine et 107 patients ont été exposé à une statine avec un INR≥5. Les covariables suivantes étaient des facteurs de protection (OR ajusté et 95CI) : administration de statines (0,49 [0,38; 0,61]), administration d'héparine (0,61 [0,49; 0,75]) et de sexe masculin (0,72 [0,59; 0,88]). Les covariables suivantes étaient des facteurs de risque : malnutrition sévère (1,73 [1,34; 2,23]), cancer (1,35 [0,99; 1,84]), augmentation de l'âge (1,12 [1,03; 1,22] tous les 10 ans, avec un effet linéaire) et augmentation de la durée de séjour (1,07 [1,06; 1,08] par jour). Conclusion : L'administration de statines n'a pas été associée à un risque accru d'élévation de l'INR sous AVK. Cependant, cette étude démontre la grande importance des facteurs de confusion, notamment la dénutrition sévère.

@phdthesis{jansens_evaluation_2018,
	address = {2018-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Evaluation de l’héxylaminolévulinate dans la prise en charge des tumeurs vésicales par réutilisation de la base nationale du {PMSI}},
	abstract = {Introduction : La cystoscopie à la lumière bleue (CLB) améliore la détection du cancer de vessie (CV), réduit les récidives de CV par rapport à la cystoscopie standard (CS). L'effet sur la survie globale reste controversé. L’objectif de cette étude était d'évaluer l'effet de la CLB sur la survie globale des patients présentant un CV à l'aide d'une base de données administrative nationale. L'objectif secondaire était d'évaluer les taux de récidive et de progression de CV. Matériel et Méthodes : Une étude de cohorte rétrospective basée sur les données de 2008 à 2014 du PMSI (base de données médico-administrative française) a été réalisée. Tous les patients subissant une première résection transurétrale de vessie (RTUV) entre 2010 et 2014 ont été inclus. Les patients ayant subi des actes médico-chirurgicaux évocateurs d’une tumeur de vessie infiltrant le muscle (TVIM) dans les 90 jours suivant la RTUV ont été exclus. L'exposition était d’être pris en charge dans un établissement utilisant fréquemment l’HAL : les hôpitaux étaient classés comme « hôpitaux CLB » lorsque plus de 10\% des RTUV étaient réalisées avec l’HAL et comme « hôpitaux CS » pour les autres. Les critères de jugement étaient les suivants : le décès, la cystectomie, la RTUV ou la chimiothérapie survenant au cours de la période de suivi. Des analyses de survie (modèles de Cox) et régressions logistiques ont été effectuées. Résultats : De 2008 à 2014, 301 300 patients ont eu au moins une RTUV en France. Après exclusion, 14 091 patients ont été assignés au groupe « hôpitaux CLB » et 39 236 au groupe « hôpitaux CS ». La probabilité de survie globale était de 0,962 (IC 95\% [0,961 ; 0,964]) à 1 an, 0,923 (IC 95\% [0,920 ; 0,925]) à 2 ans et 0,844 (IC 95\% [0,838 ; 0.850]) à 5 ans. Avec l'analyse de Cox multivariée, les « hôpitaux CLB » n'ont pas présenté d’augmentation de la survie, HR = 1,02 (IC 95\% [0,953; 1.09]). La régression logistique multivariée a montré que le risque de cystectomie à 1 an était significativement augmenté dans le groupe « hôpitaux CLB » OR=1,19 (IC 95\% [1,05 ; 1,35]). Dans les « hôpitaux CLB », la probabilité de réaliser une seconde RTUV n’était pas significativement modifiée, HR=1.04 (IC 95\% [1,00 ; 1,07]). Conclusion : Les hôpitaux utilisant la CLB n'ont pas présenté d’augmentation de la survie globale des patients présentant un CV au cours de la durée de l’étude.},
	language = {français},
	school = {Université de Lille},
	author = {Jansens, Henri},
	collaborator = {Marcq, Gauthier},
	year = {2018},
	keywords = {Acide amino-lévulinique -- analogues et dérivés -- Dissertation universitaire, Cancer de vessie, Cystoscopie -- méthodes -- Dissertation universitaire, Fluorescence, Fluorescence -- Dissertation universitaire, PMSI., Programme de médicalisation des systèmes d'information, Résultat thérapeutique -- Dissertation universitaire, Soins médicaux -- Évaluation -- France, Tumeurs de la vessie urinaire -- chirurgie -- Dissertation universitaire, Tumeurs de la vessie urinaire -- diagnostic -- Dissertation universitaire, Vessie -- Cancer -- Chirurgie, Vessie -- Cancer -- Diagnostic, cystoscopie à la lumière blanche, cystoscopie à la lumière bleue, héxylaminolévulinate, résection transurétrale de vessie},
}

Introduction : La cystoscopie à la lumière bleue (CLB) améliore la détection du cancer de vessie (CV), réduit les récidives de CV par rapport à la cystoscopie standard (CS). L'effet sur la survie globale reste controversé. L’objectif de cette étude était d'évaluer l'effet de la CLB sur la survie globale des patients présentant un CV à l'aide d'une base de données administrative nationale. L'objectif secondaire était d'évaluer les taux de récidive et de progression de CV. Matériel et Méthodes : Une étude de cohorte rétrospective basée sur les données de 2008 à 2014 du PMSI (base de données médico-administrative française) a été réalisée. Tous les patients subissant une première résection transurétrale de vessie (RTUV) entre 2010 et 2014 ont été inclus. Les patients ayant subi des actes médico-chirurgicaux évocateurs d’une tumeur de vessie infiltrant le muscle (TVIM) dans les 90 jours suivant la RTUV ont été exclus. L'exposition était d’être pris en charge dans un établissement utilisant fréquemment l’HAL : les hôpitaux étaient classés comme « hôpitaux CLB » lorsque plus de 10% des RTUV étaient réalisées avec l’HAL et comme « hôpitaux CS » pour les autres. Les critères de jugement étaient les suivants : le décès, la cystectomie, la RTUV ou la chimiothérapie survenant au cours de la période de suivi. Des analyses de survie (modèles de Cox) et régressions logistiques ont été effectuées. Résultats : De 2008 à 2014, 301 300 patients ont eu au moins une RTUV en France. Après exclusion, 14 091 patients ont été assignés au groupe « hôpitaux CLB » et 39 236 au groupe « hôpitaux CS ». La probabilité de survie globale était de 0,962 (IC 95% [0,961 ; 0,964]) à 1 an, 0,923 (IC 95% [0,920 ; 0,925]) à 2 ans et 0,844 (IC 95% [0,838 ; 0.850]) à 5 ans. Avec l'analyse de Cox multivariée, les « hôpitaux CLB » n'ont pas présenté d’augmentation de la survie, HR = 1,02 (IC 95% [0,953; 1.09]). La régression logistique multivariée a montré que le risque de cystectomie à 1 an était significativement augmenté dans le groupe « hôpitaux CLB » OR=1,19 (IC 95% [1,05 ; 1,35]). Dans les « hôpitaux CLB », la probabilité de réaliser une seconde RTUV n’était pas significativement modifiée, HR=1.04 (IC 95% [1,00 ; 1,07]). Conclusion : Les hôpitaux utilisant la CLB n'ont pas présenté d’augmentation de la survie globale des patients présentant un CV au cours de la durée de l’étude.

@phdthesis{de_meyer_hospitalisations_2018,
	address = {2018-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Hospitalisations liées au virus de la grippe en {France}, une analyse de la base nationale du {PMSI}, 2008-2014},
	abstract = {Contexte : La grippe est responsable d’une morbidité et d’une mortalité conséquente chaque année. Des bases de données hospitalières exhaustives existent à une échelle nationale, et peuvent permettre d’obtenir de riches informations sur les séjours hospitaliers liés à la grippe. L’objectif de cette étude est de décrire l’épidémiologie des hospitalisations liées à la grippe en France, de 2008 à 2014, à l’aide d’une base de données médico-administrative hospitalière nationale. Matériel et Méthodes : A l’aide du Programme de Médicalisation des Systèmes d’Information (PMSI), nous avons identifié toutes les hospitalisations liées à la grippe, des saisons 2008-2009 à 2013-2014, en utilisant les codes CIM-10, et analysé les données extraites des résumés de sortie. Résultats : Entre 2008 et 2014, 67 230 séjours hospitaliers ont été directement liés à la grippe pendant les 6 saisons grippales de l’étude. La saison la plus importante était 2009-2010, avec 21 572 séjours. Cette saison, le nombre de séjours était plus élevé dans tous les groupes d’âge, sauf chez les plus âgés : 91,6\% des patients avaient moins de 65 ans. Cependant en 2011-2012, un pic a été observé particulièrement chez les sujets âgés, qui représentaient 29,7\% des cas. Tout au long de l’étude, les enfants de moins de 5 ans étaient surreprésentés (31,2\% des patients). Le sex ratio était de 1,00 dans la population hospitalisée, mais il y avait plus d’hommes que de femmes en dessous de 15 ans, et plus de femmes au-delà. La durée de séjour moyenne était de 5,33 jours. Presque 6\% des patients ont été admis en soins intensifs ou réanimation, et 1,39\% sont décédés. Les durées de séjours et la mortalité intra-hospitalière étaient plus élevés chez les personnes âgées. Les durées de séjour, les admissions en réanimation, et la mortalité intra-hospitalière étaient significativement plus élevés chez les hommes que chez les femmes. Conclusion : Notre étude a montré que la grippe est responsable d’une morbidité conséquente, particulièrement chez les jeunes enfants et les sujets âgés, qui varie selon les saisons, et tend à être plus sévère chez les hommes.},
	language = {français},
	school = {Université de Lille},
	author = {De Meyer, Cécile},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2018},
	keywords = {Base de données -- Dissertation universitaire, Base de données nationale, Grippe -- Statistiques, Grippe -- Statistiques -- Thèses et écrits académiques, Grippe humaine -- statistiques et données numériques -- Dissertation universitaire, Hospitalisation, Hospitalisation -- Dissertation universitaire, Hospitalisation -- Thèses et écrits académiques, Programme de médicalisation des systèmes d'information, Programme de médicalisation des systèmes d'information -- Thèses et écrits académiques, grippe, hospitalisation, épidémiologie},
}

Contexte : La grippe est responsable d’une morbidité et d’une mortalité conséquente chaque année. Des bases de données hospitalières exhaustives existent à une échelle nationale, et peuvent permettre d’obtenir de riches informations sur les séjours hospitaliers liés à la grippe. L’objectif de cette étude est de décrire l’épidémiologie des hospitalisations liées à la grippe en France, de 2008 à 2014, à l’aide d’une base de données médico-administrative hospitalière nationale. Matériel et Méthodes : A l’aide du Programme de Médicalisation des Systèmes d’Information (PMSI), nous avons identifié toutes les hospitalisations liées à la grippe, des saisons 2008-2009 à 2013-2014, en utilisant les codes CIM-10, et analysé les données extraites des résumés de sortie. Résultats : Entre 2008 et 2014, 67 230 séjours hospitaliers ont été directement liés à la grippe pendant les 6 saisons grippales de l’étude. La saison la plus importante était 2009-2010, avec 21 572 séjours. Cette saison, le nombre de séjours était plus élevé dans tous les groupes d’âge, sauf chez les plus âgés : 91,6% des patients avaient moins de 65 ans. Cependant en 2011-2012, un pic a été observé particulièrement chez les sujets âgés, qui représentaient 29,7% des cas. Tout au long de l’étude, les enfants de moins de 5 ans étaient surreprésentés (31,2% des patients). Le sex ratio était de 1,00 dans la population hospitalisée, mais il y avait plus d’hommes que de femmes en dessous de 15 ans, et plus de femmes au-delà. La durée de séjour moyenne était de 5,33 jours. Presque 6% des patients ont été admis en soins intensifs ou réanimation, et 1,39% sont décédés. Les durées de séjours et la mortalité intra-hospitalière étaient plus élevés chez les personnes âgées. Les durées de séjour, les admissions en réanimation, et la mortalité intra-hospitalière étaient significativement plus élevés chez les hommes que chez les femmes. Conclusion : Notre étude a montré que la grippe est responsable d’une morbidité conséquente, particulièrement chez les jeunes enfants et les sujets âgés, qui varie selon les saisons, et tend à être plus sévère chez les hommes.

@phdthesis{dumez_interactions_2018,
	address = {2018-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Interactions entre les {Antivitamines} {K} et les {Inhibiteurs} de la pompe à protons},
	abstract = {Contexte : Les Antivitamines K (AVK) et les Inhibiteurs de la pompe à protons (IPP) sont des médicaments utilisés de manière courante en médecine. Les médecins sont alertés des dangers potentiels des antivitamines k et de leurs principales interactions médicamenteuses connues. Différentes études ont été réalisées sur les interactions entre les AVK et les IPP secondairement à des retours pharmacologiques, mais celles-ci sont contradictoires. L’objectif de cette étude est d’étudier en vie réelle l’impact des IPP sur l’activité biologique des AVK. Matériel et Méthodes : Nous avons réalisé une étude de type cohorte historique. La population de l’étude est représentée par la population hospitalisée pendant plus de 2 jours dans l’hôpital de Denain étant traitée par des antivitamines k. Nous avons recherché un effet sur l’anticoagulation dû aux AVK lorsqu’un traitement par IPP était associé. Pour cela nous avons suivi deux groupes, un avec AVK et IPP versus AVK seul et nous avons monitoré l’incidence d’un INR  5 dans chaque groupe. Nous avons effectué un test statistique par méthode du chi 2 puis régression logistique à la recherche de facteurs de confusions. Résultats : 3560 patients ont été étudiés. Il existe une diminution du risque d’une anticoagulation augmentée sous AVK lorsque le patient est également traité par IPP dans cette étude (OR=0.525 IC95\% [0.431; 0.64]). Nous avons également retrouvé des variables associées à une modification de l’effet anticoagulant des AVK tel que l’âge (OR=1.13 IC95\% [1.03; 1.23]), le sexe masculin (OR=0.766 IC95\% [0.632; 0.928]), la dénutrition (OR=1.93 IC95\% [1.34; 2.79], l’insuffisance rénale chronique (OR=1.29 IC95\% [1; 1.67] et le traitement par héparine (OR=2.03 IC95\% [1.09; 3.81]). Conclusion : Cette étude ne met en avant aucun risque d’élévation de l’INR pour les patients traités de façon concomitante par AVK et IPP versus AVK seul. Elle met néanmoins en lumière l’importance de certains facteurs de risque, tel que l’âge, le sexe, la dénutrition, l’administration d’héparine et l’insuffisance rénale.},
	language = {français},
	school = {Université de Lille},
	author = {Dumez, Célia},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2018},
	keywords = {AVK, Acenocoumarol, Anticoagulants -- Dissertation universitaire, Antivitamines K, Antivitamines K -- Thèses et écrits académiques, INR, IPP, Inhibiteurs de la pompe à protons, Inhibiteurs de la pompe à protons -- Dissertation universitaire, Inhibiteurs de la pompe à protons -- Thèses et écrits académiques, Interactions médicamenteuses, Interactions médicamenteuses -- Dissertation universitaire, Interactions médicamenteuses -- Thèses et écrits académiques, PPI, VKA, acenocoumarol, antivitamine K, drug-drug interaction, esomeprazole, fluindione, inhibiteur de la pompe à protons, interaction médicamenteuse, lansoprazole, omeprazole, proton pump inhibitors, vitamin K antagonist, warfarine},
}

Contexte : Les Antivitamines K (AVK) et les Inhibiteurs de la pompe à protons (IPP) sont des médicaments utilisés de manière courante en médecine. Les médecins sont alertés des dangers potentiels des antivitamines k et de leurs principales interactions médicamenteuses connues. Différentes études ont été réalisées sur les interactions entre les AVK et les IPP secondairement à des retours pharmacologiques, mais celles-ci sont contradictoires. L’objectif de cette étude est d’étudier en vie réelle l’impact des IPP sur l’activité biologique des AVK. Matériel et Méthodes : Nous avons réalisé une étude de type cohorte historique. La population de l’étude est représentée par la population hospitalisée pendant plus de 2 jours dans l’hôpital de Denain étant traitée par des antivitamines k. Nous avons recherché un effet sur l’anticoagulation dû aux AVK lorsqu’un traitement par IPP était associé. Pour cela nous avons suivi deux groupes, un avec AVK et IPP versus AVK seul et nous avons monitoré l’incidence d’un INR  5 dans chaque groupe. Nous avons effectué un test statistique par méthode du chi 2 puis régression logistique à la recherche de facteurs de confusions. Résultats : 3560 patients ont été étudiés. Il existe une diminution du risque d’une anticoagulation augmentée sous AVK lorsque le patient est également traité par IPP dans cette étude (OR=0.525 IC95% [0.431; 0.64]). Nous avons également retrouvé des variables associées à une modification de l’effet anticoagulant des AVK tel que l’âge (OR=1.13 IC95% [1.03; 1.23]), le sexe masculin (OR=0.766 IC95% [0.632; 0.928]), la dénutrition (OR=1.93 IC95% [1.34; 2.79], l’insuffisance rénale chronique (OR=1.29 IC95% [1; 1.67] et le traitement par héparine (OR=2.03 IC95% [1.09; 3.81]). Conclusion : Cette étude ne met en avant aucun risque d’élévation de l’INR pour les patients traités de façon concomitante par AVK et IPP versus AVK seul. Elle met néanmoins en lumière l’importance de certains facteurs de risque, tel que l’âge, le sexe, la dénutrition, l’administration d’héparine et l’insuffisance rénale.

@phdthesis{dubois_nombre_2018,
	address = {2018-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Le nombre de méniscectomies décroit au fil du temps: une étude française nationale de 2008 à 2014},
	shorttitle = {Le nombre de méniscectomies décroit au fil du temps},
	abstract = {Contexte et objectif : La méniscectomie est l'une des chirurgies orthopédiques les plus exécutées en France. Cependant, les données épidémiologiques relatives aux méniscectomies restent limitées. L'objectif de cette étude était d'analyser les tendances actuelles des méniscectomies isolées exécutées en France de 2008 à 2014. Matériel et Méthodes : En analysant la base de données hospitalière nationale française, le PMSI, durant les années 2008 à 2014, nous avons identifié tous les patients opérés d'une méniscectomie isolée, totale ou partielle, à partir des codes actes de la classification d'actes médicaux (CCAM). Les données analysées étaient les données démographiques des patients, le diagnostic principal, la durée de séjour, la méthode chirurgicale utilisée, la source d'admission, la mortalité intra hospitalière, le mode de sortie, et le type d'hôpital (but non lucratif versus but lucratif). Résultats : De 2008 à 2014, 828,799 actes de méniscectomies isolées ont été exécutés en France. Le nombre annuel de méniscectomies a diminué significativement de 122,687 en 2008 à 113,589 en 2014. 65.8 \% des méniscectomies sont réalisées chez les hommes. L'âge moyen était de 49.2 ans. Cette moyenne d'âge était significativement plus haute pour les femmes que pour les hommes: 53.4 contre 47,1 (p{\textless}0.001). La durée de séjour moyenne était de 1.35 jours. 99.6 \% des méniscectomies isolées ont été exécutées par arthroscopie. Plus de 76 \% des méniscectomies ont été exécutées dans des hôpitaux à but lucratif. Conclusion : La méniscectomie est une chirurgie principalement réalisée chez les hommes. Elle est pratiquée la majorité du temps par arthroscopie, est un geste chirurgical ambulatoire et habituellement programmé. Le nombre de méniscectomies réalisée en France au cours de la période d'étude diminue au fil du temps. Ces résultats peuvent être liés à la tendance actuelle «d'économie méniscale».},
	language = {français},
	school = {Université de Lille},
	author = {Dubois, Maxime},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2018},
	keywords = {Bases de données factuelles -- statistiques et données numériques -- Dissertation universitaire, Méniscectomie, Méniscectomie -- Statistiques, Méniscectomie -- Statistiques -- Thèses et écrits académiques, Ménisque latéral -- Chirurgie, Ménisque latéral -- Chirurgie -- Thèses et écrits académiques, Ménisque médial -- Chirurgie, Ménisque médial -- Chirurgie -- Thèses et écrits académiques, Ménisques de l'articulation du genou -- chirurgie -- Dissertation universitaire, PMSI, Programme de médicalisation des systèmes d'information, Programme de médicalisation des systèmes d'information -- Thèses et écrits académiques, arthroscopie, arthroscopie du genou, base de données nationale française, genou, lésion méniscale, méniscectomie partielle, méniscectomie totale, ménisque, Épidémiologie -- France, Épidémiologie -- France -- Thèses et écrits académiques, Épidémiologie -- tendances -- Dissertation universitaire, épidémiologie},
}

Contexte et objectif : La méniscectomie est l'une des chirurgies orthopédiques les plus exécutées en France. Cependant, les données épidémiologiques relatives aux méniscectomies restent limitées. L'objectif de cette étude était d'analyser les tendances actuelles des méniscectomies isolées exécutées en France de 2008 à 2014. Matériel et Méthodes : En analysant la base de données hospitalière nationale française, le PMSI, durant les années 2008 à 2014, nous avons identifié tous les patients opérés d'une méniscectomie isolée, totale ou partielle, à partir des codes actes de la classification d'actes médicaux (CCAM). Les données analysées étaient les données démographiques des patients, le diagnostic principal, la durée de séjour, la méthode chirurgicale utilisée, la source d'admission, la mortalité intra hospitalière, le mode de sortie, et le type d'hôpital (but non lucratif versus but lucratif). Résultats : De 2008 à 2014, 828,799 actes de méniscectomies isolées ont été exécutés en France. Le nombre annuel de méniscectomies a diminué significativement de 122,687 en 2008 à 113,589 en 2014. 65.8 % des méniscectomies sont réalisées chez les hommes. L'âge moyen était de 49.2 ans. Cette moyenne d'âge était significativement plus haute pour les femmes que pour les hommes: 53.4 contre 47,1 (p\textless0.001). La durée de séjour moyenne était de 1.35 jours. 99.6 % des méniscectomies isolées ont été exécutées par arthroscopie. Plus de 76 % des méniscectomies ont été exécutées dans des hôpitaux à but lucratif. Conclusion : La méniscectomie est une chirurgie principalement réalisée chez les hommes. Elle est pratiquée la majorité du temps par arthroscopie, est un geste chirurgical ambulatoire et habituellement programmé. Le nombre de méniscectomies réalisée en France au cours de la période d'étude diminue au fil du temps. Ces résultats peuvent être liés à la tendance actuelle «d'économie méniscale».

@phdthesis{faglin_parcours_2018,
	address = {2018-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Parcours hospitalier des patients après une chirurgie esthétique en {France}: analyse de 349 798 séjours de 2008 à 2014},
	shorttitle = {Parcours hospitalier des patients après une chirurgie esthétique en {France}},
	abstract = {Introduction : The epidemiology of cosmetic surgery is well known in the world, but less in France. According to the International Society of Aesthetic Plastic Surgery, the number of interventions has increased by 8\% worldwide in 2016. These particular patients are known to have psychosocial factors, and psychiatric comorbidities (body dysmorphic disorder, personality disorders, depressive states, suicide attempt). In France, aesthetic surgery procedures are routinely collected in the PMSI database, a nationwide compulsory discharge collection, as well as all the hospital admissions of these patients. The objective of the study was to describe the outcome of patients after a first cosmetic surgery in terms of aesthetic rehospitalization or others, by data reuse of the PMSI. Materiel and Methods : Hospital inpatient stays from 2008 to 2014 were extracted from the PMSI. Two patient groups were defined: patients undergoing aesthetic surgery (group A), and patients undergoing an appendectomy randomly selected (group B). The inpatient stays of group A were analyzed, and readmission rates were compared by pairing patients from groups A \& B according to age, gender, and geographic area (exact matching). Results : Over 7 years, 349,798 inpatient stays of aesthetic surgery were analyzed, corresponding to 163,517 different patients. The mean age of the patients was 43.4 years. Men were 2.3 years older than women (p=0). Bilateral augmentation mammoplasty was the most frequent procedure (23.7\%), followed by liposuction (17.0\%). Most of the time (67.2\%), only one surgical procedure was performed per stay (two procedures in 14.6\%). Patients were followed-up 0 to 7 years (2 years for 126,227 patients, and 5 years for 56,868 patients). After a first cosmetic surgery, 720,018 readmissions were observed, irrespectively from the cause. Regarding surgical nomadism, 25.7\% of patients having a surgery and followed up 5 years, had surgeries in at least two different facilities. By comparing those patients to patients having appendectomy (same age, gender and region), the risk of abortion after an aesthetic surgery was significantly increased at 2 years (8.4\% vs 1.1\%, RR=7.5, p=0), as well as self-inflected injuries (0.64\% vs 0.27\%, RR=2.4, p=0), intoxications (1.9\% vs 0.86\%, RR=2.2, p=0), medically assisted procreation (0.83\% versus 0.32\%, RR 2.6, p=0), but also altruism (enrollment in research protocols and workup for the donation of organs, 0.26\% vs 0.04\%, RR 6.5, p=0). Conclusion : The figures of cosmetic surgery in France followed the current global trend. Aesthetic surgery patients seem to have more abortion and more suicide attempts than the general population.},
	language = {français},
	school = {Université de Lille},
	author = {Faglin, Pierre},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2018},
	keywords = {Avortement, Avortement -- Thèses et écrits académiques, Chirurgie esthétique, Chirurgie plastique -- Aspect psychologique, Chirurgie plastique -- Aspect psychologique -- Thèses et écrits académiques, Chirurgie plastique -- psychologie -- Dissertation universitaire, Comportement suicidaire, Comportement suicidaire -- Thèses et écrits académiques, IVG, Implants mammaires -- Dissertation universitaire, Interruption légale de grossesse -- Dissertation universitaire, Prothèses mammaires, Prothèses mammaires -- Thèses et écrits académiques, Tentative de suicide -- Dissertation universitaire, nomadisme médical, prothèses mammaires, psychosocial, tentative de suicide},
}

Introduction : The epidemiology of cosmetic surgery is well known in the world, but less in France. According to the International Society of Aesthetic Plastic Surgery, the number of interventions has increased by 8% worldwide in 2016. These particular patients are known to have psychosocial factors, and psychiatric comorbidities (body dysmorphic disorder, personality disorders, depressive states, suicide attempt). In France, aesthetic surgery procedures are routinely collected in the PMSI database, a nationwide compulsory discharge collection, as well as all the hospital admissions of these patients. The objective of the study was to describe the outcome of patients after a first cosmetic surgery in terms of aesthetic rehospitalization or others, by data reuse of the PMSI. Materiel and Methods : Hospital inpatient stays from 2008 to 2014 were extracted from the PMSI. Two patient groups were defined: patients undergoing aesthetic surgery (group A), and patients undergoing an appendectomy randomly selected (group B). The inpatient stays of group A were analyzed, and readmission rates were compared by pairing patients from groups A & B according to age, gender, and geographic area (exact matching). Results : Over 7 years, 349,798 inpatient stays of aesthetic surgery were analyzed, corresponding to 163,517 different patients. The mean age of the patients was 43.4 years. Men were 2.3 years older than women (p=0). Bilateral augmentation mammoplasty was the most frequent procedure (23.7%), followed by liposuction (17.0%). Most of the time (67.2%), only one surgical procedure was performed per stay (two procedures in 14.6%). Patients were followed-up 0 to 7 years (2 years for 126,227 patients, and 5 years for 56,868 patients). After a first cosmetic surgery, 720,018 readmissions were observed, irrespectively from the cause. Regarding surgical nomadism, 25.7% of patients having a surgery and followed up 5 years, had surgeries in at least two different facilities. By comparing those patients to patients having appendectomy (same age, gender and region), the risk of abortion after an aesthetic surgery was significantly increased at 2 years (8.4% vs 1.1%, RR=7.5, p=0), as well as self-inflected injuries (0.64% vs 0.27%, RR=2.4, p=0), intoxications (1.9% vs 0.86%, RR=2.2, p=0), medically assisted procreation (0.83% versus 0.32%, RR 2.6, p=0), but also altruism (enrollment in research protocols and workup for the donation of organs, 0.26% vs 0.04%, RR 6.5, p=0). Conclusion : The figures of cosmetic surgery in France followed the current global trend. Aesthetic surgery patients seem to have more abortion and more suicide attempts than the general population.

@phdthesis{wyttynck_arthroplasties_2018,
	address = {2018-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Arthroplasties primaires et de reprise de la hanche en {France}: facteurs associés aux séjours courts : analyse de la base {PMSI} 2008-2014},
	shorttitle = {Arthroplasties primaires et de reprise de la hanche en {France}},
	abstract = {Contexte : Se mettent en place dans tous les pays industrialisés des parcours de prise en charge chirurgicales optimisés pour réduire les durée de séjours. En France une incitation au développement de la chirurgie ambulatoire est faite. Objectif : Notre objectif est de déterminer les facteurs associés aux séjours courts. Matériel et Méthodes : Nous avons réalisé une étude rétrospective par analyse de la base de données hospitalière nationale du Programme de Médicalisation des Systèmes d'Information (PMSI) entre janvier 2008 et décembre 2014. Nous avons inclus par l’utilisation des codes CCAM, tous les séjours relatifs à une arthroplastie de hanche primaire ou de reprise. Puis nous avons scindé la population en deux groupes, l’un ayant des séjours courts (1 à 5 journées) et l’autre ayant des durées de séjours supérieures. Nous avons ensuite comparé les données démographiques et médicales de ces groupes et identifié par une régression logistique les facteurs associés aux séjours courts. Résultats : Les facteurs associés à une prise en charge courte dépendent des sous-groupes de prise en charge (étiologie, intervention programmée). Les facteurs récurrents sont le volume d’activité de l’établissement, le statut privé de l’établissement, l’âge du patient et les indications opératoires. Conclusion : Des facteurs objectifs associés à une réduction de la durée de séjour ont pu être mis en évidence. Il conviendrait d’évaluer l’application clinique d’une sélection de patient en appliquant ces derniers.},
	language = {français},
	school = {Université de Lille},
	author = {Wyttynck, Claire},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2018},
	keywords = {Arthroplastie, Arthroplastie -- Thèses et écrits académiques, Arthroplastie de hanche, Arthroplastie prothétique de hanche -- Dissertation universitaire, Articulation coxo-fémorale -- Chirurgie, Articulation coxo-fémorale -- Chirurgie -- Thèses et écrits académiques, Bases de données factuelles -- France -- Dissertation universitaire, Durée du séjour -- France -- Dissertation universitaire, Hôpitaux -- Durée du séjour -- France, Hôpitaux -- Durée du séjour -- France -- Thèses et écrits académiques, PMSI, Programme de médicalisation des systèmes d'information, Programme de médicalisation des systèmes d'information -- Thèses et écrits académiques, courts séjours, révision de hanche},
}

Contexte : Se mettent en place dans tous les pays industrialisés des parcours de prise en charge chirurgicales optimisés pour réduire les durée de séjours. En France une incitation au développement de la chirurgie ambulatoire est faite. Objectif : Notre objectif est de déterminer les facteurs associés aux séjours courts. Matériel et Méthodes : Nous avons réalisé une étude rétrospective par analyse de la base de données hospitalière nationale du Programme de Médicalisation des Systèmes d'Information (PMSI) entre janvier 2008 et décembre 2014. Nous avons inclus par l’utilisation des codes CCAM, tous les séjours relatifs à une arthroplastie de hanche primaire ou de reprise. Puis nous avons scindé la population en deux groupes, l’un ayant des séjours courts (1 à 5 journées) et l’autre ayant des durées de séjours supérieures. Nous avons ensuite comparé les données démographiques et médicales de ces groupes et identifié par une régression logistique les facteurs associés aux séjours courts. Résultats : Les facteurs associés à une prise en charge courte dépendent des sous-groupes de prise en charge (étiologie, intervention programmée). Les facteurs récurrents sont le volume d’activité de l’établissement, le statut privé de l’établissement, l’âge du patient et les indications opératoires. Conclusion : Des facteurs objectifs associés à une réduction de la durée de séjour ont pu être mis en évidence. Il conviendrait d’évaluer l’application clinique d’une sélection de patient en appliquant ces derniers.

@phdthesis{poline_utilisation_2018,
	address = {2018-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Utilisation du test de détection rapide dans l’angine chez les moins de 3 ans: analyse de pratiques d’un cabinet de médecine générale},
	shorttitle = {Utilisation du test de détection rapide dans l’angine chez les moins de 3 ans},
	abstract = {Contexte : L’angine est l’un des motifs de consultation de médecine générale les plus fréquents. Les angines à Streptocoque du Groupe A (SGA) nécessitent une prise en charge par antibiothérapie, le Test de Détection Rapide (TDR) permettant leur dépistage. Les recommandations actuelles préconisent la réalisation du TDR à partir de l’âge de 3 ans, les angines étant considérées comme virales avant cet âge. Objectif : L’objectif de ce travail est d’étudier la prévalence de l’angine à TDR positif dans la population des moins de 3 ans. Matériel et Méthodes : Nous avons réalisé une étude rétrospective par analyse de la base de données d’un cabinet de groupe, entre janvier 2006 et juin 2018. Nous avons inclus tous les enfants de moins de 3 ans ayant consulté pour une angine. Nous avons analysé les symptômes associés, les résultats du TDR et la prescription médicamenteuse. Résultats : Un TDR a été réalisé dans 87,7\% des cas et 19\% d’entre eux sont revenus positifs (les facteurs de risque étant l’âge (Odd Ratio (OR) = 1,26) et l’année (OR = 1,36)). Une ordonnance a été établie dans 99\% des cas et un antibiotique a été prescrit dans 21,4\% des cas (62.4\% en cas de TDR positif, 8,27\% en cas de TRD négatif et 41,6\% en l’absence de TDR). Le taux de positivation du test au cours d’une reconsultation était de 2,39\%. 14 cas de scarlatine ont été diagnostiqués au cours de cette période. Indépendamment de l’âge, 2 cas de rhumatisme articulaire aigu ont été observé. Conclusion : Cette étude ne permet pas de juger les recommandations actuelles car elle ne nous permet pas de juger avec certitude l’origine bactérienne de l’angine. Par ailleurs nos résultats remettent en cause l’affirmation que les angines sont virales avant l’âge de 3 ans.},
	language = {français},
	school = {Université de Lille},
	author = {Poline, Charlotte},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2018},
	keywords = {Angine, Angine -- Chez le nourrisson, Angine -- Chez le nourrisson -- Thèses et écrits académiques, Angine -- Diagnostic, Angine -- Diagnostic -- Thèses et écrits académiques, Angine -- Épidémiologie, Angine -- Épidémiologie -- Thèses et écrits académiques, Médecine -- Pratique, Médecine -- Pratique -- Thèses et écrits académiques, Pharyngite -- Nourrisson -- Dissertation universitaire, Pharyngite -- diagnostic -- Dissertation universitaire, Pharyngite -- épidémiologie -- Dissertation universitaire, Pratique professionnelle -- Dissertation universitaire, Tests de diagnostic rapide, Tests de diagnostic rapide -- Thèses et écrits académiques, Tests diagnostiques courants -- Dissertation universitaire, enfants de moins de 3 ans, scarlatine, streptocoque du groupe A, test de détection rapide},
}

Contexte : L’angine est l’un des motifs de consultation de médecine générale les plus fréquents. Les angines à Streptocoque du Groupe A (SGA) nécessitent une prise en charge par antibiothérapie, le Test de Détection Rapide (TDR) permettant leur dépistage. Les recommandations actuelles préconisent la réalisation du TDR à partir de l’âge de 3 ans, les angines étant considérées comme virales avant cet âge. Objectif : L’objectif de ce travail est d’étudier la prévalence de l’angine à TDR positif dans la population des moins de 3 ans. Matériel et Méthodes : Nous avons réalisé une étude rétrospective par analyse de la base de données d’un cabinet de groupe, entre janvier 2006 et juin 2018. Nous avons inclus tous les enfants de moins de 3 ans ayant consulté pour une angine. Nous avons analysé les symptômes associés, les résultats du TDR et la prescription médicamenteuse. Résultats : Un TDR a été réalisé dans 87,7% des cas et 19% d’entre eux sont revenus positifs (les facteurs de risque étant l’âge (Odd Ratio (OR) = 1,26) et l’année (OR = 1,36)). Une ordonnance a été établie dans 99% des cas et un antibiotique a été prescrit dans 21,4% des cas (62.4% en cas de TDR positif, 8,27% en cas de TRD négatif et 41,6% en l’absence de TDR). Le taux de positivation du test au cours d’une reconsultation était de 2,39%. 14 cas de scarlatine ont été diagnostiqués au cours de cette période. Indépendamment de l’âge, 2 cas de rhumatisme articulaire aigu ont été observé. Conclusion : Cette étude ne permet pas de juger les recommandations actuelles car elle ne nous permet pas de juger avec certitude l’origine bactérienne de l’angine. Par ailleurs nos résultats remettent en cause l’affirmation que les angines sont virales avant l’âge de 3 ans.

@phdthesis{toto_rhinoplasties_2018,
	address = {2018-...., France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Les rhinoplasties esthétiques en {France}: étude de la base nationale du {PMSI} de 2008 à 2014},
	shorttitle = {Les rhinoplasties esthétiques en {France}},
	abstract = {Contexte : L'épidémiologie des rhinoplasties esthétiques en France est peu connue et les seules données proviennent d'études déclaratives internationales. L'objectif de l'étude est de décrire les caractéristiques des patients ayant subi une rhinoplastie esthétique en France de 2008 à 2014, la répartition géographique et l'évolution au cours de la période, à partir de la base de données française exhaustive des sorties d'hôpitaux (PMSI). Matériel et Méthodes : Tous les séjours hospitaliers à des fins de rhinoplastie esthétique dans les hôpitaux français ont été enregistrés sur une période allant de 2008 à 2014. Les patients de moins de 16 ans ont été exclus. Résultats : De 2008 à 2014, 22 522 séjours hospitaliers pour rhinoplastie esthétique ont été réalisés, dont 85\% dans des hôpitaux à but lucratif, 24,5\% dans des cabinets ambulatoires. L'âge moyen des patients était de 32,9 ans et 81,2\% d'entre eux étaient des femmes. Parmi ces patients, 8,1\% ont nécessité une autre intervention chirurgicale. La distribution géographique a montré une hospitalisation plus standardisée de la rhinoplastie esthétique dans le sud de la France. Le taux de réadmission cumulé pour la correction de la rhinoplastie était estimé à 2,71\% à 1 an, à 5,41\% à 2 ans et à 11,26\% à 5 ans. Conclusion : La rhinoplastie esthétique est principalement réalisée chez les jeunes femmes. Il existe un gradient ascendant nord-sud évident de l’incidence de cette chirurgie, et ces résultats correspondent aux données de la littérature.},
	language = {français},
	school = {Université de Lille},
	author = {Toto, Mélissa},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2018},
	keywords = {Chirurgie plastique, Chirurgie plastique -- Dissertation universitaire, Chirurgie plastique -- Thèses et écrits académiques, Programme de médicalisation des systèmes d'information, Programme de médicalisation des systèmes d'information -- Thèses et écrits académiques, Rhinoplastie -- France, Rhinoplastie -- France -- Dissertation universitaire, Rhinoplastie -- France -- Thèses et écrits académiques, Rhinoplastie -- statistiques et données numériques -- Dissertation universitaire, chirurgie esthétique, chirurgie plastique, rhinoplasties, Épidémiologie, épidémiologie},
}

Contexte : L'épidémiologie des rhinoplasties esthétiques en France est peu connue et les seules données proviennent d'études déclaratives internationales. L'objectif de l'étude est de décrire les caractéristiques des patients ayant subi une rhinoplastie esthétique en France de 2008 à 2014, la répartition géographique et l'évolution au cours de la période, à partir de la base de données française exhaustive des sorties d'hôpitaux (PMSI). Matériel et Méthodes : Tous les séjours hospitaliers à des fins de rhinoplastie esthétique dans les hôpitaux français ont été enregistrés sur une période allant de 2008 à 2014. Les patients de moins de 16 ans ont été exclus. Résultats : De 2008 à 2014, 22 522 séjours hospitaliers pour rhinoplastie esthétique ont été réalisés, dont 85% dans des hôpitaux à but lucratif, 24,5% dans des cabinets ambulatoires. L'âge moyen des patients était de 32,9 ans et 81,2% d'entre eux étaient des femmes. Parmi ces patients, 8,1% ont nécessité une autre intervention chirurgicale. La distribution géographique a montré une hospitalisation plus standardisée de la rhinoplastie esthétique dans le sud de la France. Le taux de réadmission cumulé pour la correction de la rhinoplastie était estimé à 2,71% à 1 an, à 5,41% à 2 ans et à 11,26% à 5 ans. Conclusion : La rhinoplastie esthétique est principalement réalisée chez les jeunes femmes. Il existe un gradient ascendant nord-sud évident de l’incidence de cette chirurgie, et ces résultats correspondent aux données de la littérature.

@phdthesis{dugast_implantation_2017,
	address = {Lille ; 1969-2017, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Implantation de dispositifs d’assistance ventriculaire en {France} de 2008 à 2014: étude de la base nationale du {PMSI}},
	shorttitle = {Implantation de dispositifs d’assistance ventriculaire en {France} de 2008 à 2014},
	abstract = {De nombreuses études réalisées à partir de base de données administratives aux Etats-Unis ont montré une augmentation importante de l'implantation des dispositifs d'assistance ventriculaire (DAV) au cours des dernières années. L'objectif de cette étude était d'utiliser la base de données du PMSI afin de décrire l'évolution du nombre d'implantation, des caractéristiques des patients, la durée de séjour et la mortalité des patients bénéficiant d'un dispositif d'assistance ventriculaire implantable (DAVI) en France de 2008 à 2014. Matériel et Méthodes : Nous avons réalisé une étude rétrospective à partir des données du PMSI. Nous avons recherché sur cette base de données tous les séjours hospitaliers des patients ayant bénéficié d'un DAVI en France de janvier 2008 à décembre 2014 Résultats : Le nombre d'implantation annuel de DAV a augmenté de 72 en 2008 à 181 en 2014. 82\% des patients implantés étaient des hommes. La durée moyenne du séjour hospitalier était de 64,3 jours et la durée moyenne de séjour en réanimation est passée de 58,1 jours en 2008 à 37,8 jours en 2014 (p{\textless}0.01). La mortalité à 30 jours était de 15,6\% sans variation significative de 2008 à 2014. Conclusion : L'implantation de DAV a augmenté considérablement en France depuis 2008. Cependant les résultats retrouvés concernant la mortalité à partir du PMSI ne semblent pas en adéquation avec ceux retrouvés dans la littérature notamment dans le rapport INTERMACS et de nombreuses erreurs de codage apparentes semblent parasiter nos résultats.},
	language = {français},
	school = {Université du droit et de la santé},
	author = {Dugast, Jean-Baptiste},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2017},
	keywords = {Assistance circulatoire mécanique -- instrumentation -- Dissertation universitaire, Bases de données factuelles -- statistiques et données numériques -- France -- Dissertation universitaire, Coeurs artificiels, Coeurs artificiels -- Thèses et écrits académiques, Dispositifs d'assistance circulatoire -- Dissertation universitaire, Dispositifs médicaux implantables, Dispositifs médicaux implantables -- Thèses et écrits académiques, Défaillance cardiaque -- chirurgie -- Dissertation universitaire, Insuffisance cardiaque -- Chirurgie, Insuffisance cardiaque -- Chirurgie -- Thèses et écrits académiques, PMSI, Programme de médicalisation des systèmes d'information, Programme de médicalisation des systèmes d'information -- Thèses et écrits académiques, dispositifs d’assistance ventriculaire, insuffisance cardiaque},
}

De nombreuses études réalisées à partir de base de données administratives aux Etats-Unis ont montré une augmentation importante de l'implantation des dispositifs d'assistance ventriculaire (DAV) au cours des dernières années. L'objectif de cette étude était d'utiliser la base de données du PMSI afin de décrire l'évolution du nombre d'implantation, des caractéristiques des patients, la durée de séjour et la mortalité des patients bénéficiant d'un dispositif d'assistance ventriculaire implantable (DAVI) en France de 2008 à 2014. Matériel et Méthodes : Nous avons réalisé une étude rétrospective à partir des données du PMSI. Nous avons recherché sur cette base de données tous les séjours hospitaliers des patients ayant bénéficié d'un DAVI en France de janvier 2008 à décembre 2014 Résultats : Le nombre d'implantation annuel de DAV a augmenté de 72 en 2008 à 181 en 2014. 82% des patients implantés étaient des hommes. La durée moyenne du séjour hospitalier était de 64,3 jours et la durée moyenne de séjour en réanimation est passée de 58,1 jours en 2008 à 37,8 jours en 2014 (p\textless0.01). La mortalité à 30 jours était de 15,6% sans variation significative de 2008 à 2014. Conclusion : L'implantation de DAV a augmenté considérablement en France depuis 2008. Cependant les résultats retrouvés concernant la mortalité à partir du PMSI ne semblent pas en adéquation avec ceux retrouvés dans la littérature notamment dans le rapport INTERMACS et de nombreuses erreurs de codage apparentes semblent parasiter nos résultats.

@phdthesis{bonte-bossuyt_epidemiologie_2017,
	address = {Lille ; 1969-2017, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Epidémiologie de la césarienne en {France}: analyse de la base nationale du {PMSI} de 2008 à 2014},
	shorttitle = {Epidémiologie de la césarienne en {France}},
	abstract = {Contexte. La césarienne figure parmi les actes chirurgicaux les plus pratiqués au monde. Le taux de césariennes n’a cessé d’augmenter depuis les années 1980. L’objectif de cette étude est de décrire l’épidémiologie de la césarienne en France entre 2008 et 2014. Méthode. Nous avons utilisé les données nationales du Programme de Médicalisation des Systèmes d’Information (PMSI). Les césariennes ont été identifiées par trois codes CCAM correspondant aux césariennes programmées et non programmées. Résultats. 1 160 856 séjours ont été analysés sur la période. Le taux de césariennes est resté stable entre 20,2 et 20,5\% avec un nombre maximum de césariennes en 2010 puis une diminution, coïncident avec une baisse de la natalité en France. L’âge maternel a augmenté passant de 30,9 ans en moyenne en 2008 à 31,5 ans en 2014 (p {\textless} 0,05). La durée de séjour a diminué lors de ces sept années passant de 8,3 jours en moyenne en 2008 à 7,7 jours en moyenne en 2014 (p {\textless} 0,05). 35,5\% des femmes ayant une césarienne avaient une césarienne programmée et 64,5\% une césarienne en urgence avec diminution du taux de césariennes programmées. Les indications les plus fréquentes de césariennes programmées étaient l’antécédent de césarienne (45,9\%) et les anomalies de présentation ou disproportions foeto-maternelles (33,8\%) alors pour les césariennes en urgence, les indications les plus courantes étaient les dystocies (41,1\%) et la détresse foetale (37,3\%). Quant aux complications, celles concernant l’allaitement (18,2\%) étaient en tête suivies par les hémorragies (3,8\%), les complications psychiatriques (2,3\%) et infectieuses (2\%). Conclusion. Le taux de césariennes est resté stable en France depuis 2008. L’âge maternel augmente alors que la durée de séjour diminue.},
	language = {français},
	school = {Université du droit et de la santé},
	author = {Bonte-Bossuyt, Cécile},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2017},
	keywords = {Base de données -- France -- Dissertation universitaire, Césarienne, Césarienne -- France, Césarienne -- France -- Dissertation universitaire, Césarienne -- France -- Thèses et écrits académiques, Césarienne -- statistiques et données numériques -- Dissertation universitaire, PMSI, Programme de médicalisation des systèmes d'information, Programme de médicalisation des systèmes d'information -- Thèses et écrits académiques, base de données nationale, épidémiologie},
}

Contexte. La césarienne figure parmi les actes chirurgicaux les plus pratiqués au monde. Le taux de césariennes n’a cessé d’augmenter depuis les années 1980. L’objectif de cette étude est de décrire l’épidémiologie de la césarienne en France entre 2008 et 2014. Méthode. Nous avons utilisé les données nationales du Programme de Médicalisation des Systèmes d’Information (PMSI). Les césariennes ont été identifiées par trois codes CCAM correspondant aux césariennes programmées et non programmées. Résultats. 1 160 856 séjours ont été analysés sur la période. Le taux de césariennes est resté stable entre 20,2 et 20,5% avec un nombre maximum de césariennes en 2010 puis une diminution, coïncident avec une baisse de la natalité en France. L’âge maternel a augmenté passant de 30,9 ans en moyenne en 2008 à 31,5 ans en 2014 (p \textless 0,05). La durée de séjour a diminué lors de ces sept années passant de 8,3 jours en moyenne en 2008 à 7,7 jours en moyenne en 2014 (p \textless 0,05). 35,5% des femmes ayant une césarienne avaient une césarienne programmée et 64,5% une césarienne en urgence avec diminution du taux de césariennes programmées. Les indications les plus fréquentes de césariennes programmées étaient l’antécédent de césarienne (45,9%) et les anomalies de présentation ou disproportions foeto-maternelles (33,8%) alors pour les césariennes en urgence, les indications les plus courantes étaient les dystocies (41,1%) et la détresse foetale (37,3%). Quant aux complications, celles concernant l’allaitement (18,2%) étaient en tête suivies par les hémorragies (3,8%), les complications psychiatriques (2,3%) et infectieuses (2%). Conclusion. Le taux de césariennes est resté stable en France depuis 2008. L’âge maternel augmente alors que la durée de séjour diminue.

@phdthesis{georges_mise_2017,
	address = {Lille ; 1969-2017, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Mise au point d'un framework d'analyses statistiques pour la réutilisation des bases de données médico-administratives},
	abstract = {Contexte : De nombreuses études épidémiologiques reposent désormais sur la réutilisation de bases de données médico-administratives, même si ces dernières sont encore sous-exploitées. Dans ces études, la majeure partie du temps est consacrée au data management et aux analyses statistiques de base, ne laissant que peu de place pour l’analyse statistique et médicale plus complexe. L’objectif de ce travail était de mettre au point un framework d’analyses statistiques pour faciliter la réutilisation des bases de données médico-administratives. Méthodes : Une revue de la littérature réalisée sur Pubmed a permis d’identifier les indicateurs épidémiologiques les plus fréquents. Elle a été réalisée sur 5 thématiques différentes : les césariennes, les cholécystectomies, les dispositifs d’assistance ventriculaire, les chirurgies de prothèses de hanche et la chirurgie bariatrique. Ces indicateurs ont ensuite été abstraits et ont inspiré le développement de fonctions informatiques programmées en langage R. Ces fonctions visent à traiter et analyser statistiquement des données médicales. Résultats : Au total, 52 articles ont été identifiés concernant l’analyse de grandes bases de données. Des indicateurs épidémiologiques ont ainsi pu être abstraits en fonctionnalités mises en oeuvre au travers de 32 fonctions accessibles à l’utilisateur. Par exemple, une fonction qui affiche un histogramme, calcule la moyenne avec l’intervalle de confiance, les quantiles, etc. Ces fonctions comprennent 4 fonctions de data management, 9 fonctions pour l’analyse univariée, 8 pour l’analyse bivariée, 11 pour l’analyse multivariée et de nombreuses fonctions intermédiaires. Conclusion : Ces fonctions ont été utilisées avec succès pour analyser la base de données nationale du Programme de Médicalisation des Systèmes d’Information composée de 250 millions de séjours hospitaliers. Ce panel de fonctions prêtes à l’emploi a permis de sécuriser les tâches répétitives et de recentrer les efforts sur l’analyse médicale.},
	language = {français},
	school = {Université du droit et de la santé},
	author = {Georges, Alexandre},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2017},
	keywords = {Bases de données médico-administratives, Informatique médicale -- Dissertation universitaire, Médecine -- Informatique, Médecine -- Informatique -- Thèses et écrits académiques, Santé publique -- Enquêtes, Santé publique -- Enquêtes -- Thèses et écrits académiques, Statistiques médicales, Statistiques médicales -- Thèses et écrits académiques, programmation en statistiques, statistiques, Échange d'informations de santé -- Dissertation universitaire, Études épidémiologiques -- Dissertation universitaire, épidémiologie des soins},
}

Contexte : De nombreuses études épidémiologiques reposent désormais sur la réutilisation de bases de données médico-administratives, même si ces dernières sont encore sous-exploitées. Dans ces études, la majeure partie du temps est consacrée au data management et aux analyses statistiques de base, ne laissant que peu de place pour l’analyse statistique et médicale plus complexe. L’objectif de ce travail était de mettre au point un framework d’analyses statistiques pour faciliter la réutilisation des bases de données médico-administratives. Méthodes : Une revue de la littérature réalisée sur Pubmed a permis d’identifier les indicateurs épidémiologiques les plus fréquents. Elle a été réalisée sur 5 thématiques différentes : les césariennes, les cholécystectomies, les dispositifs d’assistance ventriculaire, les chirurgies de prothèses de hanche et la chirurgie bariatrique. Ces indicateurs ont ensuite été abstraits et ont inspiré le développement de fonctions informatiques programmées en langage R. Ces fonctions visent à traiter et analyser statistiquement des données médicales. Résultats : Au total, 52 articles ont été identifiés concernant l’analyse de grandes bases de données. Des indicateurs épidémiologiques ont ainsi pu être abstraits en fonctionnalités mises en oeuvre au travers de 32 fonctions accessibles à l’utilisateur. Par exemple, une fonction qui affiche un histogramme, calcule la moyenne avec l’intervalle de confiance, les quantiles, etc. Ces fonctions comprennent 4 fonctions de data management, 9 fonctions pour l’analyse univariée, 8 pour l’analyse bivariée, 11 pour l’analyse multivariée et de nombreuses fonctions intermédiaires. Conclusion : Ces fonctions ont été utilisées avec succès pour analyser la base de données nationale du Programme de Médicalisation des Systèmes d’Information composée de 250 millions de séjours hospitaliers. Ce panel de fonctions prêtes à l’emploi a permis de sécuriser les tâches répétitives et de recentrer les efforts sur l’analyse médicale.

@phdthesis{ioos_amygdalectomie_2017,
	address = {Lille ; 1969-2017, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {L'amygdalectomie en population pédiatrique en {France}: analyse de la base nationale du {PMSI} de 2008 à 2014},
	shorttitle = {L'amygdalectomie en population pédiatrique en {France}},
	abstract = {Contexte : L’amygdalectomie est une des chirurgies les plus pratiquées chez l’enfant dans les pays développés, et ses indications ont évolué ces dernières décennies. L’objectif de cette étude est d’étudier l’épidémiologie de l’amygdalectomie chez les enfants en France de 2008 à 2014. Matériel et Méthodes : En utilisant la base nationale du Programme de Médicalisation des Systèmes d’Information (PMSI) pour les années 2008 à 2014, nous avons identifié tous les patients d’âge inférieur à 18 ans opérés d’une amygdalectomie en utilisant la Classification Commune des Actes Médicaux (CCAM). Nous avons analysé les données démographiques des patients, le diagnostic principal, la durée de séjour, le type d’hôpital, le type de chirurgie et la mortalité intra-hospitalière. Résultats : De 2008 à 2014, il y a eu 371 863 amygdalectomies (incluant 57\% d’adénoamygdalectomie, 31\% d’adéno-amygdalectomie avec chirurgie tympanique et 12\% d’amygdalectomie isolée). Le taux d’incidence annuel est resté stable entre 173 et 201 pour 100 000. L’âge moyen des enfants était de 6,16 ans. Cinquante-quatre pourcent des opérations ont concerné des garçons. Les principales causes d’amygdalectomie étaient les pathologies hypertrophiques (amygdales et/ou végétations) responsables de troubles respiratoires du sommeil (74,5\%) et les causes infectieuses (21,5\%). La proportion de causes obstructives a augmenté de 68,2\% en 2008 à 79,7\% en 2014. Les enfants du groupe 0-6 ans et 7-12 ans étaient plus souvent opérés pour pathologie hypertrophique que les plus âgés (13-18 ans) (77,4\% et 73,3\% contre 55,9\%) ; à l’inverse des causes infectieuses (respectivement 17,9\% et 23,8\% contre 41,8\%). La durée moyenne de séjour des patients hospitalisés a diminué de 1,07 jour en 2008 à 0,97 jour en 2014. La proportion de séjours ambulatoires augmentait, passant de 23,2\% à 27,0\% sur la durée de l’étude ; et était plus importante en secteur privé qu’en public (28,6\% contre 18,1\%). Un passage en soins continus a été nécessaire pour 0,48\% des patients et la mortalité a concerné douze séjours hospitaliers. Conclusion : Le nombre d’amygdalectomie avec ou sans geste associé est resté stable, avec une proportion croissante des causes hypertrophiques, résultant des restrictions récentes des indications infectieuses, et plus importante chez les jeunes enfants témoignant d’une prise en charge plus précoce. Le taux d’ambulatoire augmente mais reste encore bas.},
	language = {français},
	school = {Université du droit et de la santé},
	author = {Ioos, Barthélemy},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2017},
	keywords = {Amygdalectomie, Amygdalectomie -- Adolescent -- Dissertation universitaire, Amygdalectomie -- Enfant -- Dissertation universitaire, Amygdalectomie -- Enfant d'âge préscolaire -- Dissertation universitaire, Amygdalectomie -- Nourrisson -- Dissertation universitaire, Amygdalectomie -- Statistiques, Amygdalectomie -- Statistiques -- Thèses et écrits académiques, Amygdalectomie -- statistiques et données numériques -- France -- Dissertation universitaire, Chirurgie pédiatrique -- France, Chirurgie pédiatrique -- France -- Thèses et écrits académiques, Programme de médicalisation des systèmes d'information, Programme de médicalisation des systèmes d'information -- Thèses et écrits académiques, adénoïdectomie, base de données nationales, épidémiologie},
}

Contexte : L’amygdalectomie est une des chirurgies les plus pratiquées chez l’enfant dans les pays développés, et ses indications ont évolué ces dernières décennies. L’objectif de cette étude est d’étudier l’épidémiologie de l’amygdalectomie chez les enfants en France de 2008 à 2014. Matériel et Méthodes : En utilisant la base nationale du Programme de Médicalisation des Systèmes d’Information (PMSI) pour les années 2008 à 2014, nous avons identifié tous les patients d’âge inférieur à 18 ans opérés d’une amygdalectomie en utilisant la Classification Commune des Actes Médicaux (CCAM). Nous avons analysé les données démographiques des patients, le diagnostic principal, la durée de séjour, le type d’hôpital, le type de chirurgie et la mortalité intra-hospitalière. Résultats : De 2008 à 2014, il y a eu 371 863 amygdalectomies (incluant 57% d’adénoamygdalectomie, 31% d’adéno-amygdalectomie avec chirurgie tympanique et 12% d’amygdalectomie isolée). Le taux d’incidence annuel est resté stable entre 173 et 201 pour 100 000. L’âge moyen des enfants était de 6,16 ans. Cinquante-quatre pourcent des opérations ont concerné des garçons. Les principales causes d’amygdalectomie étaient les pathologies hypertrophiques (amygdales et/ou végétations) responsables de troubles respiratoires du sommeil (74,5%) et les causes infectieuses (21,5%). La proportion de causes obstructives a augmenté de 68,2% en 2008 à 79,7% en 2014. Les enfants du groupe 0-6 ans et 7-12 ans étaient plus souvent opérés pour pathologie hypertrophique que les plus âgés (13-18 ans) (77,4% et 73,3% contre 55,9%) ; à l’inverse des causes infectieuses (respectivement 17,9% et 23,8% contre 41,8%). La durée moyenne de séjour des patients hospitalisés a diminué de 1,07 jour en 2008 à 0,97 jour en 2014. La proportion de séjours ambulatoires augmentait, passant de 23,2% à 27,0% sur la durée de l’étude ; et était plus importante en secteur privé qu’en public (28,6% contre 18,1%). Un passage en soins continus a été nécessaire pour 0,48% des patients et la mortalité a concerné douze séjours hospitaliers. Conclusion : Le nombre d’amygdalectomie avec ou sans geste associé est resté stable, avec une proportion croissante des causes hypertrophiques, résultant des restrictions récentes des indications infectieuses, et plus importante chez les jeunes enfants témoignant d’une prise en charge plus précoce. Le taux d’ambulatoire augmente mais reste encore bas.

@phdthesis{girier_epidemiologie_2017,
	address = {Lille ; 1969-2017, France},
	title = {Épidémiologie de la pose de prothèses de hanche en {France}: analyse de la base nationale du {PMSI} de 2008 à 2014},
	shorttitle = {Épidémiologie de la pose de prothèses de hanche en {France}},
	abstract = {Contexte : l’incidence de l’arthroplastie de hanche est en augmentation en France. L’objectif de ce travail était d’étudier l’épidémiologie de la pose de prothèses de hanche en France de 2008 à 2014. Méthodes : en utilisant la base de données hospitalière nationale du Programme de Médicalisation des Systèmes d'Information (PMSI) pour les années 2008 à 2014, nous avons identifié tous les patients opérés d’une pose de prothèse de hanche en utilisant la Classification Commune des Actes Médicaux (CCAM). Nous avons analysé les données démographiques des patients, la durée de séjour, le diagnostic principal, le type d’hôpital, le type de prothèse et la mortalité hospitalière. Résultats : de 2008 à 2014, il y a eu 1 049 637 arthroplasties de hanche (incluant les arthroplasties primaires par prothèse totale, les hémiarthroplasties primaires, et les arthroplasties de remplacement). Le taux d'incidence annuel est passé de 222 en 2008 à 241 pour 100 000 habitants en 2014. L'âge moyen des patients était de 72,8 ans. Soixante pour cent des arthroplasties de la hanche ont été effectuées chez des femmes. Les principales causes de pose de prothèses de hanche étaient l'arthrose (62 \%), les fractures (23,8 \%) et les complications mécaniques des prothèses (8,3 \%). Il y a eu 72,1 \% d'arthroplasties primaires par prothèses totales de la hanche, 16,7 \% d'hémiarthroplasties primaires et 11,6 \% d'arthroplasties de révision. La durée moyenne de séjour des patients hospitalisés était de 11,2 jours et 1,28 \% des patients a passé au moins une journée dans une unité de soins intensifs. Dans l'ensemble, 45,6 \% des arthroplasties de hanche ont été effectuées dans des hôpitaux sans but lucratif. La mortalité intrahospitalière est passée de 1,26 \% en 2008 à 0,96 \% en 2014. Conclusion : l'augmentation de l'incidence du remplacement de la hanche était principalement le résultat de l'augmentation des arthroplasties de hanche pour arthrose, ce qui pourrait être lié au vieillissement de la population et à l'augmentation de l'indice de masse corporelle.},
	language = {français},
	author = {Girier, Nicolas},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2017},
	keywords = {Hôpitaux -- Informatique, Hôpitaux -- Informatique -- Thèses et écrits académiques, Informatique en santé publique -- Dissertation universitaire, Prothèse de hanche -- Dissertation universitaire, Prothèses de hanche, Prothèses de hanche -- Thèses et écrits académiques, Santé publique -- Enquêtes, Santé publique -- Enquêtes -- Thèses et écrits académiques, arthroplastie de hanche, base de données nationale, coxarthrose, fracture du col du fémur, hémiarthroplastie, prothèse de hanche, prothèse totale de hanche, révision de prothèse de hanche, Études épidémiologiques -- Dissertation universitaire, épidémiologie},
}

Contexte : l’incidence de l’arthroplastie de hanche est en augmentation en France. L’objectif de ce travail était d’étudier l’épidémiologie de la pose de prothèses de hanche en France de 2008 à 2014. Méthodes : en utilisant la base de données hospitalière nationale du Programme de Médicalisation des Systèmes d'Information (PMSI) pour les années 2008 à 2014, nous avons identifié tous les patients opérés d’une pose de prothèse de hanche en utilisant la Classification Commune des Actes Médicaux (CCAM). Nous avons analysé les données démographiques des patients, la durée de séjour, le diagnostic principal, le type d’hôpital, le type de prothèse et la mortalité hospitalière. Résultats : de 2008 à 2014, il y a eu 1 049 637 arthroplasties de hanche (incluant les arthroplasties primaires par prothèse totale, les hémiarthroplasties primaires, et les arthroplasties de remplacement). Le taux d'incidence annuel est passé de 222 en 2008 à 241 pour 100 000 habitants en 2014. L'âge moyen des patients était de 72,8 ans. Soixante pour cent des arthroplasties de la hanche ont été effectuées chez des femmes. Les principales causes de pose de prothèses de hanche étaient l'arthrose (62 %), les fractures (23,8 %) et les complications mécaniques des prothèses (8,3 %). Il y a eu 72,1 % d'arthroplasties primaires par prothèses totales de la hanche, 16,7 % d'hémiarthroplasties primaires et 11,6 % d'arthroplasties de révision. La durée moyenne de séjour des patients hospitalisés était de 11,2 jours et 1,28 % des patients a passé au moins une journée dans une unité de soins intensifs. Dans l'ensemble, 45,6 % des arthroplasties de hanche ont été effectuées dans des hôpitaux sans but lucratif. La mortalité intrahospitalière est passée de 1,26 % en 2008 à 0,96 % en 2014. Conclusion : l'augmentation de l'incidence du remplacement de la hanche était principalement le résultat de l'augmentation des arthroplasties de hanche pour arthrose, ce qui pourrait être lié au vieillissement de la population et à l'augmentation de l'indice de masse corporelle.

@phdthesis{martincic_chirurgie_2017,
	address = {Lille ; 1969-2017, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {La chirurgie bariatrique en {France} de 2008 à 2014: techniques, complications, et préférences des chirurgiens : analyse de la base nationale du {PMSI}},
	shorttitle = {La chirurgie bariatrique en {France} de 2008 à 2014},
	abstract = {Contexte : La chirurgie bariatrique a connu un véritable essor sur les dix dernières années. L’objectif de ce travail était d’étudier l’épidémiologie de la chirurgie bariatrique, en France, de 2008 à 2014. Méthodes : En utilisant la base de données hospitalière nationale du Programme de Médicalisation des Systèmes d'Information (PMSI) pour les années 2008 à 2014, nous avons identifié tous les patients ayant bénéficié d’une intervention de chirurgie bariatrique, en utilisant la Classification Commune des Actes Médicaux (CCAM). Nous avons analysé les données démographiques des patients, la durée de séjour intra hospitalière, la durée de séjour en soins intensifs, le diagnostic principal, le type d’hôpital privé/public, la technique chirurgicale utilisée et la mortalité hospitalière. Nous avons également étudié les facteurs influençant le choix de la technique chirurgicale, ainsi que les facteurs prédictifs d’une réadmission hospitalière après intervention. Résultats : 226443 patients ont bénéficié d’une intervention de chirurgie bariatrique entre 2008 et 2014. Ils avaient un âge moyen de 40 ans, et étaient des femmes dans 82.9\% des cas. La durée moyenne de séjour était de 6 jours. Plus de 50\% des patients avaient un IMC entre 40 et 50 kg/m2. 60,7 \% d’entre eux ont reçu une intervention de Sleeve gastrectomie. La mortalité intra hospitalière était de 0,05\%. Moins de 5\% des patients ont passé au moins 1 jour en réanimation. 5\% des patients ont été ré hospitalisés à 6 mois de l’intervention en lien avec une complication, et 25,7\% à 5 ans. Conclusion : le nombre d’interventions de chirurgie bariatrique a été multiplié par 2,7 de 2008 à 2014, en lien avec un accroissement de la prévalence de l’obésité, et l’amélioration des techniques chirurgicales. Les patients étaient majoritairement des femmes, mais cette proportion a diminué au fil des années. De même, l’âge moyen des patients a augmenté de 38,9 à 41,0 en 2014. La Sleeve gastrectomie était la technique la plus privilégiée en 2014. Cependant, l’anneau gastrique ajustable était préféré pour : les patients jeunes, ayant un IMC faible, en l’absence de diabète, de maladie psychiatrique, ou pathologie oesophagienne, opérés dans les hôpitaux privés.},
	language = {français},
	school = {Université du droit et de la santé},
	author = {Martincic, Claire},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2017},
	keywords = {Base de données -- France -- Dissertation universitaire, Chirurgie bariatrique, Chirurgie bariatrique -- France -- Dissertation universitaire, Chirurgie bariatrique -- statistiques et données numériques -- Dissertation universitaire, Obésité -- Chirurgie -- France, Obésité -- Chirurgie -- France -- Thèses et écrits académiques, PMSI, Programme de médicalisation des systèmes d'information, Programme de médicalisation des systèmes d'information -- Thèses et écrits académiques, base de données nationale, chirurgie bariatrique, obésité, épidémiologie},
}

Contexte : La chirurgie bariatrique a connu un véritable essor sur les dix dernières années. L’objectif de ce travail était d’étudier l’épidémiologie de la chirurgie bariatrique, en France, de 2008 à 2014. Méthodes : En utilisant la base de données hospitalière nationale du Programme de Médicalisation des Systèmes d'Information (PMSI) pour les années 2008 à 2014, nous avons identifié tous les patients ayant bénéficié d’une intervention de chirurgie bariatrique, en utilisant la Classification Commune des Actes Médicaux (CCAM). Nous avons analysé les données démographiques des patients, la durée de séjour intra hospitalière, la durée de séjour en soins intensifs, le diagnostic principal, le type d’hôpital privé/public, la technique chirurgicale utilisée et la mortalité hospitalière. Nous avons également étudié les facteurs influençant le choix de la technique chirurgicale, ainsi que les facteurs prédictifs d’une réadmission hospitalière après intervention. Résultats : 226443 patients ont bénéficié d’une intervention de chirurgie bariatrique entre 2008 et 2014. Ils avaient un âge moyen de 40 ans, et étaient des femmes dans 82.9% des cas. La durée moyenne de séjour était de 6 jours. Plus de 50% des patients avaient un IMC entre 40 et 50 kg/m2. 60,7 % d’entre eux ont reçu une intervention de Sleeve gastrectomie. La mortalité intra hospitalière était de 0,05%. Moins de 5% des patients ont passé au moins 1 jour en réanimation. 5% des patients ont été ré hospitalisés à 6 mois de l’intervention en lien avec une complication, et 25,7% à 5 ans. Conclusion : le nombre d’interventions de chirurgie bariatrique a été multiplié par 2,7 de 2008 à 2014, en lien avec un accroissement de la prévalence de l’obésité, et l’amélioration des techniques chirurgicales. Les patients étaient majoritairement des femmes, mais cette proportion a diminué au fil des années. De même, l’âge moyen des patients a augmenté de 38,9 à 41,0 en 2014. La Sleeve gastrectomie était la technique la plus privilégiée en 2014. Cependant, l’anneau gastrique ajustable était préféré pour : les patients jeunes, ayant un IMC faible, en l’absence de diabète, de maladie psychiatrique, ou pathologie oesophagienne, opérés dans les hôpitaux privés.

@phdthesis{bray_epidemiologie_2017,
	address = {Lille ; 1969-2017, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Epidémiologie des cholécystectomies: étude de la base nationale du {PMSI}, de 2008 à 2014},
	shorttitle = {Epidémiologie des cholécystectomies},
	abstract = {Contexte : Les calculs biliaires sont un des motifs abdominaux d’admission aux urgences les plus fréquents. Le but de cette étude était d’analyser l’épidémiologie des patients bénéficiant d’une cholécystectomie pour pathologie biliaire, de 2008 à 2014. Matériel et Méthodes : Nous avons utilisé la base de données nationale du Programme de médicalisation des systèmes d’information (PMSI). Tous les patients ayant eu une cholécystectomie pour pathologie biliaire de Janvier 2008 à Décembre 2014 ont été inclus. La démographie des patients, le diagnostic principal, le type d’intervention, la durée de séjour, l’admission en unité de soins intensifs, le mode de sortie, les complications, et la mortalité intra-hospitalière ont été analysés. Résultats : 807 307 cholécystectomies ont été réalisées en France sur la période étudiée, avec une augmentation du taux d’incidence de 167,5 à 182,6 pour 100 000 habitants. Les femmes représentaient 66,5\% des interventions (p {\textless} 0,001). L’âge moyen était moins élevé pour les femmes que pour les hommes : 52,1 ans contre 60,2 ans (p {\textless} 0,001). La proportion de cholécystectomies par laparoscopie a augmenté significativement de 90\% en 2008 à 94\% en 2014 (p {\textless} 0,001). La durée moyenne de séjour hospitalier a diminué significativement de 6,5 jours en 2008 à 4,7 jours en 2014 (p {\textless} 0,001). Les complications intra abdominales étaient le principal type de complication (23,09\% pour les laparoscopies), et la mortalité intra-hospitalière a diminué significativement sur la période, de 0,45\% en 2008 à 0,38\% en 2014 (p {\textless} 0,005). Conclusion : Nos résultats ont montré que le taux d’incidence national des cholécystectomies pour pathologie biliaire a augmenté de 2008 à 2014.},
	language = {français},
	school = {Université du droit et de la santé},
	author = {Bray, Fabien},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2017},
	keywords = {Base de données -- Dissertation universitaire, Cholécystectomie -- Statistiques, Cholécystectomie -- Statistiques -- Thèses et écrits académiques, Cholécystectomie -- statistiques et données numériques -- Dissertation universitaire, Cholécystite, Cholécystite -- Thèses et écrits académiques, Maladies de la vésicule biliaire -- Dissertation universitaire, PMSI, Programme de médicalisation des systèmes d'information, Programme de médicalisation des systèmes d'information -- Thèses et écrits académiques, base de données nationale, cholécystectomie, cholécystite, coelioscopie, laparoscopie, laparotomie, lithiase biliaire, épidémiologie},
}

Contexte : Les calculs biliaires sont un des motifs abdominaux d’admission aux urgences les plus fréquents. Le but de cette étude était d’analyser l’épidémiologie des patients bénéficiant d’une cholécystectomie pour pathologie biliaire, de 2008 à 2014. Matériel et Méthodes : Nous avons utilisé la base de données nationale du Programme de médicalisation des systèmes d’information (PMSI). Tous les patients ayant eu une cholécystectomie pour pathologie biliaire de Janvier 2008 à Décembre 2014 ont été inclus. La démographie des patients, le diagnostic principal, le type d’intervention, la durée de séjour, l’admission en unité de soins intensifs, le mode de sortie, les complications, et la mortalité intra-hospitalière ont été analysés. Résultats : 807 307 cholécystectomies ont été réalisées en France sur la période étudiée, avec une augmentation du taux d’incidence de 167,5 à 182,6 pour 100 000 habitants. Les femmes représentaient 66,5% des interventions (p \textless 0,001). L’âge moyen était moins élevé pour les femmes que pour les hommes : 52,1 ans contre 60,2 ans (p \textless 0,001). La proportion de cholécystectomies par laparoscopie a augmenté significativement de 90% en 2008 à 94% en 2014 (p \textless 0,001). La durée moyenne de séjour hospitalier a diminué significativement de 6,5 jours en 2008 à 4,7 jours en 2014 (p \textless 0,001). Les complications intra abdominales étaient le principal type de complication (23,09% pour les laparoscopies), et la mortalité intra-hospitalière a diminué significativement sur la période, de 0,45% en 2008 à 0,38% en 2014 (p \textless 0,005). Conclusion : Nos résultats ont montré que le taux d’incidence national des cholécystectomies pour pathologie biliaire a augmenté de 2008 à 2014.

@phdthesis{delattre_evolution_2017,
	address = {Lille ; 1969-2017, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Evolution du poids des patientes sous contraceptifs hormonaux: étude en vie réelle dans un cabinet de médecine générale de la métropole lilloise},
	shorttitle = {Evolution du poids des patientes sous contraceptifs hormonaux},
	abstract = {Objectif. De nombreuses études ont examiné l’effet de la contraception hormonale sur le poids mais elles sont interventionnelles et ne reflètent pas la vie réelle. L’objectif de cette étude était d’évaluer la variation de poids des patientes sous contraception hormonale dans la vie réelle en réutilisant les données médicales collectées en soins primaires. Puis nous avons étudié les covariables qui pouvaient influencer cette variation. Méthode. Nous avons mené une étude observationnelle en vie réelle dans un cabinet de médecine générale à Tourcoing. Les poids ont été collectés de janvier 2013 à juin 2015. La variation de poids était étudiée chez les femmes sous contraceptifs hormonaux (deuxième et troisième génération de pilules oestroprogestatives (POP), contraceptifs progestatifs (CP)) par rapport à leur poids initial. Nous avons recherché les covariables significatives grâce au modèle de régression multiple. Résultats. L’analyse comprenait 277 patientes soit 341 individus statistiques avec un âge médian de 27.9 ans : 62.2\% utilisaient une POP de deuxième génération, 31.1\% un CP, 5.57\% une POP de troisième génération et 1.17\% utilisaient un dispositif intra-utérin (DIU) au cuivre. Parmi les utilisatrices de CP, 22.9\% utilisaient le désogestrel 75 μg, 6.74\% l’implant et 1.47\% le DIU hormonal. Le suivi moyen était de 285 jours. La variation moyenne de poids à 3 mois était de -0.168 kg [-0.546 ; 0.209] et n’était pas significativement différente de zéro (p=0.38). Les résultats étaient similaires à 1.5, 6 ou 12 mois. Les femmes perdaient 0.704 kg par an (p=0.00043). Comparé aux autres groupes de contraceptifs, l’utilisation du DIU au cuivre était associée à une perte moyenne de poids significative de 3.90 kg par an (p=4.6*10-6). L’hypothyroïdie était associée à une prise moyenne de poids de 2.21 kg par an (p=0.0027). Conclusion. Cette étude a démontré que la prise de POP et de CP n’était pas associée à une variation de poids dans la vie réelle et qu’il était possible d’utiliser secondairement des données collectées de façon routinière en soins primaires, ce qui ouvre des champs de recherche médicale stimulants et prometteurs.},
	language = {français},
	school = {Université du droit et de la santé},
	author = {Delattre, Claire},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2017},
	keywords = {Analyse des données, Analyse des données -- Thèses et écrits académiques, Collecte de données -- Dissertation universitaire, Contraceptifs féminins -- Dissertation universitaire, Contraceptifs oraux, Contraceptifs oraux -- Thèses et écrits académiques, Prise de poids, Prise de poids -- Dissertation universitaire, Prise de poids -- Thèses et écrits académiques, contraception hormonale, dispositif intra-utérin, médecine générale, poids, réutilisation de données},
}

Objectif. De nombreuses études ont examiné l’effet de la contraception hormonale sur le poids mais elles sont interventionnelles et ne reflètent pas la vie réelle. L’objectif de cette étude était d’évaluer la variation de poids des patientes sous contraception hormonale dans la vie réelle en réutilisant les données médicales collectées en soins primaires. Puis nous avons étudié les covariables qui pouvaient influencer cette variation. Méthode. Nous avons mené une étude observationnelle en vie réelle dans un cabinet de médecine générale à Tourcoing. Les poids ont été collectés de janvier 2013 à juin 2015. La variation de poids était étudiée chez les femmes sous contraceptifs hormonaux (deuxième et troisième génération de pilules oestroprogestatives (POP), contraceptifs progestatifs (CP)) par rapport à leur poids initial. Nous avons recherché les covariables significatives grâce au modèle de régression multiple. Résultats. L’analyse comprenait 277 patientes soit 341 individus statistiques avec un âge médian de 27.9 ans : 62.2% utilisaient une POP de deuxième génération, 31.1% un CP, 5.57% une POP de troisième génération et 1.17% utilisaient un dispositif intra-utérin (DIU) au cuivre. Parmi les utilisatrices de CP, 22.9% utilisaient le désogestrel 75 μg, 6.74% l’implant et 1.47% le DIU hormonal. Le suivi moyen était de 285 jours. La variation moyenne de poids à 3 mois était de -0.168 kg [-0.546 ; 0.209] et n’était pas significativement différente de zéro (p=0.38). Les résultats étaient similaires à 1.5, 6 ou 12 mois. Les femmes perdaient 0.704 kg par an (p=0.00043). Comparé aux autres groupes de contraceptifs, l’utilisation du DIU au cuivre était associée à une perte moyenne de poids significative de 3.90 kg par an (p=4.6*10-6). L’hypothyroïdie était associée à une prise moyenne de poids de 2.21 kg par an (p=0.0027). Conclusion. Cette étude a démontré que la prise de POP et de CP n’était pas associée à une variation de poids dans la vie réelle et qu’il était possible d’utiliser secondairement des données collectées de façon routinière en soins primaires, ce qui ouvre des champs de recherche médicale stimulants et prometteurs.

@phdthesis{grujon_nouveau_2017,
	address = {Lille ; 1969-2017, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Nouveau profil épidémique de la gale humaine dans un cabinet de médecine générale de la métropole {Lilloise}},
	abstract = {Objectif: La gale est un problème de santé publique en France. L’activité en soins primaires en France est importante et représente chaque année plusieurs centaines de millions de consultations. L’objectif de cette étude était d’estimer en vie réelle, l’incidence de la gale et de décrire la population atteinte, en réutilisant les données collectées régulièrement en soins primaires. Matériel et Méthodes : Nous avons réalisé une étude en vie réelle à partir de données de consultations d’un cabinet de médecine générale du nord de la France de Janvier 2013 à Juin 2015. Nous avons estimé l’incidence de la gale dans ce quartier, recherché les facteurs pouvant influencer sa survenue et sa récidive, et évalué la prise en charge thérapeutique de cette pathologie. Résultats : L’analyse comprenait 177 patients dont 96 femmes. La gale survenait de façon uniforme dans les deux sexes, elle était plus fréquente chez les jeunes enfants de sexe masculin et chez les femmes de 40-50 ans. Elle survenait plus fréquemment durant la saison fraîche à savoir la période automno-hivernale. Aucun facteur influençant l’immunité ou terrain sous-jacent n’a été observé comme survenant de façon concomitante à la gale. Tous les patients ont reçu un traitement scabicide : 163 par voie orale par ivermectine, 10 par voie locale (8 par benzoate de benzyle et 2 par esdépalléthrine/butoxyde de pipéronyle). Trois patients ont reçu une bithérapie scabicide. Quarante-deux patients (23.7\%) ont présenté une récidive, 16 (9.04\%) parmi eux ont récidivé sous 60 jours. Le délai médian de récidive était de 28 jours [22.3; 36.3]. Quinze patients ont reçu un traitement scabicide oral, un seul par voie locale. La récidive des 16 patients était traitée pour 11 patients par traitement scabicide oral, 2 par voie locale et 3 patients ont reçu une bithérapie scabicide. Le taux de récidive apparaît de manière significative supérieur en hiver comparativement aux autres saisons (68.8\% des récidives, p=0.021). L’âge n’apparaît pas quant à lui comme un facteur de récidive (p=0.63). Discussion : Cette étude montre que la gale est une pathologie fréquente en médecine générale et en recrudescence comme cela a été démontré dans les études précédentes. L’incidence de cette pathologie est souvent sous-estimée du fait de l’absence de déclaration obligatoire mais aussi de la perception de cette pathologie comme la maladie des « gens vieux, sales, pauvres, ruraux » ancrée dans les moeurs. Inversement, cette étude montre qu’il s’agit d’une pathologie fréquente en milieu urbain et touchant des personnes de tout âge, en particulier des jeunes enfants. Cette étude montre que la période hivernale est un facteur de risque significatif de contamination mais aussi de récidive. Conclusion : Cette étude a démontré qu’il était possible d’utiliser secondairement des données collectées en routine en soins primaires et ouvre des champs de recherches médicales stimulants et prometteurs.},
	language = {français},
	school = {Université du droit et de la santé},
	author = {Grujon, Anaëlle},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2017},
	keywords = {Gale -- Facteurs de risque, Gale -- Facteurs de risque -- Thèses et écrits académiques, Gale -- Thérapeutique, Gale -- Thérapeutique -- Thèses et écrits académiques, Gale -- Épidémiologie, Gale -- Épidémiologie -- Thèses et écrits académiques, Gale -- épidémiologie -- Dissertation universitaire, Récidive -- Dissertation universitaire, Soins de santé primaires -- Dissertation universitaire, facteur de risque de récidive, gale humaine, incidence, médecine générale, soins primaires, vie réelle},
}

Objectif: La gale est un problème de santé publique en France. L’activité en soins primaires en France est importante et représente chaque année plusieurs centaines de millions de consultations. L’objectif de cette étude était d’estimer en vie réelle, l’incidence de la gale et de décrire la population atteinte, en réutilisant les données collectées régulièrement en soins primaires. Matériel et Méthodes : Nous avons réalisé une étude en vie réelle à partir de données de consultations d’un cabinet de médecine générale du nord de la France de Janvier 2013 à Juin 2015. Nous avons estimé l’incidence de la gale dans ce quartier, recherché les facteurs pouvant influencer sa survenue et sa récidive, et évalué la prise en charge thérapeutique de cette pathologie. Résultats : L’analyse comprenait 177 patients dont 96 femmes. La gale survenait de façon uniforme dans les deux sexes, elle était plus fréquente chez les jeunes enfants de sexe masculin et chez les femmes de 40-50 ans. Elle survenait plus fréquemment durant la saison fraîche à savoir la période automno-hivernale. Aucun facteur influençant l’immunité ou terrain sous-jacent n’a été observé comme survenant de façon concomitante à la gale. Tous les patients ont reçu un traitement scabicide : 163 par voie orale par ivermectine, 10 par voie locale (8 par benzoate de benzyle et 2 par esdépalléthrine/butoxyde de pipéronyle). Trois patients ont reçu une bithérapie scabicide. Quarante-deux patients (23.7%) ont présenté une récidive, 16 (9.04%) parmi eux ont récidivé sous 60 jours. Le délai médian de récidive était de 28 jours [22.3; 36.3]. Quinze patients ont reçu un traitement scabicide oral, un seul par voie locale. La récidive des 16 patients était traitée pour 11 patients par traitement scabicide oral, 2 par voie locale et 3 patients ont reçu une bithérapie scabicide. Le taux de récidive apparaît de manière significative supérieur en hiver comparativement aux autres saisons (68.8% des récidives, p=0.021). L’âge n’apparaît pas quant à lui comme un facteur de récidive (p=0.63). Discussion : Cette étude montre que la gale est une pathologie fréquente en médecine générale et en recrudescence comme cela a été démontré dans les études précédentes. L’incidence de cette pathologie est souvent sous-estimée du fait de l’absence de déclaration obligatoire mais aussi de la perception de cette pathologie comme la maladie des « gens vieux, sales, pauvres, ruraux » ancrée dans les moeurs. Inversement, cette étude montre qu’il s’agit d’une pathologie fréquente en milieu urbain et touchant des personnes de tout âge, en particulier des jeunes enfants. Cette étude montre que la période hivernale est un facteur de risque significatif de contamination mais aussi de récidive. Conclusion : Cette étude a démontré qu’il était possible d’utiliser secondairement des données collectées en routine en soins primaires et ouvre des champs de recherches médicales stimulants et prometteurs.

@phdthesis{skibinski_evolution_2017,
	address = {Lille ; 1969-2017, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Evolution du poids des patients sous antiépileptiques: étude en vie réelle dans un cabinet de médecine générale de la métropole lilloise},
	shorttitle = {Evolution du poids des patients sous antiépileptiques},
	abstract = {Objectif. Les antiépileptiques (AE) sont connus pour influencer le poids. L'activité de soins primaires en France est importante et représente chaque année plusieurs centaines de millions de consultations. L'objectif de cette étude était d'évaluer la variation de poids des patients sous AE dans la vie réelle en réutilisant les données collectées régulièrement en soins primaires. Puis, nous avons essayé de mettre en évidence les covariables qui pouvaient influencer le changement de poids. Méthodes. Nous avons réalisé une étude en vie réelle à partir de données de consultations d'un cabinet de médecine générale du nord de la France de janvier 2013 à juin 2015. Nous avons mesuré l'évolution du poids des patients par rapport à leur poids initial, sous 4 molécules antiépileptives : la prégabaline (PG), le valproate de sodium (VPA), la lamotrigine (LMT) et le divalproate de sodium (DiVPA), indépendamment de leurs indications. Résultats. L'analyse initiale comprenait 123 patients, dont 68 femmes, avec un âge moyen de 51 ans : 108 ont reçu seulement la PG, 6 la LMT, 4 le VPA, 3 le DiVPA et 2 ont reçu deux molécules en même temps. Le temps moyen de suivi était de 254 jours. Le poids a été étudié chez 112 patients. Les principales indications du traitement antiépileptique étaient la douleur chez 75.2 \% (principalement neuropathique : 85.1 \%), l'épilepsie chez 10 \%, les paresthésies chez 6.4 \% et les troubles psychiatriques. La variation de poids moyenne à 3 mois était de 0.227 kg [-0.536 ; 0.989] et n'était pas significativement différente de zéro (p=0.55). Elle n'était pas significativement différente de zéro non plus à 1.5, 6 ou 12 mois. À l'inverse, l'hypothyroïdie a été associée à une perte de poids moyenne significative de 1.63 kg par an (p=0.038), et le sexe masculin a été associé à un gain de poids moyen de 2.80 kg par an (p≈0). Discussion. Cette étude démontre que la prise d’AE n'est pas nécessairement associée à une variation de poids dans la vie réelle, contrairement à ce qui a été démontré dans les études interventionnelles précédentes. Certaines covariables ont eu un effet significatif sur la variation de poids durant le suivi. Cette variation résulte également de cofacteurs complexes, comme la douleur chronique ou les maladies psychiatriques. Conclusion. Cette étude a démontré qu'il était possible d’utiliser secondairement des données collectées de façon routinière en soins primaires et ouvre des champs de recherches médicales stimulants et prometteurs.},
	language = {français},
	school = {Université du droit et de la santé},
	author = {Skibinski, Pauline},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2017},
	keywords = {Anticonvulsivants, Anticonvulsivants -- Thèses et écrits académiques, Anticonvulsivants -- effets indésirables -- Dissertation universitaire, Antiépileptiques, Médicaments -- Effets secondaires, Médicaments -- Effets secondaires -- Thèses et écrits académiques, Prise de poids, Prise de poids -- Dissertation universitaire, Prise de poids -- Thèses et écrits académiques, antiépileptiques, médecine générale, poids, soins primaires, vie réelle, Épilepsie -- Dissertation universitaire, Épileptiques, Épileptiques -- Thèses et écrits académiques},
}

Objectif. Les antiépileptiques (AE) sont connus pour influencer le poids. L'activité de soins primaires en France est importante et représente chaque année plusieurs centaines de millions de consultations. L'objectif de cette étude était d'évaluer la variation de poids des patients sous AE dans la vie réelle en réutilisant les données collectées régulièrement en soins primaires. Puis, nous avons essayé de mettre en évidence les covariables qui pouvaient influencer le changement de poids. Méthodes. Nous avons réalisé une étude en vie réelle à partir de données de consultations d'un cabinet de médecine générale du nord de la France de janvier 2013 à juin 2015. Nous avons mesuré l'évolution du poids des patients par rapport à leur poids initial, sous 4 molécules antiépileptives : la prégabaline (PG), le valproate de sodium (VPA), la lamotrigine (LMT) et le divalproate de sodium (DiVPA), indépendamment de leurs indications. Résultats. L'analyse initiale comprenait 123 patients, dont 68 femmes, avec un âge moyen de 51 ans : 108 ont reçu seulement la PG, 6 la LMT, 4 le VPA, 3 le DiVPA et 2 ont reçu deux molécules en même temps. Le temps moyen de suivi était de 254 jours. Le poids a été étudié chez 112 patients. Les principales indications du traitement antiépileptique étaient la douleur chez 75.2 % (principalement neuropathique : 85.1 %), l'épilepsie chez 10 %, les paresthésies chez 6.4 % et les troubles psychiatriques. La variation de poids moyenne à 3 mois était de 0.227 kg [-0.536 ; 0.989] et n'était pas significativement différente de zéro (p=0.55). Elle n'était pas significativement différente de zéro non plus à 1.5, 6 ou 12 mois. À l'inverse, l'hypothyroïdie a été associée à une perte de poids moyenne significative de 1.63 kg par an (p=0.038), et le sexe masculin a été associé à un gain de poids moyen de 2.80 kg par an (p≈0). Discussion. Cette étude démontre que la prise d’AE n'est pas nécessairement associée à une variation de poids dans la vie réelle, contrairement à ce qui a été démontré dans les études interventionnelles précédentes. Certaines covariables ont eu un effet significatif sur la variation de poids durant le suivi. Cette variation résulte également de cofacteurs complexes, comme la douleur chronique ou les maladies psychiatriques. Conclusion. Cette étude a démontré qu'il était possible d’utiliser secondairement des données collectées de façon routinière en soins primaires et ouvre des champs de recherches médicales stimulants et prometteurs.

@phdthesis{negre_reconstruction_2017,
	address = {France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Reconstruction mammaire en {France}: à propos de 143 524 cas sur 7 ans},
	shorttitle = {Reconstruction mammaire en {France}},
	abstract = {L’état actuel des connaissances épidémiologiques ne permet pas de connaitre les pratiques de reconstruction mammaire en France. L’objectif de ce travail était de réaliser un état des lieux de la chirurgie reconstructrice après mastectomie totale à partir d’une base de données nationale. Cette étude a été conduite en utilisant la base de données du Programme de Médicalisation des Systèmes d’Information (PMSI) entre 2008 et 2014. Toutes les femmes ayant bénéficié d’une mastectomie totale sur cette période ont été incluses. Pour chaque patiente, nous avons recherché la présence d’un geste de reconstruction mammaire au cours du séjour initial et des séjours ultérieurs. Le caractère immédiat (RMI) ou secondaire (RMD), le délai de reconstruction, et le type de chirurgie ont été analysés. Parmi les 143 524 mastectomies totales incluses, la proportion de RMI était de 16,96 \% et augmentait sur la période. Chez les RMD, le délai entre mastectomie et reconstruction était inférieur ou égal à 3 ans dans 92 \% des cas. Le taux de RMD était de 17,57 \% chez les patientes incluses en 2008 et 2009, et le taux de non reconstruction était de 65 \%. L’implant était la technique de reconstruction la plus utilisée (59,28 \% des RMI et 43,69 \% des RMD) suivie du lambeau de grand dorsal (32,95 \% des RMI et 38,2 \% des RMD). La part de celles-ci diminuait sur la période au profit des lambeaux libres. Un âge jeune, une mastectomie réalisée dans un centre de lutte contre le cancer, ou par technique de conservation de l’étui cutané, et une indication de chirurgie prophylactique étaient des facteurs favorisant la reconstruction mammaire. Le taux important de mastectomies non reconstruites est en faveur du développement de l’accès à la reconstruction mammaire pour les femmes qui le souhaitent.},
	language = {français},
	school = {Université de Picardie Jules Verne},
	author = {Negre, Géraldine},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2017},
	keywords = {Mammoplastie -- Thèses et écrits académiques, Sein -- Cancer -- Thèses et écrits académiques, Sein -- Chirurgie -- Thèses et écrits académiques},
}

L’état actuel des connaissances épidémiologiques ne permet pas de connaitre les pratiques de reconstruction mammaire en France. L’objectif de ce travail était de réaliser un état des lieux de la chirurgie reconstructrice après mastectomie totale à partir d’une base de données nationale. Cette étude a été conduite en utilisant la base de données du Programme de Médicalisation des Systèmes d’Information (PMSI) entre 2008 et 2014. Toutes les femmes ayant bénéficié d’une mastectomie totale sur cette période ont été incluses. Pour chaque patiente, nous avons recherché la présence d’un geste de reconstruction mammaire au cours du séjour initial et des séjours ultérieurs. Le caractère immédiat (RMI) ou secondaire (RMD), le délai de reconstruction, et le type de chirurgie ont été analysés. Parmi les 143 524 mastectomies totales incluses, la proportion de RMI était de 16,96 % et augmentait sur la période. Chez les RMD, le délai entre mastectomie et reconstruction était inférieur ou égal à 3 ans dans 92 % des cas. Le taux de RMD était de 17,57 % chez les patientes incluses en 2008 et 2009, et le taux de non reconstruction était de 65 %. L’implant était la technique de reconstruction la plus utilisée (59,28 % des RMI et 43,69 % des RMD) suivie du lambeau de grand dorsal (32,95 % des RMI et 38,2 % des RMD). La part de celles-ci diminuait sur la période au profit des lambeaux libres. Un âge jeune, une mastectomie réalisée dans un centre de lutte contre le cancer, ou par technique de conservation de l’étui cutané, et une indication de chirurgie prophylactique étaient des facteurs favorisant la reconstruction mammaire. Le taux important de mastectomies non reconstruites est en faveur du développement de l’accès à la reconstruction mammaire pour les femmes qui le souhaitent.

@phdthesis{bortelle_duree_2017,
	address = {Lille ; 1969-2017, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Durée du sur risque de thrombose et saignement post chirurgical dans une population d’âge moyen: étude nationale sur 200 millions de séjours},
	shorttitle = {Durée du sur risque de thrombose et saignement post chirurgical dans une population d’âge moyen},
	abstract = {Contexte : La maladie thromboembolique veineuse est responsable d'une forte morbidité alors qu'une prévention est possible. De plus ces événements sont plus fréquents en post chirurgical avec une prédominance pour la période de sortie d'hospitalisation. Or les recommandations de prévention ne sont pas standardisées entre les différents pays et l'observance en est médiocre pouvant majorer les risques thromboemboliques ou hémorragiques. L'étude réalisée dans le cadre de cette thèse évaluera simultanément la durée du sur risque hémorragique et thromboembolique consécutif à différentes chirurgies. Méthode : Réalisation d'une étude de type case-crossover au sein de la base nationale du Programme de Médicalisation des Systèmes d’Information permettant d'étudier 200 000 000 de séjours hospitaliers entre 2007 et 2014. Les patients inclus avaient entre 45 et 64 ans à l'exclusion des patients ayant des antécédents de néoplasie, de pathologie thromboembolique ou hémorragique. On mesure séparément les événements thromboemboliques des événements hémorragiques. L'exposition est définie par la réalisation d'un acte chirurgical dans l'année précédant l'événement. Résultats : Inclusion de 60703 patients pour événement thromboembolique et 87126 patients pour événement hémorragique. Les résultats montrent un sur risque thromboembolique élevé dans les 42 jours suivant le geste chirurgical, soit durant la période d'anticoagulation recommandée, mais se prolongeant durant les 12 semaines suivantes. Conclusion : Ainsi une prolongation des durées d'anticoagulation pourrait être utile, cela d'autant plus que la chirurgie s'oriente de plus en plus vers des prises en charge ambulatoires remettant la gestion initiale de ces risques à la médecine générale.},
	language = {français},
	school = {Université du droit et de la santé},
	author = {Bortelle, Clément},
	collaborator = {Caron, Alexandre},
	year = {2017},
	keywords = {Chirurgie -- Complications -- Thèses et écrits académiques, Complications postopératoires -- Dissertation universitaire, Maladie thromboembolique veineuse -- Prévention -- Thèses et écrits académiques, Sécurité des patients -- Dissertation universitaire, Thromboembolisme veineux -- prévention et contrôle -- Dissertation universitaire, case-crossover, chirurgie, embolie pulmonaire, hémorragie digestive, prophylaxie, thromboembolisme, thrombose veineuse profonde, Études cas-témoins -- Dissertation universitaire, Études croisées (médecine) -- Thèses et écrits académiques},
}

Contexte : La maladie thromboembolique veineuse est responsable d'une forte morbidité alors qu'une prévention est possible. De plus ces événements sont plus fréquents en post chirurgical avec une prédominance pour la période de sortie d'hospitalisation. Or les recommandations de prévention ne sont pas standardisées entre les différents pays et l'observance en est médiocre pouvant majorer les risques thromboemboliques ou hémorragiques. L'étude réalisée dans le cadre de cette thèse évaluera simultanément la durée du sur risque hémorragique et thromboembolique consécutif à différentes chirurgies. Méthode : Réalisation d'une étude de type case-crossover au sein de la base nationale du Programme de Médicalisation des Systèmes d’Information permettant d'étudier 200 000 000 de séjours hospitaliers entre 2007 et 2014. Les patients inclus avaient entre 45 et 64 ans à l'exclusion des patients ayant des antécédents de néoplasie, de pathologie thromboembolique ou hémorragique. On mesure séparément les événements thromboemboliques des événements hémorragiques. L'exposition est définie par la réalisation d'un acte chirurgical dans l'année précédant l'événement. Résultats : Inclusion de 60703 patients pour événement thromboembolique et 87126 patients pour événement hémorragique. Les résultats montrent un sur risque thromboembolique élevé dans les 42 jours suivant le geste chirurgical, soit durant la période d'anticoagulation recommandée, mais se prolongeant durant les 12 semaines suivantes. Conclusion : Ainsi une prolongation des durées d'anticoagulation pourrait être utile, cela d'autant plus que la chirurgie s'oriente de plus en plus vers des prises en charge ambulatoires remettant la gestion initiale de ces risques à la médecine générale.

@phdthesis{delrot_praticiens_2017,
	address = {Lille ; 1969-2017, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Les praticiens ont-ils confiance en l’interprétation automatisée des électrocardiogrammes ?},
	abstract = {Contexte : Les maladies cardio-vasculaires sont la première cause de mortalité dans le monde selon l’OMS. Les facteurs de risques cardiovasculaires sont le second motif de consultation en médecine générale, en France, en 2014. L'interprétation de l’ECG pose un problème en médecine générale mais sa réalisation n'est pas réglementée. Aucune étude n'aborde la façon dont les médecins utilisent l'interprétation automatisée. Le but de cette étude est de déterminer la confiance des médecins généralistes et des cardiologues français envers l'interprétation informatisée de l'ECG. Méthode : Entre mars et juin 2016, après tirage au sort via leur numéro RPPS, un questionnaire a été envoyé par voie postale à 282 médecins généralistes et 140 cardiologues, soit 0,32 \% de l’ensemble des médecins généralistes et 2,27 \% des cardiologues de France. Résultats : Le taux de réponse est de 53,8 \%. Le principal frein à l’acquisition d’un ECG est l’accès facile aux cabinets de cardiologie ou aux hôpitaux (71,2 \%, IC95 : [59,5; 81,2]). Le nombre moyen d'ECG effectués par mois était de 7,4 pour les généralistes et de 224,8 pour les cardiologues. Au total, 54,8 \% des appareils étaient équipés d'une interprétation automatisée. Seulement 57 \% des praticiens possédant un ECG sont confiants sur leurs compétences dans l'interprétation des ECG. 69,8 \% (IC95 : [0,54; 0,83]) des généralistes lisent d'abord l'ECG puis l'interprétation automatisée, contre 52,8 \% (IC95 : [0,35; 0,70]) des cardiologues. 38,9 \% (IC95 : [0.23; 0.57]) des cardiologues ne regardent jamais l'interprétation automatisée. Les généralistes accordent plus leur confiance que les cardiologues uniquement dans le diagnostic d’hypertrophie auriculaire ou ventriculaire avec une différence statistiquement significative (p=0.04). Les cardiologues accordent plus leur confiance que les généralistes dans les diagnostics de blocs de branche gauches et droits, avec une différence statistiquement significative respectivement (p=0.006) et (p=0.029). Les praticiens interrogés, ont confiance en l’interprétation automatisée lorsque le diagnostic est ECG normal ou troubles de conduction et sont plus méfiants lors des diagnostics de troubles du rythme et de repolarisation. Conclusion : Le médecin généraliste a plus confiance en l’interprétation automatisée des ECG que le cardiologue. Les praticiens doivent garder un regard critique sur cette interprétation en particulier pour des troubles du rythme.},
	language = {français},
	school = {Université du droit et de la santé},
	author = {Delrot, Cédric},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2017},
	keywords = {Coeur -- Maladies -- Diagnostic -- Thèses et écrits académiques, Confiance -- Dissertation universitaire, Confiance -- Thèses et écrits académiques, ECG, Interprétation d'images radiographiques assistée par ordinateur -- Dissertation universitaire, Maladies cardiovasculaires -- Dissertation universitaire, cardiologie, confiance, diagnostic, interprétation automatisée, médecine générale, Électrocardiographie -- Thèses et écrits académiques, Électrocardiographie -- utilisation -- Dissertation universitaire, électrocardiogramme},
}

Contexte : Les maladies cardio-vasculaires sont la première cause de mortalité dans le monde selon l’OMS. Les facteurs de risques cardiovasculaires sont le second motif de consultation en médecine générale, en France, en 2014. L'interprétation de l’ECG pose un problème en médecine générale mais sa réalisation n'est pas réglementée. Aucune étude n'aborde la façon dont les médecins utilisent l'interprétation automatisée. Le but de cette étude est de déterminer la confiance des médecins généralistes et des cardiologues français envers l'interprétation informatisée de l'ECG. Méthode : Entre mars et juin 2016, après tirage au sort via leur numéro RPPS, un questionnaire a été envoyé par voie postale à 282 médecins généralistes et 140 cardiologues, soit 0,32 % de l’ensemble des médecins généralistes et 2,27 % des cardiologues de France. Résultats : Le taux de réponse est de 53,8 %. Le principal frein à l’acquisition d’un ECG est l’accès facile aux cabinets de cardiologie ou aux hôpitaux (71,2 %, IC95 : [59,5; 81,2]). Le nombre moyen d'ECG effectués par mois était de 7,4 pour les généralistes et de 224,8 pour les cardiologues. Au total, 54,8 % des appareils étaient équipés d'une interprétation automatisée. Seulement 57 % des praticiens possédant un ECG sont confiants sur leurs compétences dans l'interprétation des ECG. 69,8 % (IC95 : [0,54; 0,83]) des généralistes lisent d'abord l'ECG puis l'interprétation automatisée, contre 52,8 % (IC95 : [0,35; 0,70]) des cardiologues. 38,9 % (IC95 : [0.23; 0.57]) des cardiologues ne regardent jamais l'interprétation automatisée. Les généralistes accordent plus leur confiance que les cardiologues uniquement dans le diagnostic d’hypertrophie auriculaire ou ventriculaire avec une différence statistiquement significative (p=0.04). Les cardiologues accordent plus leur confiance que les généralistes dans les diagnostics de blocs de branche gauches et droits, avec une différence statistiquement significative respectivement (p=0.006) et (p=0.029). Les praticiens interrogés, ont confiance en l’interprétation automatisée lorsque le diagnostic est ECG normal ou troubles de conduction et sont plus méfiants lors des diagnostics de troubles du rythme et de repolarisation. Conclusion : Le médecin généraliste a plus confiance en l’interprétation automatisée des ECG que le cardiologue. Les praticiens doivent garder un regard critique sur cette interprétation en particulier pour des troubles du rythme.

@phdthesis{mellot_quest-ce_2017,
	address = {Lille ; 1969-2017, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Qu’est-ce qu’une maladie chronique ?: apport de l’analyse des données de la base nationale du {PMSI}},
	shorttitle = {Qu’est-ce qu’une maladie chronique ?},
	abstract = {Contexte : Les maladies chroniques sont le principal défi de santé publique de ce siècle. Pour l’OMS, les maladies chroniques sont des affections qui durent longtemps. D’autres définitions sont plus spécifiques mais soit classent les maladies selon une durée seuil variable et non expliquée, soit fournissent une liste restreinte de maladies. La Sécurité Sociale se base essentiellement sur la liste des 29 ALD. Le PMSI collecte les données hospitalières publiques et privés depuis 20 ans. On pourrait utiliser ces données pour estimer la durée de vie des codes CIM-10 et donc leurs chronicités relatives. Matériel et Méthodes : A partir des 162 millions de séjours PMSI de 2008 à 2014, nous déterminons la durée de vie des codes CIM-10 pour chaque patient, identifié par une empreinte unique. Nous considérons qu’un code disparait s’il n’est pas suivi dans les 720 jours par lui-même ou le code à 3 caractères apparenté. Ces durées permettent de tracer des courbes de survie. Nous calculons 200 indicateurs pour des durées et survies différentes et sélectionnons celui qui maximise l’aire sous la courbe ROC établie par rapport aux listes de références : CCI, ALD, codes CIM-10 ayant le mot clé aigu/chronique et une liste établie à la main. Résultats : Pour le CCI, le meilleur indicateur est le temps pour une survie de 4,5\% ; l’AUC est de 0,789 avec une sensibilité de 72,7\% et une spécificité de 72,4\% au seuil de 182 jours. Pour les ALD, ce même indicateur donne une AUC de 0,903 avec une sensibilité et une spécificité de 82,2\% au seuil de 322 jours. Le mot clé aigu/chronique ne permet pas un classement efficace. Pour notre liste établie à la main, cet indicateur donne une AUC de 0,915 mais la liste est biaisée car ne contient que des codes de caractère aigu ou chronique évident. Nous proposons un classement pour 23 349 codes CIM-10. Conclusion : Le réemploi des données du PMSI permet de calculer un indicateur de chronicité quantitatif pour les codes CIM-10 dans les limites liées à la nature hospitalière des données.},
	language = {français},
	school = {Université du droit et de la santé},
	author = {Mellot, Emeric},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2017},
	keywords = {ALD, Analyse des données -- Thèses et écrits académiques, Base de données -- France -- Dissertation universitaire, CCI, CIM, Interprétation statistique de données -- Dissertation universitaire, MNT, Maladie chronique -- Dissertation universitaire, Maladies chroniques -- Thèses et écrits académiques, PMSI, Programme de médicalisation des systèmes d'information -- Thèses et écrits académiques, big data, data reuse, maladie chronique, maladie non transmissible},
}

Contexte : Les maladies chroniques sont le principal défi de santé publique de ce siècle. Pour l’OMS, les maladies chroniques sont des affections qui durent longtemps. D’autres définitions sont plus spécifiques mais soit classent les maladies selon une durée seuil variable et non expliquée, soit fournissent une liste restreinte de maladies. La Sécurité Sociale se base essentiellement sur la liste des 29 ALD. Le PMSI collecte les données hospitalières publiques et privés depuis 20 ans. On pourrait utiliser ces données pour estimer la durée de vie des codes CIM-10 et donc leurs chronicités relatives. Matériel et Méthodes : A partir des 162 millions de séjours PMSI de 2008 à 2014, nous déterminons la durée de vie des codes CIM-10 pour chaque patient, identifié par une empreinte unique. Nous considérons qu’un code disparait s’il n’est pas suivi dans les 720 jours par lui-même ou le code à 3 caractères apparenté. Ces durées permettent de tracer des courbes de survie. Nous calculons 200 indicateurs pour des durées et survies différentes et sélectionnons celui qui maximise l’aire sous la courbe ROC établie par rapport aux listes de références : CCI, ALD, codes CIM-10 ayant le mot clé aigu/chronique et une liste établie à la main. Résultats : Pour le CCI, le meilleur indicateur est le temps pour une survie de 4,5% ; l’AUC est de 0,789 avec une sensibilité de 72,7% et une spécificité de 72,4% au seuil de 182 jours. Pour les ALD, ce même indicateur donne une AUC de 0,903 avec une sensibilité et une spécificité de 82,2% au seuil de 322 jours. Le mot clé aigu/chronique ne permet pas un classement efficace. Pour notre liste établie à la main, cet indicateur donne une AUC de 0,915 mais la liste est biaisée car ne contient que des codes de caractère aigu ou chronique évident. Nous proposons un classement pour 23 349 codes CIM-10. Conclusion : Le réemploi des données du PMSI permet de calculer un indicateur de chronicité quantitatif pour les codes CIM-10 dans les limites liées à la nature hospitalière des données.

@phdthesis{degoul_comment_2016,
	address = {Lille ; 1969-2017, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Comment mesurer la performance d’un test diagnostique: présentation et comparaison d’indicateurs},
	shorttitle = {Comment mesurer la performance d’un test diagnostique},
	abstract = {Contexte. Ce travail vise à comparer le comportement statistique d’indicateurs synthétiques de performance d’un test diagnostique binaire pour aider le chercheur dans le choix de l’indicateur le mieux adapté pour son étude. Méthode. Les indicateurs étudiés sont l’aire sous la courbe ROC, le coefficient kappa de Cohen et la proportion de sa valeur maximale, la F-mesure, la concordance observée et le coefficient phi. Au moyen de simulations informatiques basées sur plusieurs valeurs de sensibilité et spécificité du test et de taux de prévalence de l’état à diagnostiquer, les valeurs moyennes et les intervalles de fluctuation de ces indicateurs ont été comparés graphiquement. Différentes situations particulières mais rencontrées en pratique ont été évaluées. Résultats. Les coefficients kappa et phi se montrent symétriques par rapport aux variations de taux de prévalence, avec une valeur maximale quand les échantillons sont équilibrés. Au contraire, la F-mesure semble anormalement optimiste quand le taux de prévalence est élevé. Elle est de plus le seul des indicateurs étudiés sensible à l’inversion des états « pathologique » et « sain ». La concordance observée surestime systématiquement la performance du test. Il en est de même pour la proportion du kappa maximal, sauf lorsque le taux de prévalence est faible. Enfin, l’aire sous la courbe montre de larges fluctuations de l’intervalle de variation pour des taux de prévalence extrêmes, à l’opposé des autres indicateurs. Conclusion. Les coefficients kappa et phi semblent être les indicateurs les plus à même de refléter, dans les situations étudiées, la performance d’un test diagnostique en terme d’utilisabilité par les cliniciens. Néanmoins, la valeur d’un indicateur seule ne saurait contenir toute l’information sur cette performance.},
	language = {français},
	school = {Université du droit et de la santé},
	author = {Degoul, Samuel},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2016},
	keywords = {Aire sous la courbe -- Dissertation universitaire, Diagnostic -- Dissertation universitaire, Diagnostic -- Thèses et écrits académiques, F-mesure, Informatique médicale -- Dissertation universitaire, Médecine -- Informatique -- Thèses et écrits académiques, Statistique médicale -- Thèses et écrits académiques, Statistiques -- Dissertation universitaire, Test diagnostique, aire sous la courbe, coefficient phi, indicateur de performance, kappa de Cohen},
}

Contexte. Ce travail vise à comparer le comportement statistique d’indicateurs synthétiques de performance d’un test diagnostique binaire pour aider le chercheur dans le choix de l’indicateur le mieux adapté pour son étude. Méthode. Les indicateurs étudiés sont l’aire sous la courbe ROC, le coefficient kappa de Cohen et la proportion de sa valeur maximale, la F-mesure, la concordance observée et le coefficient phi. Au moyen de simulations informatiques basées sur plusieurs valeurs de sensibilité et spécificité du test et de taux de prévalence de l’état à diagnostiquer, les valeurs moyennes et les intervalles de fluctuation de ces indicateurs ont été comparés graphiquement. Différentes situations particulières mais rencontrées en pratique ont été évaluées. Résultats. Les coefficients kappa et phi se montrent symétriques par rapport aux variations de taux de prévalence, avec une valeur maximale quand les échantillons sont équilibrés. Au contraire, la F-mesure semble anormalement optimiste quand le taux de prévalence est élevé. Elle est de plus le seul des indicateurs étudiés sensible à l’inversion des états « pathologique » et « sain ». La concordance observée surestime systématiquement la performance du test. Il en est de même pour la proportion du kappa maximal, sauf lorsque le taux de prévalence est faible. Enfin, l’aire sous la courbe montre de larges fluctuations de l’intervalle de variation pour des taux de prévalence extrêmes, à l’opposé des autres indicateurs. Conclusion. Les coefficients kappa et phi semblent être les indicateurs les plus à même de refléter, dans les situations étudiées, la performance d’un test diagnostique en terme d’utilisabilité par les cliniciens. Néanmoins, la valeur d’un indicateur seule ne saurait contenir toute l’information sur cette performance.

@phdthesis{baro_vers_2015,
	address = {Lille ; 1969-2017, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Vers une définition des big data en santé basée sur la littérature},
	abstract = {Contexte : Le terme « Big data » émerge récemment dans la littérature scientifique. Ce terme n’est pas encore référencé dans le MeSH (Medical Subject Headings). Or son usage semble ambigu et les propriétés attribuées à ce terme par les auteurs varient selon les articles. L’objectif de ce travail est de proposer une définition du terme « Big data » à partir d’une revue de la littérature incluant les articles mentionnant ce terme et de décrire systématiquement les propriétés rattachées à ce terme par les auteurs. Méthode : Nous avons conduit une recherche systématique de la base de données PubMed de tous les articles publiés jusqu’au 9 mai 2014 en utilisant le terme de recherche « Big data ». Ces articles ont été classés en domaines d’études. Le nombre d’individus statistiques (n) et le nombre de variables (p) ont été relevés pour les articles décrivant un jeu de données. Nous avons également considéré les caractéristiques attribuées aux Big data par les auteurs. En s’appuyant sur cette analyse, une définition des Big data a été proposée. Résultats : Cent quatre-vingt-seize articles ont été inclus. Trois principales catégories d’études ont été identifiées : les spécialités « omiques », les spécialités médicales et la santé publique. Les Big data peuvent être définies comme des données avec un Log(n * p) supérieur ou égal à 7. Les propriétés des Big data sont ses grandes variétés de données et leur importante vélocité. Les Big data soulèvent des défis concernant la véracité, la gestion des données, l’extraction d’informations utiles, le partage des informations et l’existence d’experts humains ayant à la fois des compétences cliniques et analytiques. L’émergence des Big data nécessitent la création de nouvelles méthodes de calcul qui optimisent la gestion de données. Les concepts reliés sont la réutilisation des données (data reuse), la possibilité de connaissances erronées et la question de la confidentialité des données. Conclusion : Les Big data sont définies par le volume. La taille des données qui les qualifie de « Big data » va probablement augmenter avec le temps. Les Big data ne doivent pas être confondues avec le data reuse : les données peuvent être massives sans être forcément réutilisées dans un autre objectif, par exemple dans le cas des spécialités « omiques ». Inversement, des données peuvent être réutilisées sans être nécessairement de grande dimension. C’est le cas par exemple de l’utilisation secondaire du dossier patient informatisé.},
	language = {français},
	school = {Université du droit et de la santé},
	author = {Baro, Emilie},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2015},
	keywords = {Bases de données factuelles -- Dissertation universitaire, Big data. exploration de données. réutilisation des données. omiques, Données massives -- Thèses et écrits académiques, Exploration de données -- Thèses et écrits académiques, Fouille de données -- Dissertation universitaire, Informatique médicale -- statistiques et données numériques -- Dissertation universitaire, Revue de la littérature -- Dissertation universitaire, Santé -- Bases de données -- Thèses et écrits académiques, Systèmes d'information sur la santé -- statistiques et données numériques -- Dissertation universitaire},
}

Contexte : Le terme « Big data » émerge récemment dans la littérature scientifique. Ce terme n’est pas encore référencé dans le MeSH (Medical Subject Headings). Or son usage semble ambigu et les propriétés attribuées à ce terme par les auteurs varient selon les articles. L’objectif de ce travail est de proposer une définition du terme « Big data » à partir d’une revue de la littérature incluant les articles mentionnant ce terme et de décrire systématiquement les propriétés rattachées à ce terme par les auteurs. Méthode : Nous avons conduit une recherche systématique de la base de données PubMed de tous les articles publiés jusqu’au 9 mai 2014 en utilisant le terme de recherche « Big data ». Ces articles ont été classés en domaines d’études. Le nombre d’individus statistiques (n) et le nombre de variables (p) ont été relevés pour les articles décrivant un jeu de données. Nous avons également considéré les caractéristiques attribuées aux Big data par les auteurs. En s’appuyant sur cette analyse, une définition des Big data a été proposée. Résultats : Cent quatre-vingt-seize articles ont été inclus. Trois principales catégories d’études ont été identifiées : les spécialités « omiques », les spécialités médicales et la santé publique. Les Big data peuvent être définies comme des données avec un Log(n * p) supérieur ou égal à 7. Les propriétés des Big data sont ses grandes variétés de données et leur importante vélocité. Les Big data soulèvent des défis concernant la véracité, la gestion des données, l’extraction d’informations utiles, le partage des informations et l’existence d’experts humains ayant à la fois des compétences cliniques et analytiques. L’émergence des Big data nécessitent la création de nouvelles méthodes de calcul qui optimisent la gestion de données. Les concepts reliés sont la réutilisation des données (data reuse), la possibilité de connaissances erronées et la question de la confidentialité des données. Conclusion : Les Big data sont définies par le volume. La taille des données qui les qualifie de « Big data » va probablement augmenter avec le temps. Les Big data ne doivent pas être confondues avec le data reuse : les données peuvent être massives sans être forcément réutilisées dans un autre objectif, par exemple dans le cas des spécialités « omiques ». Inversement, des données peuvent être réutilisées sans être nécessairement de grande dimension. C’est le cas par exemple de l’utilisation secondaire du dossier patient informatisé.

@phdthesis{dumesnil_quelle_2014,
	address = {Lille ; 1969-2017, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Quelle est l’augmentation des durées de séjour liée aux hyperkaliémies: comparaison de différentes méthodes statistiques},
	shorttitle = {Quelle est l’augmentation des durées de séjour liée aux hyperkaliémies},
	abstract = {Contexte : Un épisode d’hyperkaliémie au cours d’une hospitalisation peut être considéré comme un événement indésirable et nécessite, par sa gravité potentielle, d’être pris en charge rapidement. Cet événement peut en outre allonger la durée de l’hospitalisation. Estimer l’allongement moyen des durées des séjours marqués par la survenue d’une hyperkaliémie peut néanmoins s’avérer difficile pour deux raisons : la distribution des durées de séjour ne suit pas une loi normale, et la probabilité cumulée que l’événement se produise peut augmente avec le temps. L’objectif de ce travail est de mettre en évidence que comparer simplement des durées de séjours peut amener à conclure à tort, puis d’estimer l’allongement moyen de la durée moyenne de séjour (DMS) par quelques méthodes statistiques. Méthode : Les données ont été recueillies dans le cadre du projet européen PSIP. Différentes méthodes statistiques ont été explorées : Comparaisons bivariées, méthode de simulations puis analyses multivariées. Résultats : La comparaison des durées de séjours de deux groupes de patients avec ou sans hyperkaliémie peut fréquemment amener à rejeter à tort l’hypothèse nulle H0 (=la survenue d’un événement ne modifie pas la durée du séjour), compte-tenu du fait que cet événement est temps-dépendant. Par ailleurs, la comparaison des durées de séjour par une méthode bivariée ne permet pas d’estimer l’allongement de durée de séjour imputable à l’hyperkaliémie. La différences brute de DMS selon la survenue d’au moins une hyperkaliémie est de 8,78 jours, alors que la différence estimée grâce aux simulations est de 2,28 jours. Les modèles multivariés explorés semblent surestimer l’allongement des durées de séjour liés à un tel événement. Conclusion : La comparaison des durées de séjours selon la survenue d’une hyperkaliémie à l’aide de modèles de régression semble surestimer l’allongement moyen de la durée de séjour imputable à un tel événement, même si l’ajustement sur des critères de gravité diminue un peu cette surestimation. D’autres méthodes statistiques existent mais elles sont plus complexes. D’autres événements rapportés dans le PMSI pourraient être étudiés.},
	language = {français},
	school = {Université du droit et de la santé},
	author = {Dumesnil, Chloé},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2014},
	keywords = {Durée du séjour -- Dissertation universitaire, Hospitalisation -- Thèses et écrits académiques, Hyperkaliémie -- Dissertation universitaire, Hyperkaliémie -- Thèses et écrits académiques, hyperkaliémie. durée de séjour. événement indésirable. statistique},
}

Contexte : Un épisode d’hyperkaliémie au cours d’une hospitalisation peut être considéré comme un événement indésirable et nécessite, par sa gravité potentielle, d’être pris en charge rapidement. Cet événement peut en outre allonger la durée de l’hospitalisation. Estimer l’allongement moyen des durées des séjours marqués par la survenue d’une hyperkaliémie peut néanmoins s’avérer difficile pour deux raisons : la distribution des durées de séjour ne suit pas une loi normale, et la probabilité cumulée que l’événement se produise peut augmente avec le temps. L’objectif de ce travail est de mettre en évidence que comparer simplement des durées de séjours peut amener à conclure à tort, puis d’estimer l’allongement moyen de la durée moyenne de séjour (DMS) par quelques méthodes statistiques. Méthode : Les données ont été recueillies dans le cadre du projet européen PSIP. Différentes méthodes statistiques ont été explorées : Comparaisons bivariées, méthode de simulations puis analyses multivariées. Résultats : La comparaison des durées de séjours de deux groupes de patients avec ou sans hyperkaliémie peut fréquemment amener à rejeter à tort l’hypothèse nulle H0 (=la survenue d’un événement ne modifie pas la durée du séjour), compte-tenu du fait que cet événement est temps-dépendant. Par ailleurs, la comparaison des durées de séjour par une méthode bivariée ne permet pas d’estimer l’allongement de durée de séjour imputable à l’hyperkaliémie. La différences brute de DMS selon la survenue d’au moins une hyperkaliémie est de 8,78 jours, alors que la différence estimée grâce aux simulations est de 2,28 jours. Les modèles multivariés explorés semblent surestimer l’allongement des durées de séjour liés à un tel événement. Conclusion : La comparaison des durées de séjours selon la survenue d’une hyperkaliémie à l’aide de modèles de régression semble surestimer l’allongement moyen de la durée de séjour imputable à un tel événement, même si l’ajustement sur des critères de gravité diminue un peu cette surestimation. D’autres méthodes statistiques existent mais elles sont plus complexes. D’autres événements rapportés dans le PMSI pourraient être étudiés.

@phdthesis{schaffar_etude_2013,
	address = {Lille ; 1969-2017, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Etude de la faisabilité de l'implémentation d'indicateurs automatisés de la qualité des soins},
	abstract = {Contexte : L’objectif de ce travail est d’évaluer la faisabilité de l’implémentation d’indicateurs automatisés de qualité des soins à partir des données recueillies informatiquement en routine au cours des soins hospitaliers en France. Méthode : Une revue de la littérature des indicateurs de processus valides a été réalisée sur la base de données de Pubmed. Les indicateurs de processus retrouvés ont été classés selon la spécialité médicale et selon la possibilité d’implémentation (implémentables / non-implémentables). L’automatisation du calcul des indicateurs a été testée sur un set d’indicateurs implémentables à l’aide d’une base de données test de 15000 séjours. Pour chaque indicateur et pour évaluer la validité des résultats, la Valeur Prédictive Positive (VPP) a été calculée à partir d’une revue de cas de séjours tirés au sort. Résultats: La recherche bibliographique a permis de sélectionner 126 articles sur Pubmed. Au total 440 indicateurs de processus valides ont été recueillis dans 12 spécialités. Plus de 22\% des indicateurs ont été jugés implémentables. Sur les 15000 séjours de la base test, le temps de calcul était d’environ 3 minutes et 30 secondes pour les 10 indicateurs de processus valides sélectionnés. Selon les indicateurs, le nombre de séjours inclus s’étendaient de 4 à 607. La VPP (Valeur Prédictive Positive) médiane était de 72,3\% [premier quartile – troisième quartile] [48,0-91,7]. Conclusion : L’implémentation d’indicateurs automatisés de qualité des soins à partir des données recueillies informatiquement en routine en France est faisable et rapide mais nécessite une bonne définition des critères d’inclusion et de conformité afin de minimiser le nombre de séjours faux positifs.},
	language = {français},
	school = {Université du droit et de la santé},
	author = {Schaffar, Aurélien},
	collaborator = {Ficheur, Grégoire and Chazard, Emmanuel},
	year = {2013},
	keywords = {Classification internationale des maladies -- Dissertation universitaire, Indicateurs qualité santé -- Dissertation universitaire, Maladies -- Classification -- Thèses et écrits académiques, Programme de médicalisation des systèmes d'information -- Thèses et écrits académiques, Qualité des soins de santé -- Dissertation universitaire, Soins médicaux -- Qualité -- Contrôle -- Thèses et écrits académiques},
}

Contexte : L’objectif de ce travail est d’évaluer la faisabilité de l’implémentation d’indicateurs automatisés de qualité des soins à partir des données recueillies informatiquement en routine au cours des soins hospitaliers en France. Méthode : Une revue de la littérature des indicateurs de processus valides a été réalisée sur la base de données de Pubmed. Les indicateurs de processus retrouvés ont été classés selon la spécialité médicale et selon la possibilité d’implémentation (implémentables / non-implémentables). L’automatisation du calcul des indicateurs a été testée sur un set d’indicateurs implémentables à l’aide d’une base de données test de 15000 séjours. Pour chaque indicateur et pour évaluer la validité des résultats, la Valeur Prédictive Positive (VPP) a été calculée à partir d’une revue de cas de séjours tirés au sort. Résultats: La recherche bibliographique a permis de sélectionner 126 articles sur Pubmed. Au total 440 indicateurs de processus valides ont été recueillis dans 12 spécialités. Plus de 22% des indicateurs ont été jugés implémentables. Sur les 15000 séjours de la base test, le temps de calcul était d’environ 3 minutes et 30 secondes pour les 10 indicateurs de processus valides sélectionnés. Selon les indicateurs, le nombre de séjours inclus s’étendaient de 4 à 607. La VPP (Valeur Prédictive Positive) médiane était de 72,3% [premier quartile – troisième quartile] [48,0-91,7]. Conclusion : L’implémentation d’indicateurs automatisés de qualité des soins à partir des données recueillies informatiquement en routine en France est faisable et rapide mais nécessite une bonne définition des critères d’inclusion et de conformité afin de minimiser le nombre de séjours faux positifs.

@phdthesis{mouret-kubiak_de-identification_2012,
	address = {Lille ; 1969-2017, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Dé-identification automatisée de courriers médicaux: proposition et évaluation de la méthode {FASDIM}},
	shorttitle = {Dé-identification automatisée de courriers médicaux},
	abstract = {Contexte : Les données médicales contenues dans les courriers médicaux constituent une source importante d’information pour la recherche clinique et les actions de Santé Publique. Ces données ne sont exploitables que si la vie privée du patient est respectée, ce qui peut être obtenu par la dé-identification des courriers médicaux, aussi appelée « anonymisation ». La dé-identification consiste à supprimer dans un document toutes les données directement ou indirectement nominatives permettant d’identifier une personne. Afin de traiter un grand nombre de courriers, la méthode de dé-identification doit être automatisée, cependant aucune méthode n’existe en langue française. Matériel et méthode : FASDIM est une méthode simple et rapide de dé-identification de courriers médicaux en texte libre, permettant de supprimer les données identifiantes (Protected Health Information ou "PHI"). La méthode repose sur la création d'une liste de mots autorisés, associée à la création d'une liste de motifs dans lesquels les nombres sont protégés. Ensuite, les mots non autorisés ainsi que les nombres non protégés au préalable sont supprimés du texte. Enfin, FASDIM est évalué sur trois aspects: 1) efficacité à supprimer les données identifiantes, 2) perte d'information médicale engendrée par la méthode, 3) temps de travail nécessaire à sa mise en place et sa mise à jour. Résultats : FASDIM permet de dé-identifier les courriers médicaux non structurés en langue française avec un rappel de 98,1 \% et une précision de 79,6 \%, soit une F-measure à 87,9 \%, ce qui garantit la confidentialité des documents. L’évaluation de la perte d’information montre un taux de conservation de l’information médicale de 99,02 \%. Le temps requis pour implémenter la méthode est d’une quarantaine d’heure. FASDIM est donc un outil simple, rapide à mettre en place et permettant de préserver la vie privée du patient.},
	language = {français},
	school = {Université du droit et de la santé},
	author = {Mouret-Kubiak, Capucine},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2012},
	keywords = {Confidentialité -- Dissertation universitaire, Protection de l'information (informatique) -- Thèses et écrits académiques, Secret médical -- Thèses et écrits académiques, Traitement automatique du langage naturel -- Thèses et écrits académiques, Traitement du langage naturel -- Dissertation universitaire},
}

Contexte : Les données médicales contenues dans les courriers médicaux constituent une source importante d’information pour la recherche clinique et les actions de Santé Publique. Ces données ne sont exploitables que si la vie privée du patient est respectée, ce qui peut être obtenu par la dé-identification des courriers médicaux, aussi appelée « anonymisation ». La dé-identification consiste à supprimer dans un document toutes les données directement ou indirectement nominatives permettant d’identifier une personne. Afin de traiter un grand nombre de courriers, la méthode de dé-identification doit être automatisée, cependant aucune méthode n’existe en langue française. Matériel et méthode : FASDIM est une méthode simple et rapide de dé-identification de courriers médicaux en texte libre, permettant de supprimer les données identifiantes (Protected Health Information ou "PHI"). La méthode repose sur la création d'une liste de mots autorisés, associée à la création d'une liste de motifs dans lesquels les nombres sont protégés. Ensuite, les mots non autorisés ainsi que les nombres non protégés au préalable sont supprimés du texte. Enfin, FASDIM est évalué sur trois aspects: 1) efficacité à supprimer les données identifiantes, 2) perte d'information médicale engendrée par la méthode, 3) temps de travail nécessaire à sa mise en place et sa mise à jour. Résultats : FASDIM permet de dé-identifier les courriers médicaux non structurés en langue française avec un rappel de 98,1 % et une précision de 79,6 %, soit une F-measure à 87,9 %, ce qui garantit la confidentialité des documents. L’évaluation de la perte d’information montre un taux de conservation de l’information médicale de 99,02 %. Le temps requis pour implémenter la méthode est d’une quarantaine d’heure. FASDIM est donc un outil simple, rapide à mettre en place et permettant de préserver la vie privée du patient.

@phdthesis{miquel_conception_2011,
	address = {Lille ; 1969-2017, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Conception et déploiement d'indicateurs médico-économiques dans un groupe d'hospitalisation privé},
	abstract = {INTRODUCTION : La T2A mise en place en 2005 dans le secteur privé a conduit les établissements de santé MCO à modifier leurs outils de pilotage. Les indicateurs d’activités internes sont devenus pour partie obsolètes et les indicateurs produits par l’ATIH ne répondaient pas aux exigences d’opérationnalité. MATERIEL ET METHODES : La région nord GDS s’appuie sur un réseau et une architecture informatique permettant de collecter les données d’activité. Les données sont ensuite structurées pour permettre leur mise en tableau de bord et leur analyse statistiques. RESULTATS : Des indicateurs descriptifs d’activités et de consommations de soins ont été développés et mis en production. Les tableaux de bord sont diffusés vers les directions d’établissement et les soignants. Afin de faire évoluer la description statistique des données, on propose d’étudier les durées de séjours selon un modèle Cox. Les méthodes de data mining sont ensuite appliquées sur des données recueillies a priori des hospitalisations dans le cadre de la chirurgie des hernies inguinales pour identifier les facteurs en relation avec une durée de séjour allongée. Il est ainsi identifié six sous-groupes de patients pour lesquels on estime une durée de séjours allant de 1,26 à 5,44 jours. DISCUSSION : On entrevoie au travers de la multiplication des données dans le domaine de la santé que la simple juxtaposition d’indicateurs descriptifs ne permettra pas de maximiser l’efficience dans l’organisation des établissements de santé. Il faut donc orienter les analyses d’activités vers des méthodes statistiques et y intégrer des indicateurs de qualité de prise en charge.},
	language = {français},
	school = {Université du droit et de la santé},
	author = {Miquel, Pierre-Henry},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2011},
	keywords = {Analyse des données -- Thèses et écrits académiques, Durée du séjour -- Dissertation universitaire, Hôpitaux -- Administration -- Thèses et écrits académiques, Hôpitaux privés -- Dissertation universitaire, Hôpitaux privés -- Thèses et écrits académiques, Interprétation statistique de données -- Dissertation universitaire, Programme de médicalisation des systèmes d'information -- Thèses et écrits académiques, Programmes de gestion intégrée des soins de santé -- Dissertation universitaire},
}

INTRODUCTION : La T2A mise en place en 2005 dans le secteur privé a conduit les établissements de santé MCO à modifier leurs outils de pilotage. Les indicateurs d’activités internes sont devenus pour partie obsolètes et les indicateurs produits par l’ATIH ne répondaient pas aux exigences d’opérationnalité. MATERIEL ET METHODES : La région nord GDS s’appuie sur un réseau et une architecture informatique permettant de collecter les données d’activité. Les données sont ensuite structurées pour permettre leur mise en tableau de bord et leur analyse statistiques. RESULTATS : Des indicateurs descriptifs d’activités et de consommations de soins ont été développés et mis en production. Les tableaux de bord sont diffusés vers les directions d’établissement et les soignants. Afin de faire évoluer la description statistique des données, on propose d’étudier les durées de séjours selon un modèle Cox. Les méthodes de data mining sont ensuite appliquées sur des données recueillies a priori des hospitalisations dans le cadre de la chirurgie des hernies inguinales pour identifier les facteurs en relation avec une durée de séjour allongée. Il est ainsi identifié six sous-groupes de patients pour lesquels on estime une durée de séjours allant de 1,26 à 5,44 jours. DISCUSSION : On entrevoie au travers de la multiplication des données dans le domaine de la santé que la simple juxtaposition d’indicateurs descriptifs ne permettra pas de maximiser l’efficience dans l’organisation des établissements de santé. Il faut donc orienter les analyses d’activités vers des méthodes statistiques et y intégrer des indicateurs de qualité de prise en charge.

@phdthesis{ficheur_detection_2010,
	address = {Lille, France},
	type = {Thèse d'exercice {Médecine}},
	title = {Détection automatisée d'effets indésirables médicamenteux dans des contextes hospitaliers variables},
	language = {FR},
	school = {Université de Lille},
	author = {Ficheur, Grégoire},
	month = jan,
	year = {2010},
}

@phdthesis{genty_detection_2010,
	address = {Lille ; 1969-2017, France},
	type = {Thèse d'exercice},
	title = {Détection automatisée des effets indésirables médicamenteux: revue et validation des cas détectés},
	shorttitle = {Détection automatisée des effets indésirables médicamenteux},
	abstract = {INTRODUCTION : Les EIM répondent à des définitions variables selon les auteurs. Plusieurs classifications de ces effets existent. Les méthodes habituelles de détection sont les systèmes de reporting, l’analyse du langage naturel, les revues expertes de dossiers et les techniques de datamining sur des rapports d’EIM. Le projet PSIP avait pour vocation de proposer une nouvelle approche basée sur la fouille statistique semi-automatisée de données hospitalières. Dans ce contexte s’imposait le besoin d’un outil permettant de valider les cas détectés. MATÉRIEL ET MÉTHODE : En utilisant les données du CH de Denain, un formulaire multilingue de revue des cas a été designé et articulé avec les outils web utilisés dans le cadre du projet PSIP, Expert Explorer et les Scorecards. RÉSULTATS : Mon travail a consisté à développer une application en PHP, montée sur un serveur et interfacée avec une base de données. L’application fonctionne et est utilisée. Concernant la validation, l’effet annoncé est réellement présent dans 78\% des cas. Dans 47\% des cas, la participation d’au moins une des causes des règles à l’effet est jugée fortement probable, avec des valeurs atteignant 73\% pour l’hyperkaliémie, 62\% pour la prescription d’antibiotiques et 56\% pour les élévations de l’INR. DISCUSSION : Le projet PSIP contribue à une amélioration des méthodes de détection des EIM. Ses atouts sont l’utilisation de sources de données automatisées, un formalisme souple permettant une détection tant rétrospective que prospective, la découverte de nouvelles connaissances et règles sur les EIM, la contextualisation des règles à leur lieu d’application, la prise en compte du facteur temporel. Les valeurs de VPP obtenues sont parmi les meilleures retrouvées dans la littérature.},
	language = {français},
	school = {Université du droit et de la santé},
	author = {Genty, Matthieu},
	collaborator = {Chazard, Emmanuel},
	year = {2010},
	keywords = {Effets secondaires indésirables des médicaments -- diagnostic -- Dissertation universitaire, Médicaments -- Effets secondaires -- Diagnostic -- Thèses et écrits académiques, Préparations pharmaceutiques -- effets indésirables -- Dissertation universitaire, Techniques et procédures diagnostiques -- Dissertation universitaire},
}

INTRODUCTION : Les EIM répondent à des définitions variables selon les auteurs. Plusieurs classifications de ces effets existent. Les méthodes habituelles de détection sont les systèmes de reporting, l’analyse du langage naturel, les revues expertes de dossiers et les techniques de datamining sur des rapports d’EIM. Le projet PSIP avait pour vocation de proposer une nouvelle approche basée sur la fouille statistique semi-automatisée de données hospitalières. Dans ce contexte s’imposait le besoin d’un outil permettant de valider les cas détectés. MATÉRIEL ET MÉTHODE : En utilisant les données du CH de Denain, un formulaire multilingue de revue des cas a été designé et articulé avec les outils web utilisés dans le cadre du projet PSIP, Expert Explorer et les Scorecards. RÉSULTATS : Mon travail a consisté à développer une application en PHP, montée sur un serveur et interfacée avec une base de données. L’application fonctionne et est utilisée. Concernant la validation, l’effet annoncé est réellement présent dans 78% des cas. Dans 47% des cas, la participation d’au moins une des causes des règles à l’effet est jugée fortement probable, avec des valeurs atteignant 73% pour l’hyperkaliémie, 62% pour la prescription d’antibiotiques et 56% pour les élévations de l’INR. DISCUSSION : Le projet PSIP contribue à une amélioration des méthodes de détection des EIM. Ses atouts sont l’utilisation de sources de données automatisées, un formalisme souple permettant une détection tant rétrospective que prospective, la découverte de nouvelles connaissances et règles sur les EIM, la contextualisation des règles à leur lieu d’application, la prise en compte du facteur temporel. Les valeurs de VPP obtenues sont parmi les meilleures retrouvées dans la littérature.